Exploring mechanisms of gene repression and escape during X-chromosome inactivation

Información del proyecto

XPRESS

Identificador del acuerdo de subvención: 671027

DOI

10.3030/671027

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 23 Septiembre 2015

Fecha de inicio 1 Noviembre 2015

Fecha de finalización 30 Abril 2021

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 312 500,00

Aportación de la UE

€ 2 312 500,00

Coordinado por

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Germany

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Publicaciones

Peer reviewed articles (16)

The Molecular and Nuclear Dynamics of X-Chromosome Inactivation

Autores: François Dossin, Edith Heard
Publicado en: Cold Spring Harbor Perspectives in Biology, 2021, Página(s) a040196, ISSN 1943-0264
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/cshperspect.a040196

Parental-to-embryo switch of chromosome organization in early embryogenesis

Autores: Samuel Collombet, Noémie Ranisavljevic, Takashi Nagano, Csilla Varnai, Tarak Shisode, Wing Leung, Tristan Piolot, Rafael Galupa, Maud Borensztein, Nicolas Servant, Peter Fraser, Katia Ancelin, Edith Heard
Publicado en: Nature, Edición 580/7801, 2020, Página(s) 142-146, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-2125-z

The Implication of Early Chromatin Changes in X Chromosome Inactivation

Autores: Jan Jakub Żylicz, Aurélie Bousard, Kristina Žumer, Francois Dossin, Eusra Mohammad, Simão Teixeira da Rocha, Björn Schwalb, Laurène Syx, Florent Dingli, Damarys Loew, Patrick Cramer, Edith Heard
Publicado en: Cell, Edición 176/1-2, 2019, Página(s) 182-197.e23, ISSN 0092-8674
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2018.11.041

H4K20me1 and H3K27me3 are concurrently loaded onto the inactive X chromosome but dispensable for inducing gene silencing

Autores: Sjoerd J D Tjalsma, Mayako Hori, Yuko Sato, Aurelie Bousard, Akito Ohi, Ana Cláudia Raposo, Julia Roensch, Agnes Le Saux, Jumpei Nogami, Kazumitsu Maehara, Tomoya Kujirai, Tetsuya Handa, Sandra Bagés‐Arnal, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka, Simão Teixeira da Rocha, Jan J Żylicz, Hiroshi Kimura, Edith Heard
Publicado en: EMBO reports, Edición 22/3, 2021, ISSN 1469-221X
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.202051989

Locus specific epigenetic modalities of random allelic expression imbalance

Autores: Lucile Marion-Poll, Benjamin Forêt, Dina Zielinski, Florian Massip, Mikael Attia, Ava C. Carter, Laurène Syx, Howard Y. Chang, Anne-Valerie Gendrel, Edith Heard
Publicado en: Nature Communications, Edición 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-25630-3

X chromosome inactivation: new players in the initiation of gene silencing

Autores: Ines Pinheiro, Edith Heard
Publicado en: F1000Research, Edición 6, 2017, Página(s) 344, ISSN 2046-1402
Editor: F1000 Research Ltd.
DOI: 10.12688/f1000research.10707.1

Topologically Associating Domains in Chromosome Architecture and Gene Regulatory Landscapes during Development, Disease, and Evolution

Autores: Rafael Galupa, Edith Heard
Publicado en: Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology, Edición 82, 2017, Página(s) 267-278, ISSN 0091-7451
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/sqb.2017.82.035030

Closing the loop: 3C versus DNA FISH

Autores: Luca Giorgetti, Edith Heard
Publicado en: Genome Biology, Edición 17/1, 2016, ISSN 1474-760X
Editor: biomedcentral
DOI: 10.1186/s13059-016-1081-2

Structural organization of the inactive X chromosome in the mouse

Autores: Luca Giorgetti, Bryan R. Lajoie, Ava C. Carter, Mikael Attia, Ye Zhan, Jin Xu, Chong Jian Chen, Noam Kaplan, Howard Y. Chang, Edith Heard, Job Dekker
Publicado en: Nature, Edición 535/7613, 2016, Página(s) 575-579, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nature18589

Novel players in X inactivation: insights into Xist-mediated gene silencing and chromosome conformation

Autores: Simão T da Rocha, Edith Heard
Publicado en: Nature Structural & Molecular Biology, Edición 24/3, 2017, Página(s) 197-204, ISSN 1545-9993
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nsmb.3370

SPEN integrates transcriptional and epigenetic control of X-inactivation

Autores: François Dossin, Inês Pinheiro, Jan J. Żylicz, Julia Roensch, Samuel Collombet, Agnès Le Saux, Tomasz Chelmicki, Mikaël Attia, Varun Kapoor, Ye Zhan, Florent Dingli, Damarys Loew, Thomas Mercher, Job Dekker, Edith Heard
Publicado en: Nature, Edición 578/7795, 2020, Página(s) 455-460, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-1974-9

The role of Xist ‐mediated Polycomb recruitment in the initiation of X‐chromosome inactivation

Autores: Aurélie Bousard, Ana Cláudia Raposo, Jan Jakub Żylicz, Christel Picard, Vanessa Borges Pires, Yanyan Qi, Cláudia Gil, Laurène Syx, Howard Y Chang, Edith Heard, Simão Teixeira da Rocha
Publicado en: EMBO reports, Edición 20/10, 2019, ISSN 1469-221X
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.201948019

Kinetics of Xist -induced gene silencing can be predicted from combinations of epigenetic and genomic features

Autores: Lisa Barros de Andrade e Sousa, Iris Jonkers, Laurène Syx, Ilona Dunkel, Julie Chaumeil, Christel Picard, Benjamin Foret, Chong-Jian Chen, John T. Lis, Edith Heard, Edda G. Schulz, Annalisa Marsico
Publicado en: Genome Research, Edición 29/7, 2019, Página(s) 1087-1099, ISSN 1088-9051
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.245027.118

In-cell identification and measurement of RNA-protein interactions

Autores: Antoine Graindorge, Inês Pinheiro, Anna Nawrocka, Allison C. Mallory, Peter Tsvetkov, Noa Gil, Carlo Carolis, Frank Buchholz, Igor Ulitsky, Edith Heard, Mikko Taipale, Alena Shkumatava
Publicado en: Nature Communications, Edición 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-13235-w

Molecular Mechanisms of Facultative Heterochromatin Formation: An X-Chromosome Perspective

Autores: Jan J. Żylicz, Edith Heard
Publicado en: Annual Review of Biochemistry, Edición 89/1, 2020, Página(s) 255-282, ISSN 0066-4154
Editor: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-biochem-062917-012655

A Conserved Noncoding Locus Regulates Random Monoallelic Xist Expression across a Topological Boundary

Autores: Rafael Galupa, Elphège Pierre Nora, Rebecca Worsley-Hunt, Christel Picard, Chris Gard, Joke Gerarda van Bemmel, Nicolas Servant, Yinxiu Zhan, Fatima El Marjou, Colin Johanneau, Patricia Diabangouaya, Agnès Le Saux, Sonia Lameiras, Juliana Pipoli da Fonseca, Friedemann Loos, Joost Gribnau, Sylvain Baulande, Uwe Ohler, Luca Giorgetti, Edith Heard
Publicado en: Molecular Cell, Edición 77/2, 2020, Página(s) 352-367.e8, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.10.030