The chemistry and physics of RNP granules: how they form, age and cause disease

Informations projet

PhaseAge

N° de convention de subvention: 725836

DOI

10.3030/725836

Projet clôturé

Date de signature de la CE 17 Mars 2017

Date de début 1 Avril 2017

Date de fin 31 Mars 2024

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 931 303,00

Contribution de l’UE

€ 1 931 303,00

Coordonné par

TECHNISCHE UNIVERSITAET DRESDEN
Germany

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Publications

Peer reviewed articles (22)

Condensation of Ded1p Promotes a Translational Switch from Housekeeping to Stress Protein Production

Auteurs: Christiane Iserman, Christine Desroches Altamirano, Ceciel Jegers, Ulrike Friedrich, Taraneh Zarin, Anatol W. Fritsch, Matthäus Mittasch, Antonio Domingues, Lena Hersemann, Marcus Jahnel, Doris Richter, Ulf-Peter Guenther, Matthias W. Hentze, Alan M. Moses, Anthony A. Hyman, Günter Kramer, Moritz Kreysing, Titus M. Franzmann, Simon Alberti
Publié dans: Cell, Numéro 181/4, 2020, Page(s) 818-831.e19, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2020.04.009

Protein products of nonstop mRNA disrupt nucleolar homeostasis

Auteurs: Zoe H Davis, Laura Mediani, Francesco Antoniani, Jonathan Vinet, Shuangxi Li, Simon Alberti, Bingwei Lu, Alex S Holehouse, Serena Carra, Onn Brandman
Publié dans: Cell Stress and Chaperones, Numéro 26, 2021, Page(s) 549–561 (2021), ISSN 1466-1268
Éditeur: Springer Netherlands
DOI: 10.1007/s12192-021-01200-w

eIF4F is a thermo-sensing regulatory node in the translational heat shock response

Auteurs: Christine Desroches Altamirano , Moo-Koo Kang , Mareike A Jordan , Tom Borianne , Irem Dilmen , Maren Gnädig , Alexander von Appen , Alf Honigmann , Titus M Franzmann , Simon Alberti
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 2024 Mar 19, 2024, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2024.02.038

Human Small Heat Shock Protein B8 Inhibits Protein Aggregation without Affecting the Native Folding Process

Auteurs: Choudhary, Dhawal; Mediani, Laura; Avellaneda, Mario J; Bjarnason, Sveinn; Alberti, Simon; Boczek, Edgar E; Heidarsson, Pétur O; Mossa, Alessandro; Carra, Serena; Tans, Sander J; Cecconi, Ciro
Publié dans: Journal of the American Chemical Society (Online) 145 (2023), Numéro 28, 2023, Page(s) 15188–15196, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.3c02022

PARP1-DNA co-condensation drives DNA repair site assembly to prevent disjunction of broken DNA ends

Auteurs: Nagaraja Chappidi, Thomas Quail, Simon Doll, Laura T Vogel, Radoslav Aleksandrov, Suren Felekyan, Ralf Kühnemuth, Stoyno Stoynov, Claus A M Seidel, Jan Brugués, Marcus Jahnel, Titus M Franzmann, Simon Alberti
Publié dans: Cell, Numéro Volume 187, Numéro 4, 2024, Page(s) 945-961, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2024.01.015

Biomolecular condensates at the nexus of cellular stress, protein aggregation disease and ageing

Auteurs: Simon Alberti, Anthony A Hyman
Publié dans: Nature Reviews and molecular cell biology, Numéro 22 (3), 2021, Page(s) 196–213, ISSN 1759-5029
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41580-020-00326-6

Protein phase separation and its role in tumorigenesis

Auteurs: Shan Jiang, Johan Bourghardt Fagman, Changyan Chen, Simon Alberti, Beidong Liu
Publié dans: eLife, Numéro 9, 2020, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.60264

CAPRIN1 P512L causes aberrant protein aggregation and associates with early-onset ataxia

