Objectif
Gene expression is a highly dynamic and inherently variable process. Yet, it needs to be tightly regulated, especially during the cell cycle, when continuous large-scale changes occur to the proteome. Even small deviations in the expression levels of a single protein in individual cells can de-regulate cell cycle entry and promote tumorigenesis. Here, I will develop new technology to study gene expression dynamics in single cells to uncover how active regulation and stochastic variability shape the expression of key cell cycle genes and ensure reliable cell cycle-entry decisions.
I recently developed a protein multimerization system, called SunTag, which allows very bright fluorescence imaging, as well as manipulation of transcription. To understand how accurate expression levels of a core set of cell cycle proteins are achieved, I will combine single-cell RNA sequencing with SunTag fluorescence imaging technology to visualize, with single molecule sensitivity, the rates of transcription, translation and mRNA degradation. These analyses will identify the contribution of each type of regulation to accurate gene expression, and will reveal how active regulation ensures correct cell cycle decisions in the presence of stochastic expression variability. Furthermore, I will develop new methodology to specifically perturb the different types of gene expression control during defined cell cycle stages. This will enable an unprecedented ability to interrogate the function of gene expression control for cell cycle entry, and will identify the genes for which tight control of expression is critical for correct cell cycle decisions. Together, this approach will:
1) Uncover how individual regulatory mechanisms (e.g. regulation of transcription, translation or mRNA degradation) contribute to accurate cell cycle entry through gene expression control of key cell cycle proteins
2) Examine how stochastic variability in gene expression influences the decision to enter the cell cycle
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences médicales et de la santé médecine clinique allergologie allergie aux médicaments
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN transcriptomes
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-STG - Starting Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2015-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1011 JV AMSTERDAM
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.