Objetivo
In this proposal we aim to expose and characterize members of the human-associated microbial dark matter and exploit the novel information to dramatically enhance the resolution of metagenomic profiling and develop accurate predictive/diagnostic tools.
As a first step we will discover currently uncharacterized human microbiome members from metagenomic data through novel application of assembly-based approaches on a large compendium of newly generated and available shotgun metagenomes (Aim 1). The new identified genomes will be phylogenetically and taxonomically characterized and investigated to track strain-level individual and temporal genetic variability (Aim 2). The new genomes will be then used to develop a next generation host condition prediction approach through a genome-level machine learning tool (Aim 3).
The three main objectives of the proposal are functional to the characterization of microbial dark matter from human microbiome and its use for strain-level microbiology tasks and metagenomic prediction/association tools. DiMeTrack focuses specifically on shotgun metagenomics and tracking across time and individual on many samples from publicly available databases and generated at the host laboratory. By discovering previously uncharacterized microorganisms and unravelling their roles in specific biological phenomena (e.g. mother-to-neonate transmission) and association with disease states, we fulfil the Horizon 2020 policies in supporting research and innovation that improve our understanding of the causes and mechanisms underlying healthy and diseased people and improve our ability to monitor and detect diseases.
The profile and the future research plan of the applicant fits well with these research areas. In addition, after working in United States for a few years, he wants to be reintegrated in a research position in EU.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: https://op.europa.eu/es/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: https://op.europa.eu/es/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- ciencias naturales ciencias físicas astronomía astrofísica materia oscura
- ciencias naturales ciencias biológicas ecología ecosistemas
- ciencias naturales informática y ciencias de la información inteligencia artificial aprendizaje automático
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma genoma eucariota
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panel
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2015
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
38122 Trento
Italia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.