Auteurs: Andrea Delle Vedove; Janani Natarajan; Ginevra Zanni; Matthias Eckenweiler; Anixa Muiños-Bühl; Markus Storbeck; Jordina Guillén Boixet; Sabina Barresi; Simone Pizzi; Irmgard Hölker; Friederike Körber; Titus M. Franzmann; Enrico S. Bertini; Janbernd Kirschner; Simon Alberti; Marco Tartaglia; Brunhilde Wirth
Publié dans: Cellular and Molecular Life Sciences, Numéro Volume 79, article number 526, 2022, ISSN 1420-9071
Éditeur: Springer Link
DOI: 10.21203/rs.3.rs-1838998/v1

Adaptable P body physical states differentially regulate bicoid mRNA storage during early Drosophila development

Auteurs: M. Sankaranarayanan, Ryan J. Emenecker, Elise L. Wilby, Marcus Jahnel, Irmela R.E.A. Trussina, Matt Wayland, Simon Alberti, Alex S. Holehouse, and Timothy T. Weil
Publié dans: Developmental Cell, Numéro Volume 56, Numéro 20, 2021, Page(s) 2886-2901.e6, ISSN 1534-5807
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2021.09.021

RNA buffers the phase separation behavior of prion-like RNA binding proteins

Auteurs: Shovamayee Maharana, Jie Wang, Dimitrios K. Papadopoulos, Doris Richter, Andrey Pozniakovsky, Ina Poser, Marc Bickle, Sandra Rizk, Jordina Guillén-Boixet, Titus M. Franzmann, Marcus Jahnel, Lara Marrone, Young-Tae Chang, Jared Sterneckert, Pavel Tomancak, Anthony A. Hyman, Simon Alberti
Publié dans: Science, Numéro 360/6391, 2018, Page(s) 918-921, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aar7366

A Molecular Grammar Governing the Driving Forces for Phase Separation of Prion-like RNA Binding Proteins

Auteurs: Jie Wang, Jeong-Mo Choi, Alex S. Holehouse, Hyun O. Lee, Xiaojie Zhang, Marcus Jahnel, Shovamayee Maharana, Régis Lemaitre, Andrei Pozniakovsky, David Drechsel, Ina Poser, Rohit V. Pappu, Simon Alberti, Anthony A. Hyman
Publié dans: Cell, Numéro 174/3, 2018, Page(s) 688-699.e16, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2018.06.006

Defective ribosomal products challenge nuclear function by impairing nuclear condensate dynamics and immobilizing ubiquitin

Auteurs: Laura Mediani, Jordina Guillén‐Boixet, Jonathan Vinet, Titus M Franzmann, Ilaria Bigi, Daniel Mateju, Arianna D Carrà, Federica F Morelli, Tatiana Tiago, Ina Poser, Simon Alberti, Serena Carra
Publié dans: The EMBO Journal, Numéro 38/15, 2019, ISSN 0261-4189
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.2018101341

ALS and FTD: Where RNA metabolism meets protein quality control

Auteurs: Jessica Mandrioli, Laura Mediani, Simon Alberti, Serena Carra
Publié dans: Seminars in Cell & Developmental Biology, 2019, ISSN 1084-9521
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.semcdb.2019.06.003

Liquid–Liquid Phase Separation in Disease

Auteurs: Simon Alberti, Dorothee Dormann
Publié dans: Annual Review of Genetics, Numéro 53/1, 2019, ISSN 0066-4197
Éditeur: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-genet-112618-043527

A User’s Guide for Phase Separation Assays with Purified Proteins

Auteurs: Simon Alberti, Shambaditya Saha, Jeffrey B. Woodruff, Titus M. Franzmann, Jie Wang, Anthony A. Hyman
Publié dans: Journal of Molecular Biology, Numéro 430/23, 2018, Page(s) 4806-4820, ISSN 0022-2836
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2018.06.038

Considerations and Challenges in Studying Liquid-Liquid Phase Separation and Biomolecular Condensates

Auteurs: Simon Alberti, Amy Gladfelter, Tanja Mittag
Publié dans: Cell, Numéro 176/3, 2019, Page(s) 419-434, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2018.12.035

