Genomics and Mechanisms in Translational Medicine Doctoral Programme

Informations projet

GenomMed

N° de convention de subvention: 740264

DOI

10.3030/740264

Projet clôturé

Date de signature de la CE 29 Mars 2017

Date de début 1 Avril 2017

Date de fin 31 Decembre 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coût total

€ 2 511 360,00

Contribution de l’UE

€ 1 255 680,00

Coordonné par

ITA-SUOMEN YLIOPISTO
Finland

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Websites, patent fillings, videos etc. (2)

Programme Website
Social media accounts

Other (5)

"Communication to different audiences"" training course"

New, comprehensive “Communication to different audiences” training course for PhD students

Inform the Project Officer on publication of call

Inform for each call the Project Officer by sending the link to the Euraxess website where the Call has been published

Programme posters and flyers
Media coverages

Media coverages, also done later in the Project when applicable

Media meets researchers -seminar

Media meets researchers –seminar

Publications

Peer reviewed articles (41)

FTLD Patient–Derived Fibroblasts Show Defective Mitochondrial Function and Accumulation of p62

Auteurs: Stina Leskelä; Dorit Hoffmann; Hannah Rostalski; Nadine Huber; Rebekka Wittrahm; Päivi Hartikainen; Ville E. Korhonen; Ville Leinonen; Mikko Hiltunen; Eino Solje; Anne M. Remes; Anne M. Remes; Annakaisa Haapasalo
Publié dans: Molecular Neurobiology, Numéro 58, 2021, Page(s) 5438-5458, ISSN 0893-7648
Éditeur: Humana Press, Inc.
DOI: 10.1007/s12035-021-02475-x

SproutAngio: an open-source bioimage informatics tool for quantitative analysis of sprouting angiogenesis and lumen space

Auteurs: M. Beter, A. Abdollahzadeh, H. H. Pulkkinen, H. Huang, F. Orsenigo, P. U. Magnusson, S. Ylä-Herttuala, J. Tohka, J. P. Laakkonen
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 13, 2023, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-33090-6

The Alzheimer’s disease-associated protective Plcγ2-P522R variant promotes immune functions

Auteurs: Mari Takalo, Rebekka Wittrahm, Benedikt Wefers, Samira Parhizkar, Kimmo Jokivarsi, Teemu Kuulasmaa, Petra Mäkinen, Henna Martiskainen, Wolfgang Wurst, Xianyuan Xiang, Mikael Marttinen, Pekka Poutiainen, Annakaisa Haapasalo, Mikko Hiltunen, and Christian Haass 
Publié dans: Molecular Neurodegeneration, Numéro 15, 2020, Page(s) 52, ISSN 1750-1326
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13024-020-00402-7

GFAP as a biomarker in frontotemporal dementia and primary psychiatric disorders: diagnostic and prognostic performance

Auteurs: Katisko K, Cajanus A, Huber N, Jääskeläinen O, Kokkola T, Kärkkäinen V, Rostalski H, Hartikainen P, Koivisto AM, Hannonen S, Lehtola JM, Korhonen VE, Helisalmi S, Koivumaa-Honkanen H, Herukka SK, Remes AM, Solje E, Haapasalo A
Publié dans: Journal of Neurology, Neurosurgery and Psychiatry, Numéro vol. 92, no. 12, 2021, Page(s) 1-8, ISSN 0022-3050
Éditeur: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/jnnp-2021-326487

C9orf72 proteins regulate autophagy and undergo autophagosomal or proteasomal degradation in a cell type-dependent manner

Auteurs: Leskelä; Huber; Rostalski; Natunen; Remes; Takalo; Hiltunen; Haapasalo
Publié dans: Cells, Numéro 84, 2019, Page(s) E1233, ISSN 2073-4409
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/cells8101233

PI3Kβ inhibition enhances ALK-inhibitor sensitivity in ALK-rearranged lung cancer

Auteurs: Sarang S. Talwelkar, Mikko I. Mäyränpää, Julia Schüler, Nora Linnavirta, Annabrita Hemmes, Simone Adinolfi, Matti Kankainen, Wolfgang Sommergruber, Anna-Liisa Levonen, Jari Räsänen, Aija Knuuttila, Emmy W. Verschuren, Krister Wennerberg
Publié dans: Molecular Oncology, 2022, ISSN 1574-7891
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1002/1878-0261.13342

