Obiettivo
Critical for the function of many proteins, allosteric communication involves transmission of the effect of binding at one site of a protein to another through conformational changes. Yet the structural and dynamic basis for allostery remains poorly understood. In particular, there is no method to follow coordinated large-scale motions of domains and subunits in proteins as they occur. Since the subunits of allosteric proteins often contain multiple domains, any such method entails probing the dynamics along several intra-protein distances simultaneously.
This proposal aims at ameliorating this deficiency by creating the experimental framework for exploring time-dependent coordination of allosteric transitions of multiple units within proteins. Our methodology will rely on single-molecule FRET spectroscopy with multiple labels on the same protein and advanced analysis. We will explore fundamental issues in protein dynamics: relative motions of domains within subunits, propagation of conformational change between subunits, and synchronization of these motions by effector molecules.
To investigate these issues, we have carefully selected three model systems, each representing an important scenario of allosteric regulation. While the homo-oligomeric protein-folder GroEL conserves symmetry in a concerted transition between major structural states, the symmetry of the homo-oligomeric disaggregating machine ClpB is broken via a sequential transition. Symmetry is attained only after binding to DNA and ligands in the third system, the family of RXR heterodimers.
This exciting project will provide the very first catalogue of coordinated and time-ordered motions within and between subunits of allosteric proteins and the first measurement of the time scale of the conformational spread through a large protein. It will enhance dramatically our understanding of how allostery contributes to protein function, influencing future efforts to design drugs for allosteric proteins.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze fisiche ottica spettroscopia
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
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Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
ERC-ADG - Advanced Grant
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
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(si apre in una nuova finestra) ERC-2016-ADG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
7610001 Rehovot
Israele
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.