Prion-like low-complexity sequences: Key regulators of protein solubility and phase behavior

Auteurs: Titus M. Franzmann, Simon Alberti
Publié dans: Journal of Biological Chemistry, Numéro 294/18, 2019, Page(s) 7128-7136, ISSN 0021-9258
Éditeur: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/jbc.tm118.001190

Quality Control of Membraneless Organelles

Auteurs: Simon Alberti, Serena Carra
Publié dans: Journal of Molecular Biology, Numéro 430/23, 2018, Page(s) 4711-4729, ISSN 0022-2836
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2018.05.013

FUS pathology in ALS is linked to alterations in multiple ALS-associated proteins and rescued by drugs stimulating autophagy

Auteurs: Lara Marrone, Hannes C. A. Drexler, Jie Wang, Priyanka Tripathi, Tania Distler, Patrick Heisterkamp, Eric Nathaniel Anderson, Sukhleen Kour, Anastasia Moraiti, Shovamayee Maharana, Rajat Bhatnagar, T. Grant Belgard, Vadreenath Tripathy, Norman Kalmbach, Zohreh Hosseinzadeh, Valeria Crippa, Masin Abo-Rady, Florian Wegner, Angelo Poletti, Dirk Troost, Eleonora Aronica, Volker Busskamp, Joachim Weis,
Publié dans: Acta Neuropathologica, Numéro 138/1, 2019, Page(s) 67-84, ISSN 0001-6322
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00401-019-01998-x

RNA-Induced Conformational Switching and Clustering of G3BP Drive Stress Granule Assembly by Condensation

Auteurs: Jordina Guillén-Boixet, Andrii Kopach, Alex S. Holehouse, Sina Wittmann, Marcus Jahnel, Raimund Schlüßler, Kyoohyun Kim, Irmela R.E.A. Trussina, Jie Wang, Daniel Mateju, Ina Poser, Shovamayee Maharana, Martine Ruer-Gruß, Doris Richter, Xiaojie Zhang, Young-Tae Chang, Jochen Guck, Alf Honigmann, Julia Mahamid, Anthony A. Hyman, Rohit V. Pappu, Simon Alberti, Titus M. Franzmann
Publié dans: Cell, Numéro 181/2, 2020, Page(s) 346-361.e17, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2020.03.049

SAMHD1 controls innate immunity by regulating condensation of immunogenic self RNA

Auteurs: Shovamayee Maharana, Stefanie Kretschmer, Susan Hunger, Xiao Yan, David Kuster, Sofia Traikov, Thomas Zillinger, Marc Gentzel, Shobha Elangovan, Padmanava Dasgupta, Nagaraja Chappidi, Nadja Lucas, Katharina Isabell Maser, Henrike Maatz, Alexander Rapp, Virginie Marchand, Young-Tae Chang, Yuri Motorin, Norbert Hubner, Gunther Hartmann, Anthony A Hyman, Simon Alberti, Min Ae Lee-Kirsch
Publié dans: Molecular Cell, Numéro Volume 82, Numéro 19, 2022, Page(s) 3712-3728, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.08.031

Hsp90-mediated regulation of DYRK3 couples stress granule disassembly and growth via mTORC1 signaling

Auteurs: Laura Mediani , Francesco Antoniani, Veronica Galli, Jonathan Vinet, Arianna Dorotea Carrà, Ilaria Bigi, Vadreenath Tripathy, Tatiana Tiago, Marco Cimino, Giuseppina Leo, Triana Amen, Daniel Kaganovich, Cristina Cereda, Orietta Pansarasa, Jessica Mandrioli, Priyanka Tripathi, Dirk Troost, Eleonora Aronica, Johannes Buchner, Anand Goswami, Jared Sterneckert, Simon Alberti, Serena Carra
Publié dans: Embo Reports, Numéro Volume 22, Numéro 5, 2021, Page(s) e51740, ISSN 1469-221X
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.202051740