Indolepropionic Acid, a Gut Bacteria-Produced Tryptophan Metabolite and the Risk of Type 2 Diabetes and Non-Alcoholic Fatty Liver Disease

Auteurs: Sehgal, R., de Mello, V. D., Männistö, V., Lindström, J., Tuomilehto, J., Pihlajamäki, J., Uusitupa, M
Publié dans: Nutrients, Numéro 14(21), 2022, Page(s) 1-18, ISSN 2072-6643
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/nu14214695

A consensus protocol for functional connectivity analysis in the rat brain

Auteurs: Joanes Grandjean, Gabriel Desrosiers-Gregoire, Cynthia Anckaerts, Diego Angeles-Valdez, Fadi Ayad, David A. Barrière, Ines Blockx, Aleksandra Bortel, Margaret Broadwater, Beatriz M. Cardoso, Marina Célestine, Jorge E. Chavez-Negrete, Sangcheon Choi, Emma Christiaen, Perrin Clavijo, Luis Colon-Perez, Samuel Cramer, Tolomeo Daniele, Elaine Dempsey, Yujian Diao, Arno Doelemeyer, David Dopfel, Lenka
Publié dans: Nature Neuroscience, 2023, ISSN 1097-6256
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41593-023-01286-8

Convolutional Neural Networks Enable Robust Automatic Segmentation of the Rat Hippocampus in MRI After Traumatic Brain Injury

Auteurs: "De Feo, Riccardo; Hä mä lä inen, Elina; Manninen, Eppu; Immonen, Riikka; Valverde, Juan Miguel; Ndode-Ekane, Xavier Ekolle; Grö hn, Olli; Pitkä nen, Asla; Tohka, Jussi"
Publié dans: Frontiers in Neurology, Numéro 13, 2022, Page(s) 820267, ISSN 1664-2295
Éditeur: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fneur.2022.820267

Dissecting the polygenic basis of atherosclerosis via disease-associated cell state signatures

Auteurs: Tiit Örd, Tapio Lönnberg, Valtteri Nurminen, Aarthi Ravindran, Henri Niskanen, Miika Kiema, Kadri Õunap, Maleeha Maria, Pierre R. Moreau, Pashupati P. Mishra, Senthil Palani, Jenni Virta, Heidi Liljenbäck, Einari Aavik, Anne Roivainen, Seppo Ylä-Herttuala, Johanna P. Laakkonen, Terho Lehtimäki, Minna U. Kaikkonen
Publié dans: The American Journal of Human Genetics, Numéro 110, 2024, Page(s) 722-740, ISSN 0002-9297
Éditeur: University of Chicago Press
DOI: 10.1016/j.ajhg.2023.03.013

Protective Alzheimer’s disease-associated APP A673T variant predominantly decreases sAPPβ levels in cerebrospinal fluid and 2D/3D cell culture models

Auteurs: Rebekka Wittrahm, Mari Takalo, Teemu Kuulasmaa, Petra M Mäkinen, Petri Mäkinen, Saša Končarević, Vadim Fartzdinov, Stefan Selzer, Tarja Kokkola, Leila Antikainen, Henna Martiskainen, Susanna Kemppainen, Mikael Marttinen, Heli Jeskanen, Hannah Rostalski, Eija Rahunen, Miia Kivipelto, Tiia Ngandu, Teemu Natunen, Jean-Charles Lambert, Rudolph E Tanzi, Doo Yeon Kim, Tuomas Rauramaa, Sanna-Kaisa H
Publié dans: Neurobiology of Disease, Numéro vol 182, 2024, Page(s) 106140, ISSN 1095-953X
Éditeur: Elsevier Inc.
DOI: 10.21203/rs.3.rs-2275464/v1

Region-wise loss for biomedical image segmentation

Auteurs: J.M. Valverde, J. Tohka
Publié dans: Pattern Recognition, Numéro 136, 2023, Page(s) 109208, ISSN 0031-3203
Éditeur: Pergamon Press
DOI: 10.1016/j.patcog.2022.109208

Characterization of a functional endothelial super-enhancer that regulates ADAMTS18 and angiogenesis

Auteurs: Isidore Mushimiyimana, Henri Niskanen, Mustafa Beter, Johanna P Laakkonen, Minna U Kaikkonen, Seppo Ylä-Herttuala, Nihay Laham-Karam
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro vol. 49, no. 14, 2021, Page(s) 8078-8096, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab633

ciRS-7 and miR-7 regulate ischemia-induced neuronal death via glutamatergic signaling

