Descripción del proyecto
Análisis de la regulación de la expresión génica
Las células regulan en gran medida la expresión génica en el tiempo y el espacio para garantizar que se produzcan las proteínas correctas cuando y donde se necesitan. La regulación de la expresión génica es un proceso complejo que implica una interacción multipartita de elementos reguladores, como factores de transcripción, modificaciones epigenéticas y ARN (o RNA, en inglés) no codificantes. El equipo del proyecto moreRNA, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, se centrará en la maduración de los microARN y el efecto de los eventos directos de metilación del ARN en la expresión génica. Los investigadores emplearán técnicas de biología molecular y celular para analizar el papel de la vía de la metilación en la regulación de los ARN codificantes y no codificantes. En conjunto, en el proyecto se aportará información sobre factores de expresión génica y vías reguladoras hasta ahora desconocidos.
Objetivo
Coding and non-coding RNAs are regulated at numerous levels. For example, microRNA (miRNA) expression can be influenced at various steps of biosynthesis. Furthermore, it has been reported that direct RNA methylation events can also affect gene expression in many different organisms and systems. The aim of this project is to identify and characterize factors that affect the maturation of miRNAs. We will employ biochemical pull down assays to isolate specific binding partners of different miRNA species. We will analyze the physiological role of these factors using molecular or cell biological approaches. Molecular details of pre-miRNA-protein interactions will be investigated by x-ray crystallography. In addition, we will decipher the role of the m6A methylation pathway on the regulation of coding and non-coding RNAs. Writers, readers and erasers of this modification have been identified. However, not much is known about the composition of specific protein complexes as well as the atomic structure of these factors. Thus, we will functionally and structurally characterize known and putative novel factors of the m6A methylation pathway in human cells. Furthermore, using our biochemical pull down approach employed for the identification of pre-miRNA processing factors, we will identify reader proteins of several types of RNA modification that have not been investigated so far. The proposed project will elucidate the regulation of gene expression by small RNAs or direct RNA methylation and will add so far unknown components to these important regulatory pathways.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Programa(s)
Régimen de financiación
ERC-COG - Consolidator GrantInstitución de acogida
93053 Regensburg
Alemania