Dissecting quantitative traits and their underlying genetic interactions via systematic genome editing

Informations projet

SystGeneEdit

N° de convention de subvention: 742804

DOI

10.3030/742804

Projet clôturé

Date de signature de la CE 16 Mai 2017

Date de début 1 Novembre 2017

Date de fin 31 Octobre 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 499 995,00

Contribution de l’UE

€ 2 499 995,00

Coordonné par

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Germany

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Publications

Peer reviewed articles (6)

CRISPRi screens reveal genes modulating yeast growth in lignocellulose hydrolysate

Auteurs: Gutmann F, Jann C, Pereira F, Johansson A, Steinmetz LM, Patil KR
Publié dans: Biotechnology for Biofuels, 2021, ISSN 2731-3654
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1186/s13068-021-01880-7

High-throughput functional characterization of protein phosphorylation sites in yeast

Auteurs: Viéitez C, Busby BP, Ochoa D, Mateus A, Memon D, Galardini M, Yildiz U, Trovato M, Jawed A, Geiger AG, Oborská-Oplová M, Potel CM, Vonesch SC, Szu Tu C, Shahraz M, Stein F, Steinmetz LM, Panse VG, Noh KM, Savitski MM, Typas A, Beltrao P
Publié dans: Nature Biotechnology, 2022, ISSN 1087-0156
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-021-01051-x

Fast and inexpensive whole genome sequencing library preparation from intact yeast cells

Auteurs: Vonesch SC, Li S, Szu Tu C, Hennig BP, Dobrev N, Steinmetz LM
Publié dans: G3 Genes|Genomes|Genetics, 2020, ISSN 2160-1836
Éditeur: Genetics Society of America
DOI: 10.1101/2020.09.03.280990

High-speed fluorescence image-enabled cell sorting

Auteurs: Schraivogel D, Kuhn TM, Rauscher B, Rodríguez-Martínez M, Paulsen M, Owsley K, Middlebrook A, Tischer C, Ramasz B, Ordoñez-Rueda D, Dees M, Cuylen-Haering S, Diebold E, Steinmetz LM
Publié dans: Science, 2022, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.abj3013

Combined single-cell and spatial transcriptomics reveal the molecular, cellular and spatial bone marrow niche organization

Auteurs: Chiara Baccin, Jude Al-Sabah, Lars Velten, Patrick M. Helbling, Florian Grünschläger, Pablo Hernández-Malmierca, César Nombela-Arrieta, Lars M. Steinmetz, Andreas Trumpp, Simon Haas
Publié dans: Nature Cell Biology, Numéro 22/1, 2020, Page(s) 38-48, ISSN 1465-7392
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-019-0439-6

Targeted Perturb-seq enables genome-scale genetic screens in single cells

Auteurs: Daniel Schraivogel, Andreas R. Gschwind, Jennifer H. Milbank, Daniel R. Leonce, Petra Jakob, Lukas Mathur, Jan O. Korbel, Christoph A. Merten, Lars Velten, Lars M. Steinmetz
Publié dans: Nature Methods, Numéro 17/6, 2020, Page(s) 629-635, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-020-0837-5

Thesis and dissertations (1)

Mechanisms of Cellular Stress Adaptation

Auteurs: Jann, C
Publié dans: 2020
Éditeur: Doctor of Science - ETH Zurich
DOI: 10.3929/ethz-b-000480073

Other (1)

Towards a systematic map of the functional role of protein phosphorylation

Auteurs: C. Viéitez, B. P. Busby, D. Ochoa, A. Mateus, M. Galardini, A. Jawed, D. Memon, C. Potel, S. C. Vonesch, C. Szu Tu, M. Shahraz, F. Stein, L. M. Steinmetz, M. Savitski, A. Typas, P. Beltrao
Publié dans: bioRXiv, 2019
Éditeur: bioRXiv
DOI: 10.1101/872770