Auteurs: Flavia Scoyni, Valeriia Sitnikova, Luca Giudice, Paula Korhonen, Davide M. Trevisan, Ana Hernandez de Sande, Mireia Gomez-Budia, Raisa Giniatullina, Irene F. Ugidos, Hiramani Dhungana, Cristiana Pistono, Nea Korvenlaita, Nelli-Noora Välimäki, Salla M. Kangas, Anniina E. Hiltunen, Emma Gribchenko, Minna U. Kaikkonen-Määttä, Jari Koistinaho, Seppo Ylä-Herttuala, Reetta Hinttala, Morten T. Ven
Publié dans: Cell Reports, Numéro 43, 2025, Page(s) 113862, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2024.113862

Epigenetic drug screening identifies enzyme inhibitors A-196 and TMP-269 as novel regulators of sprouting angiogenesis

Auteurs: M. Beter, H. H. Pulkkinen, T. Örd, A. Sormunen, L. Kilpeläinen, J. E. Dunford, M. U. Kaikkonen, E. Aavik, N. Laham-Karam, U. Oppermann, J. P. Laakkonen, S. Ylä-Herttuala
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 15, 2025, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-024-84603-w

Serum aromatic and branched-chain amino acids associated with NASH demonstrate divergent associations with serum lipids

Auteurs: de Mello VD, Sehgal R, Männistö V, Klåvus A, Nilsson E, Perfilyev A, Kaminska D, Miao Z, Pajukanta P, Ling C, Hanhineva K, Pihlajamäki J.
Publié dans: Liver International, Numéro 41, 2021, Page(s) 754-763, ISSN 1478-3231
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd
DOI: 10.1111/liv.14743

Indole-3-propionic acid promotes hepatic stellate cells inactivation

Auteurs: Mariana Ilha, Ratika Sehgal, Johanna Matilainen, Kirsi Rilla, Dorota Kaminska, Shrey Gandhi, Ville Männistö, Charlotte Ling, Stefano Romeo, Päivi Pajukanta, Eija Pirinen, Kirsi A. Virtanen, Kirsi H. Pietiläinen, Maija Vaittinen, Jussi Pihlajamäki
Publié dans: Journal of Translational Medicine, Numéro 23, 2025, ISSN 1479-5876
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12967-025-06266-z

Translatome profiling reveals <i>Itih4</i> as a novel smooth muscle cell–specific gene in atherosclerosis

Auteurs: Aarthi Ravindran, Lari Holappa, Henri Niskanen, Ilya Skovorodkin, Susanna Kaisto, Mustafa Beter, Miika Kiema, Ilakya Selvarajan, Valtteri Nurminen, Einari Aavik, Rédouane Aherrahrou, Sanna Pasonen-Seppänen, Vittorio Fortino, Johanna P Laakkonen, Seppo Ylä-Herttuala, Seppo Vainio, Tiit Örd, Minna U Kaikkonen
Publié dans: Cardiovascular Research, Numéro 120, 2024, Page(s) 869-882, ISSN 0008-6363
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1093/cvr/cvae028

Deficient neurotransmitter systems and synaptic function in frontotemporal lobar degeneration—Insights into disease mechanisms and current therapeutic approaches

Auteurs: Nadine Huber, Sonja Korhonen, Dorit Hoffmann, Stina Leskelä, Hannah Rostalski, Anne M. Remes, Paavo Honkakoski, Eino Solje, Annakaisa Haapasalo
Publié dans: Molecular Psychiatry, Numéro 27, 2022, Page(s) 1300-1309, ISSN 1359-4184
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41380-021-01384-8

Automated joint skull-stripping and segmentation with Multi-Task U-Net in large mouse brain MRI databases

Auteurs: Riccardo De Feo, Artem Shatillo, Alejandra Sierra, Juan Miguel Valverde, Olli Gröhn, Federico Giove, Jussi Tohka
Publié dans: NeuroImage, Numéro 229, 2021, Page(s) 117734, ISSN 1053-8119
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2021.117734

MECP2 Increases the Pro-Inflammatory Response of Microglial Cells and Phosphorylation at Serine 423 Regulates Neuronal Gene Expression upon Neuroinflammation.

