Genetic Determinants of the Epigenome

Informations projet

Gen-Epix

N° de convention de subvention: 694295

DOI

10.3030/694295

Projet clôturé

Date de signature de la CE 30 Mai 2016

Date de début 1 Juin 2016

Date de fin 30 Juin 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 499 717,00

Contribution de l’UE

€ 2 499 717,00

Coordonné par

THE UNIVERSITY OF EDINBURGH
United Kingdom

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Publications

Peer reviewed articles (14)

Convergent cerebrosespinal fluid proteomes and metabolic ontologies in humans and animal models of Rett Syndrome

Auteurs: Bird, Adrian
Publié dans: iScience 25; doi: https://doi.org/10.1016/j.isci.2022.104966, 2022, ISSN 2589-0042
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1101/2022.06.14.495968

Comparative analysis of potential broad-spectrum neuronal Cre drivers

Auteurs: Paton KM, Selfridge J, Guy J and Bird A
Publié dans: Wellcome Open Research, Numéro Wellcome Open Res 2022, 7:185, 2022, ISSN 2398-502X
Éditeur: Wellcome Open Research
DOI: 10.12688/wellcomeopenres.17965.1

The Molecular Basis of MeCP2 Function in the Brain

Auteurs: Tillotson, R., Bird, A.
Publié dans: J Mol Biol, 2019, ISSN 0022-2836
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2019.10.004

Quantitative analysis questions the role of MeCP2 as a global regulator of alternative splicing.

Auteurs: Kashyap Chhatbar; Justyna Cholewa-Waclaw; Ruth Shah; Adrian Bird; Guido Sanguinetti; Guido Sanguinetti
Publié dans: PLoS Genetics, Numéro 2, 2020, ISSN 1553-7390
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1009087

Genetic therapies for neurological disorders

Auteurs: FitzPatrick, L., Bird, A.
Publié dans: Hum Genet, 2022, ISSN 0340-6717
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00439-021-02399-5

Absence of MeCP2 binding to non-methylated GT-rich sequences in vivo

Auteurs: John C. Connelly; Justyna Cholewa-Waclaw; Shaun Webb; Verdiana Steccanella; Bartlomiej Waclaw; Adrian Bird
Publié dans: Connelly , J C , Cholewa-waclaw , J , Webb , S , Steccanella , V , Waclaw , B & Bird , A 2020 , ' Absence of MeCP2 binding to non-methylated GT-rich sequences in vivo ' , Nucleic Acids Research . https://doi.org/10.1093/nar/gkaa102, Numéro 1, 2020, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa102

CDKL5 deficiency disorder: a pathophysiology of neural maintenance

Auteurs: Kind P., Bird, A
Publié dans: J Clin Invest, 2021, ISSN 0021-9738
Éditeur: American Society for Clinical Investigation
DOI: 10.1172/jci153606

Genetic determinants of the epigenome in development and cancer

Auteurs: Bird, Adrian
Publié dans: Swiss Medical Weekly, Numéro 147/4142, 2017, Page(s) 1-6, ISSN 1424-7860
Éditeur: EMH Swiss Medical Publishers Ltd
DOI: 10.4414/smw.2017.14523

The Selfishness of Law-Abiding Genes

Auteurs: Adrian Bird
Publié dans: Trends in Genetics, Numéro 36/1, 2020, Page(s) 8-13, ISSN 0168-9525
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tig.2019.10.002

DNA Methylation: Mega-Year Inheritance with the Help of Darwin

Auteurs: Bird, A.
Publié dans: Curr Biol, 2020, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2020.02.034

Neuronal non-CG methylation is an essential target for MeCP2 function

Auteurs: Tillotson, R., Cholewa-Waclaw, J., Chhatbar, K., Connelly, J. C., Kirschner, S. A., Webb, S., Koerner, M. V., Selfridge, J., Kelly, D.A., De Sousa, D., Brown, K., Lyst, M.J., Kriaucionis, S., Bird, A.
Publié dans: Mol Cell, 2021, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.01.011

SALL4 controls cell fate in response to DNA base composition

Auteurs: Pantier, R., Chhatbar, K., Quante, T., Skourti-Stathaki, K., Cholewa-Waclaw, J., Alston, G. Alexander-Howden, B., Lee, H. Y., Cook, A. G., Spruijt, C. G., Vermeulen, M., Selfridge, J., Bird, A.
Publié dans: Mol Cell, 2021, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.11.046

Evaluation of CA repeat arrays as targets for MeCP2 function in the brain

Auteurs: Chhatbar, K., Bird, A.
Publié dans: bioRxiv 2022.04.26.489598, 2022, ISSN 2575-1077
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2022.04.26.489598

High-throughput sequencing SELEX for the determination of DNA-binding protein specificities in vitro

Auteurs: Raphaël Pantier; Kashyap Chhatbar; Grace Alston; Heng Yang Lee; Adrian Bird
Publié dans: Pantier , R , Chhatbar , K , Alston , G , Lee , H Y & Bird , A 2022 , ' High-throughput sequencing SELEX for the determination of DNA-binding protein specificities in vitro ' , Star Protocols , vol. 3 , no. 3 , 101490 . https://doi.org/10.1016/j.xpro.2022.101490, Numéro 2, 2021, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.xpro.2022.101490