Objetivo
Sex chromosomes often show extensive areas of suppressed recombination and cytological differentiation, a well-documented phenomenon in animals and plants. Lack of recombination is expected to limit the efficacy of natural selection, leading to degeneration in gene content. Similarly, fungal mating-type chromosomes, which are responsible for controlling compatibility during mating, can display patterns of suppressed recombination encompassing up to 90% of the chromosome length. The mechanisms responsible for lack of recombination and consequent degeneration remain unclear.
Here, I propose to use comparative genomics to investigate the patterns and underlying mechanisms involved in recombination suppression and genomic degeneration in Microbotryum, a model fungal system with a range of dimorphic mating-type chromosomes. I will complement the currently available high-quality genome assemblies for twenty species in the genus with three outgroups, which will allow to polarize all genomic data. I will then use the genomic dataset to: 1) test hypotheses on the origin of recombination suppression in fungal mating-type chromosomes; 2) study the evolution of non-recombining regions in fungal mating-type chromosomes, e.g. their size and age, and the existence of evolutionary strata; and 3) study the patterns and mechanisms of genomic degeneration in non-recombining regions, namely non-synonymous substitution accumulation, transposable elements, disrupted genes, and non-optimal codon usage.
Results will not only shed light on the origins and consequences of suppressed recombination and genome degradation in fungal mating-type chromosomes, but will also yield unprecedented insights into the dynamics of sexual reproduction in eukaryotes and contribute for a unified view of the evolution of dimorphic chromosomes.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas morfología biológica morfología comparativa
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología micología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética cromosoma
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2015
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
91190 GIF-SUR-YVETTE
Francia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.