Tracing Evolution of Auxin Transport and Polarity in Plants

Informations projet

ETAP

N° de convention de subvention: 742985

DOI

10.3030/742985

Projet clôturé

Date de signature de la CE 18 Août 2017

Date de début 1 Janvier 2018

Date de fin 31 Decembre 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 410 292,00

Contribution de l’UE

€ 2 410 292,00

Coordonné par

INSTITUTE OF SCIENCE AND TECHNOLOGY AUSTRIA
Austria

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Publications

Peer reviewed articles (43)

Endocytosis of BRASSINOSTEROID INSENSITIVE1 Is Partly Driven by a Canonical Tyr-Based Motif

Auteurs: Derui Liu, Rahul Kumar, Lucas A.N. Claus, Alexander J. Johnson, Wei Siao, Isabelle Vanhoutte, Peng Wang, Kyle W. Bender, Klaas Yperman, Sara Martins, Xiuyang Zhao, Grégory Vert, Daniël Van Damme, Jiří Friml, Eugenia Russinova
Publié dans: The Plant Cell, Numéro 32/11, 2020, Page(s) 3598-3612, ISSN 1040-4651
Éditeur: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1105/tpc.20.00384

PIN-mediated polar auxin transport regulations in plant tropic responses.

Auteurs: Huibin Han; Huibin Han; Maciek Adamowski; Linlin Qi; Saqer S. Alotaibi; Jiří Friml
Publié dans: New Phytologist, Numéro 3, 2021, ISSN 0028-646x
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.17617

Developmental roles of Auxin Binding Protein 1 in Arabidopsis thaliana

Auteurs: Zuzana Gelová, Michelle Gallei, Markéta Pernisová, Géraldine Brunoud, Xixi Zhang, Matouš Glanc, Lanxin Li, Jaroslav Michalko, Zlata Pavlovičová, Inge Verstraeten, Huibin Han, Jakub Hajný, Robert Hauschild, Milada Čovanová, Marta Zwiewka, Lukas Hoermayer, Matyáš Fendrych, Tongda Xu, Teva Vernoux, Jiří Friml
Publié dans: Plant Science, Numéro 303, 2021, Page(s) 110750, ISSN 0168-9452
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.plantsci.2020.110750

ABP1-TMK auxin perception for global phosphorylation and auxin canalization

Auteurs: 2. Friml J, Gallei M, Gelová Z, Johnson A, Mazur E, Monzer A, Rodriguez L, Roosjen M, Verstraeten I, Živanović BD, Zou M, Fiedler L, Giannini C, Grones P, Hrtyan M, Kaufmann WA, Kuhn A, Narasimhan M, Randuch M, Rýdza N, Takahashi K, Tan S, Teplova A, Kinoshita T, Weijers D, Rakusová H.
Publié dans: Nature, 2022, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-05187-x

Auxin analog-induced Ca2+ signaling is independent of inhibition of endosomal aggregation in Arabidopsis roots

Auteurs: 3. Wang R, Himschoot E, Grenzi M, Chen J, Safi A, Krebs M, Schumacher K, Nowack MK, Moeder W, Yoshioka K, Van Damme D, De Smet I, Geelen D, Beeckman T, Friml J, Costa A, Vanneste S.
Publié dans: Journal of Experimental Botany, 2022, ISSN 0022-0957
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jxb/erac019

Pho-view of Auxin: Reversible Protein Phosphorylation in Auxin Biosynthesis, Transport and Signaling

Auteurs: Shutang Tan, Christian Luschnig, Jiří Friml
Publié dans: Molecular Plant, Numéro 14/1, 2021, Page(s) 151-165, ISSN 1674-2052
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1016/j.molp.2020.11.004

INDITTO2 transposon conveys auxin-mediated DRO1 transcription for rice drought avoidance

Auteurs: 8. Zhao Y, Wu L, Fu Q, Wang D, Li J, Yao B, Yu S, Jiang L, Qian J, Zhou X, Han L, Zhao S, Ma C, Zhang Y, Luo C, Dong Q, Li S, Zhang L, Jiang X, Li Y, Luo H, Li K, Yang J, Luo Q, Li L, Peng S, Huang H, Zuo Z, Liu C, Wang L, Li C, He X, Friml J, Du Y
Publié dans: Plant, Cell & Environment, 2021, ISSN 0140-7791
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/pce.14029

Adenylate cyclase activity of TIR1/AFB auxin receptors in plants

Auteurs: 1. Qi L, Kwiatkowski M, Chen H, Hoermayer L, Sinclair S, Zou M, del Genio C, Kubeš M, Napier R, Jaworski K, Friml J
Publié dans: Nature, 2022, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-05369-7

