Objectif
Retrotransposons (RTNs) are ancient viruses that have stably integrated themselves into mammalian genomes and they now occupy around half of the human or mouse genome. These mobile genetic elements that have coevolved with us drive evolution by creating new genes and plasticity of genomes. Exciting data including ours has shown that even RTNs that are no longer active retain enhancer, promoter or repressor sequences that regulate developmental genes, through largely uncharacterized transcription factors. We have employed CRISPR/Cas9 gene disruption to determine that Zfp37 and Zfp819 bind to and regulate RTNs in mouse embryonic stem cells (ESCs). Identification of these zinc finger proteins (ZFPs) now allows us to ask new questions about how RTNs have been co-opted to orchestrate gene circuits in vitro and in vivo. Both these factors have already been implicated to play a role in reprogramming or genome integrity.
We hypothesize that RTNs have been co-opted to remodel the genome by acting as structural platforms that recruit transcription factors like Zfp37 and Zfp819. We will test this hypothesis assessing the role of RTNs and these two ZFPs in three dynamic contexts where the genome is remodelled. These are in ESC differentiation to neurons, in reprogramming and in early mouse development, three scenarios where RTNs have been documented to become expressed and serve an unknown function.
This work will exploit mouse development to unravel the mechanism of how RTNs remodel the genome. It will help us to understand how ZFPs can be engaged to reprogram cells and in stem-cell therapies, and will explain more broadly how RTNs, which dominate our genomes, control cell fate.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-STG - Starting Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2015-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
E1 4NS LONDON
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.