Auteurs: Rebekka Wittrahm; Mari Takalo; Mikael Marttinen; Teemu Kuulasmaa; Petra Mäkinen; Susanna Kemppainen; Henna Martiskainen; Tuomas Rauramaa; Ian Pike; Ville Leinonen; Teemu Natunen; Annakaisa Haapasalo; Mikko Hiltunen
Publié dans: Cells, Numéro 10, 2021, Page(s) 860, ISSN 2073-4409
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/cells10040860

Hypoxia-Mediated Regulation of Histone Demethylases Affects Angiogenesis-Associated Functions in Endothelial Cells

Auteurs: Liu, O. H. F., Kiema, M., Beter, M., Ylä-Herttuala, S., Laakkonen, J. P., & Kaikkonen, M. U.
Publié dans: Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology, Numéro 40, 2020, Page(s) 2665-2667, ISSN 1079-5642
Éditeur: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1161/atvbaha.120.315214

Transfer Learning in Magnetic Resonance Brain Imaging: A Systematic Review.

Auteurs: Juan Miguel Valverde; Vandad Imani; Ali Abdollahzadeh; Riccardo De Feo; Mithilesh Prakash; Robert Ciszek; Jussi Tohka
Publié dans: Journal of Imaging, Numéro 7, 2021, Page(s) 66, ISSN 2313-433X
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/jimaging7040066

Indole-3-Propionic Acid, a Gut-Derived Tryptophan Metabolite, Associates with Hepatic Fibrosis

Auteurs: Sehgal, Ratika, Mariana Ilha, Maija Vaittinen, Dorota Kaminska, Ville Männistö, Vesa Kärjä, Marjo Tuomainen, Kati Hanhineva, Stefano Romeo, Päivi Pajukanta, Jussi Pihlajamäki, and Vanessa D. de Mello
Publié dans: Nutrients, Numéro 13, 2021, Page(s) 3509, ISSN 2072-6643
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/nu13103509

Light sedation with short habituation time for large-scale functional magnetic resonance imaging studies in rats

Auteurs: Lenka Dvořáková, Petteri Stenroos, Ekaterina Paasonen, Raimo A. Salo, Jaakko Paasonen, Olli Gröhn
Publié dans: NMR in Biomedicine, Numéro vol. 35, no. 6, 2021, Page(s) 1-13, ISSN 0952-3480
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/nbm.4679

Astrocytes and Microglia as Potential Contributors to the Pathogenesis of C9orf72 Repeat Expansion-Associated FTLD and ALS

Auteurs: Hannah Rostalski, Stina Leskelä, Nadine Huber, Kasper Katisko, Antti Cajanus, Eino Solje, Mikael Marttinen, Teemu Natunen, Anne M. Remes, Mikko Hiltunen, Annakaisa Haapasalo
Publié dans: Frontiers in Neuroscience, Numéro 13, 2019, ISSN 1662-453X
Éditeur: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fnins.2019.00486

RatLesNetv2: A Fully Convolutional Network for Rodent Brain Lesion Segmentation

Auteurs: "Juan Miguel Valverde,; Artem, Shatillo; De Feo, Riccardo; Olli, Gr&#246; hn; Alejandra, Sierra; Jussi, Tohka"
Publié dans: Frontiers in Neuroscience, Numéro 14, 2020, Page(s) 610239, ISSN 1662-453X
Éditeur: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fnins.2020.610239

Treatment of Status Epilepticus after Traumatic Brain Injury Using an Antiseizure Drug Combined with a Tissue Recovery Enhancer Revealed by Systems Biology

Auteurs: Natallie Kajevu, Anssi Lipponen, Pedro Andrade, Ivette Bañuelos, Noora Puhakka, Elina Hämäläinen, Teemu Natunen, Mikko Hiltunen, Asla Pitkänen
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 24, 2025, Page(s) 14049, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms241814049

The mouse motor system contains multiple premotor areas and partially follows human organizational principles

Auteurs: Alberto Lazari, Mohamed Tachrount, Juan Miguel Valverde, Daniel Papp, Antoine Beauchamp, Paul McCarthy, Jacob Ellegood, Joanes Grandjean, Heidi Johansen-Berg, Valerio Zerbi, Jason P. Lerch, Rogier B. Mars
Publié dans: Cell Reports, Numéro 43, 2025, Page(s) 114191, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2024.114191

C9orf72 hexanucleotide repeat expansion leads to altered neuronal and dendritic spine morphology and synaptic dysfunction

Auteurs: Huber N, Hoffmann D, Giniatullina R, Rostalski H, Leskelä S, Takalo M, Natunen T, Solje E, Remes AM, Giniatullin R, Hiltunen M, Haapasalo A
Publié dans: Neurobiology of Disease, Numéro 162, 2022, Page(s) 105584, ISSN 0969-9961
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.nbd.2021.105584

