Objetivo
Critical for the function of many proteins, allosteric communication involves transmission of the effect of binding at one site of a protein to another through conformational changes. Yet the structural and dynamic basis for allostery remains poorly understood. In particular, there is no method to follow coordinated large-scale motions of domains and subunits in proteins as they occur. Since the subunits of allosteric proteins often contain multiple domains, any such method entails probing the dynamics along several intra-protein distances simultaneously.
This proposal aims at ameliorating this deficiency by creating the experimental framework for exploring time-dependent coordination of allosteric transitions of multiple units within proteins. Our methodology will rely on single-molecule FRET spectroscopy with multiple labels on the same protein and advanced analysis. We will explore fundamental issues in protein dynamics: relative motions of domains within subunits, propagation of conformational change between subunits, and synchronization of these motions by effector molecules.
To investigate these issues, we have carefully selected three model systems, each representing an important scenario of allosteric regulation. While the homo-oligomeric protein-folder GroEL conserves symmetry in a concerted transition between major structural states, the symmetry of the homo-oligomeric disaggregating machine ClpB is broken via a sequential transition. Symmetry is attained only after binding to DNA and ligands in the third system, the family of RXR heterodimers.
This exciting project will provide the very first catalogue of coordinated and time-ordered motions within and between subunits of allosteric proteins and the first measurement of the time scale of the conformational spread through a large protein. It will enhance dramatically our understanding of how allostery contributes to protein function, influencing future efforts to design drugs for allosteric proteins.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
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- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias físicas óptica espectroscopia
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
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ERC-ADG - Advanced Grant
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2016-ADG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
7610001 Rehovot
Israel
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.