Objectif
Understanding pathogen evolution is key to predicting and managing disease emergence. While theory predicts that strong immune responses will generally select for increased pathogen virulence, current work mostly ignores the effect of immune-suppressed hosts on virulence evolution and on pathogen adaptation to novel hosts during disease spread. Further, the underlying genetic basis of the evolutionary change, that is, the genomic targets of selection, is seldom detected. I will apply a novel experimental approach by evolving the viral pathogen Drosophila C Virus (DCV) in its natural host Drosophila melanogaster, using host lines that are either immune-competent or immune-compromised due to the inactivation of specific immune genes. In addition to assessing changes in the evolution of virulence in these host lines (i.e. viral growth rate and host mortality), I will also take an evolve-and-resequence approach, using ultra-deep sequencing of the viral populations during experimental evolution. Using these uniquely detailed sequence data I will (i) identify the region of the viral genome under selection, (ii) determine if rapid virus adaptation is dependent on the fixation of new mutations or changes in viral variant frequencies from standing genetic variation and (iii) measure the rate of repeatability of pathogen adaptation in identical selective regimes. This work will test the role of immune-compromised hosts on the evolution of pathogen virulence, and also dissect the mechanisms that underpin pathogen evolution during adaptation to hosts with variable immune responses.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences médicales et de la santé médecine clinique gastroentérologie maladie inflammatoire chronique de l’intestin
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation mutation de virus
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé nutrition
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2015
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
EH8 9YL Edinburgh
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.