Liver saturated fat content associates with hepatic DNA methylation in obese individuals

Auteurs: Ratika Sehgal, Alexander Perfilyev, Ville Männistö, Jyrki Ågren, Emma Nilsson, Pirjo Käkelä, Charlotte Ling, Vanessa D. de Mello, Jussi Pihlajamäki
Publié dans: Clinical Epigenetics, Numéro 15, 2023, Page(s) 21, ISSN 1868-7083
Éditeur: BioMed Central Ltd
DOI: 10.1186/s13148-023-01431-x

PI3Kβ inhibition restores ALK inhibitor sensitivity in ALK-rearranged lung cancer

Auteurs: Sarang S. Talwelkar, Mikko I. Mäyränpää, Julia Schüler, Nora Linnavirta, Annabrita Hemmes, Simone Adinolfi, Matti Kankainen, Wolfgang Sommergruber, Anna-Liisa Levonen, Jari Räsänen, Aija Knuuttila, Emmy W. Verschuren, Krister Wennerberg
Publié dans: Molecular Oncology, Numéro 17(5), 2024, Page(s) 747-764, ISSN 1574-7891
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1101/2021.03.18.435801

BV-2 Microglial Cells Overexpressing C9orf72 Hexanucleotide Repeat Expansion Produce DPR Proteins and Show Normal Functionality but No RNA Foci

Auteurs: Hannah Rostalski, Tomi Hietanen, Stina Leskelä, Andrea Behánová, Ali Abdollahzadeh, Rebekka Wittrahm, Petra Mäkinen, Nadine Huber, Dorit Hoffmann, Eino Solje, Anne M. Remes, Teemu Natunen, Mari Takalo, Jussi Tohka, Mikko Hiltunen and Annakaisa Haapasalo
Publié dans: Frontiers in Neurology, Numéro 11, 2020, Page(s) 1-21, ISSN 1664-2295
Éditeur: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/fneur.2020.550140

BMP6/TAZ-Hippo signaling modulates angiogenesis and endothelialcell response to VEGF

Auteurs: Pulkkinen, H. H., Kiema, M., Lappalainen, J. P., Toropainen, A., Beter, M., Tirronen, A., ... & Laakkonen, J. P
Publié dans: Angiogenesis, Numéro 24, 2021, Page(s) 139-144, ISSN 0969-6970
Éditeur: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10456-020-09748-4

Sauron U-Net: Simple automated redundancy elimination in medical image segmentation via filter pruning

Auteurs: Juan Miguel Valverde, Artem Shatillo, Jussi Tohka
Publié dans: Neurocomputing, Numéro 594, 2024, Page(s) 127817, ISSN 0925-2312
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.neucom.2024.127817

Oncogenic KEAP1 mutations activate TRAF2-NFκB signaling to prevent apoptosis in lung cancer cells

Auteurs: Ashik Jawahar Deen, Simone Adinolfi, Jouni Härkönen, Tommi Patinen, Xiaonan Liu, Tuomo Laitinen, Piia Takabe, Kirsi Kainulainen, Sanna Pasonen-Seppänen, Lisa M Gawriyski, Uma Thanigai Arasu, Ilakya Selvarajan, Petri Mäkinen, Hanna Laitinen, Emilia Kansanen, Minna U Kaikkonen, Antti Poso, Markku Varjosalo, Anna-Liisa Levonen
Publié dans: Redox Biology, Numéro vol 69, 2024, Page(s) 103031, ISSN 2213-2317
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1101/2023.10.10.561664

A Novel Genetic Marker for the C9orf72 Repeat Expansion in the Finnish Population

Auteurs: Rostalski H, Korhonen V, Kuulasmaa T, Solje E, Krüger J, Gen F, Kaivola K, Eide PK, Lambert JC, Julkunen V, Tienari PJ, Remes AM, Leinonen V, Hiltunen M, Haapasalo A
Publié dans: Journal of Alzheimer's Disease, Numéro vol. 83, no. 3, 2021, Page(s) 1325-1332, ISSN 1387-2877
Éditeur: IOS Press
DOI: 10.3233/jad-210599

Expression of C9orf72 hexanucleotide repeat expansion leads to formation of RNA foci and dipeptide repeat proteins but does not influence autophagy or proteasomal function in neuronal cells

