Signal Integration by Gene Regulatory Landscapes

Informations projet

INTEGRAL

N° de convention de subvention: 695032

DOI

10.3030/695032

Projet clôturé

Date de signature de la CE 12 Juillet 2016

Date de début 1 Août 2016

Date de fin 31 Janvier 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 499 500,00

Contribution de l’UE

€ 2 499 500,00

Coordonné par

UNIVERSITAT BASEL
Switzerland

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Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Thesis and dissertations (2)

The Gremlin1 cis-Regulatory Landscape: A Paradigm to Study Enhancer Cooperation in Regulation of Transcription Dynamics

Auteurs: Laurène Ramos Martins
Publié dans: 2020
Éditeur: University of Basel

cis-Regulation of Gremlin1 Expression during MouseLimb Bud Development and its Diversification during Vertebrate Evolution

Auteurs: Jonas Malkmus
Publié dans: 2022
Éditeur: University of Basel

Book chapters (1)

Dynamic and self-regulatory interactions among gene regulatory networks control vertebrate limb bud morphogenesis (review)

Auteurs: Aimee Zuniga, Rolf Zeller
Publié dans: Current Topics in Developmental Biology, Numéro 139, 2020, Page(s) 61-87, ISSN 0070-2153
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/bs.ctdb.2020.02.005

Peer reviewed articles (6)

HOX13-dependent chromatin accessibility modulates the target repertoires of the HOX factors

Auteurs: Ines Desanlis; Yacine Kherdjemil; Alexandre Mayran; Bouklouch Y; Claudia Gentile; Rushikesh Sheth; Rolf Zeller; Jacques Drouin; Marie Kmita; Marie Kmita
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11: 2491, 2020, Page(s) 1-10, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/789875

SMAD4 target genes are part of a transcriptional network that integrates the response to BMP and SHH signaling during early limb bud patterning

Auteurs: Julie Gamart, Iros Barozzi, Frédéric Laurent, Robert Reinhardt, Laurene Ramos Martins, Thomas Oberholzer, Axel Visel, Rolf Zeller, Aimée Zuniga
Publié dans: Development, Numéro 148, 2021, Page(s) 1-24 (online, ISSN 1477-9129
Éditeur: The Company of Biologists
DOI: 10.1242/dev.200182

Conserved and species-specific chromatin remodeling and regulatory dynamics during mouse and chicken limb bud development

Auteurs: Shalu Jhanwar, Jonas Malkmus, Jens Stolte, Olga Romashkina, Aimée Zuniga, Rolf Zeller
Publié dans: Nature Communications, Numéro 12:5685, 2021, Page(s) 1-17 (online), ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-25935-3

Molecular signatures identify immature mesenchymal progenitors in early mouse limb buds that respond differentially to morphogen signaling

Auteurs: Robert Reinhardt, Fabiana Gullotta, Gretel Nusspaumer, Erkan Ünal, Robert Ivanek, Aimée Zuniga, Rolf Zeller
Publié dans: Development, Numéro 146/10, 2019, Page(s) dev173328, ISSN 0950-1991
Éditeur: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/dev.173328

Gene Regulatory and Expression Differences between Mouse and Pig Limb Buds Provide Insights into the Evolutionary Emergence of Artiodactyl Traits

Auteurs: Virginie Tissières, Florian Geier, Barbara Kessler, Eckhard Wolf, Rolf Zeller, Javier Lopez-Rios
Publié dans: Cell Reports, Numéro 31/1, 2020, Page(s) 107490, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2020.03.054

Spatial regulation by multiple Gremlin1 enhancers provides digit development with cis-regulatory robustness and evolutionary plasticity

Auteurs: Jonas Malkmus, Laurène Ramos Martins, Shalu Jhanwar, Bonnie Kircher, Victorio Palacio, Rushikesh Sheth, Francisca Leal, Amandine Duchesne, Javier Lopez-Rios, Kevin A. Peterson, Robert Reinhardt, Koh Onimaru, Martin J. Cohn, Aimée Zuniga, Rolf Zeller
Publié dans: Nature Communications, Numéro 12:5557, 2021, Page(s) 1-17 (online), ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-25810-1