Auteurs: Leskelä S, Huber N, Hoffmann D, Rostalski H, Remes AM, Takalo M, Hiltunen M, Haapasalo A
Publié dans: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research, Numéro vol. 1868, no. 7, 2021, Page(s) 119021, ISSN 0167-4889
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bbamcr.2021.119021

Automatic Cerebral Hemisphere Segmentation in Rat MRI with Ischemic Lesions via Attention-based Convolutional Neural Networks

Auteurs: Juan Miguel Valverde, Artem Shatillo, Riccardo De Feo, and Jussi Tohka
Publié dans: Neuroinformatics, 2022, ISSN 1539-2791
Éditeur: Humana Press, Inc.
DOI: 10.1007/s12021-022-09607-1

Metabolite Signature in the Carriers of Pathogenic Genetic Variants for Cardiomyopathy: A Population-Based METSIM Study

Auteurs: Ravi R, Fernandes Silva L, Vangipurapu J, Maria M, Raivo J, Helisalmi S, Laakso M
Publié dans: Metabolites, Numéro 12(5), 2022, Page(s) 437, ISSN 2218-1989
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/metabo12050437

Modification in mitochondrial function is associated with the FADS1 variant and its interaction with alpha-linolenic acid-enriched diet—An exploratory study

Auteurs: Maija Vaittinen, Mariana Ilha, Ratika Sehgal, Maria A. Lankinen, Jyrki Ågren, Pirjo Käkelä, Kirsi A. Virtanen, Markku Laakso, Ursula Schwab, Jussi Pihlajamäki
Publié dans: Journal of Lipid Research, Numéro 65, 2024, Page(s) 100638, ISSN 0022-2275
Éditeur: Lipid Research, Inc.
DOI: 10.1016/j.jlr.2024.100638

Thesis and dissertations (6)

C9orf72 hexanucleotide repeat expansion in frontotemporal dementia special focus on genetics and microglia

Auteurs: Rostalski, Hannah
Publié dans: Dissertations in Health Sciences, Numéro 688, 2022, ISBN 978-952-61-4570-9
Éditeur: PunaMusta Oy

Metabolomics and genomics approach in cardiovascular diseases

Auteurs: Rowmika Ravi
Publié dans: Dissertations in Health Sciences, Numéro 742, 2023, ISBN 978-952-61-4821-2
Éditeur: PunaMusta Oy

MRI Segmentation With Deep Learning: Application in Rodent Brain Images with Lesions

Auteurs: Valverde, Juan Miguel
Publié dans: Dissertations in Health Sciences, Numéro 700, 2022, ISBN 978-952-61-4623-2
Éditeur: PunaMusta Oy

Unlocking the potential of non-coding RNAs in regulating neurodegeneration: a glimpse into Alzheimer's disease and ischemic stroke pathophysiology

Auteurs: Scoyni, Flavia
Publié dans: Dissertations in Health Sciences, Numéro 809, 2024, ISBN 978-952-61-5128-1
Éditeur: Punamusta Oy

Nutrient-related metabolites in non-alcoholic fatty liver disease: Association with molecular & clinical characteristics

Auteurs: Sehgal, Ratika
Publié dans: Dissertations in Health Sciences, Numéro 703, 2022, ISBN 978-952-61-4639-3
Éditeur: PunaMusta Oy

Identification of treatments for repurposing to enhance recovery outcome after traumatic brain injury

Auteurs: Kajevu, Natallie
Publié dans: Dissertations in Health Sciences, Numéro 848, 2024, ISBN 978-952-61-5307-0
Éditeur: Punamusta Oy

Book chapters (1)

Predicting intelligence based on cortical WM/GM contrast, cortical thickness and volumetry

Auteurs: Valverde, Juan Miguel; Imani, Vandad; Lewis, John D.; Tohka, Jussi
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science, Numéro 11791, 2019, Page(s) 57-65, ISBN 978-3-030-31901-4
Éditeur: Springer, Cham
DOI: 10.1007/978-3-030-31901-4_7

Conference proceedings (1)

Automatic Rodent Brain MRI Lesion Segmentation with Fully Convolutional Networks

Auteurs: Valverde, Juan Miguel; Shatillo, Artem; de Feo, Riccardo; Gröhn, Olli; Sierra, Alejandra; Tohka, Jussi
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science, Numéro 11861, 2019, Page(s) 195-202, ISBN 978-3-030-32692-0
Éditeur: Springer, Cham
DOI: 10.48550/arxiv.1908.08746