AGC kinases and MAB4/MEL proteins maintain PIN polarity by limiting lateral diffusion in plant cells

Auteurs: 7. Glanc M, Van Gelderen K, Hoermayer L, Tan S, Naramoto S, Zhang X, Domjan D, Včelařová L, Hauschild R, Johnson A, de Koning E, van Dop M, Rademacher E, Janson S, Wei X, Molnár G, Fendrych M, De Rybel B, Offringa R, Friml J
Publié dans: Current Biology, 2021, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2021.02.028

Cell surface and intracellular auxin signalling for H+ fluxes in root growth

Auteurs: 4. Li L, Verstraeten I, Roosjen M, Takahashi K, Rodriguez L, Merrin J, Chen J, Shabala L, Smet W, Ren H, Vanneste S, Shabala S, De Rybel B, Weijers D, Kinoshita T, Gray WM, Friml J.
Publié dans: Nature, 2021, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-021-04037-6

Cell-surface receptors enable perception of extracellular cytokinins

Auteurs: Ioanna Antoniadi, Ondřej Novák, Zuzana Gelová, Alexander Johnson, Ondřej Plíhal, Radim Simerský, Václav Mik, Thomas Vain, Eduardo Mateo-Bonmatí, Michal Karady, Markéta Pernisová, Lenka Plačková, Korawit Opassathian, Jan Hejátko, Stéphanie Robert, Jiří Friml, Karel Doležal, Karin Ljung, Colin Turnbull
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-17700-9

Cellular requirements for PIN polar cargo clustering in Arabidopsis thaliana

Auteurs: Hongjiang Li, Daniel Wangenheim, Xixi Zhang, Shutang Tan, Nasser Darwish‐Miranda, Satoshi Naramoto, Krzysztof Wabnik, Riet De Rycke, Walter A. Kaufmann, Daniel Gütl, Ricardo Tejos, Peter Grones, Meiyu Ke, Xu Chen, Jan Dettmer, Jiří Friml
Publié dans: New Phytologist, Numéro 229/1, 2021, Page(s) 351-369, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.16887

Relative Contribution of PIN-Containing Secretory Vesicles and Plasma Membrane PINs to the Directed Auxin Transport: Theoretical Estimation

Auteurs: Sander Hille, Maria Akhmanova, Matouš Glanc, Alexander Johnson, Jiří Friml
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 19/11, 2018, Page(s) 3566, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms19113566

PID/WAG-mediated phosphorylation of the Arabidopsis PIN3 auxin transporter mediates polarity switches during gravitropism

Auteurs: Peter Grones, Melinda Abas, Jakub Hajný, Angharad Jones, Sascha Waidmann, Jürgen Kleine-Vehn, Jiří Friml
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 8/1, 2018, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-018-28188-1

Re-activation of Stem Cell Pathways for Pattern Restoration in Plant Wound Healing

Auteurs: Petra Marhava, Lukas Hoermayer, Saiko Yoshida, Peter Marhavý, Eva Benková, Jiří Friml
Publié dans: Cell, Numéro 177/4, 2019, Page(s) 957-969.e13, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2019.04.015

PIN2 Polarity Establishment in Arabidopsis in the Absence of an Intact Cytoskeleton

Auteurs: Matouš Glanc, Matyáš Fendrych, Jiří Friml
Publié dans: Biomolecules, Numéro 9/6, 2019, Page(s) 222, ISSN 2218-273X
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute
DOI: 10.3390/biom9060222

Pinstatic Acid Promotes Auxin Transport by Inhibiting PIN Internalization

Auteurs: Akihiro Oochi, Jakub Hajny, Kosuke Fukui, Yukio Nakao, Michelle Gallei, Mussa Quareshy, Koji Takahashi, Toshinori Kinoshita, Sigurd Ramans Harborough, Stefan Kepinski, Hiroyuki Kasahara, Richard Napier, Jiří Friml, Ken-ichiro Hayashi
Publié dans: Plant Physiology, Numéro 180/2, 2019, Page(s) 1152-1165, ISSN 0032-0889
Éditeur: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1104/pp.19.00201

Mechanistic framework for cell-intrinsic re-establishment of PIN2 polarity after cell division

Auteurs: Matouš Glanc, Matyáš Fendrych, Jiří Friml
Publié dans: Nature Plants, Numéro 4/12, 2018, Page(s) 1082-1088, ISSN 2055-0278
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41477-018-0318-3

TMK1-mediated auxin signalling regulates differential growth of the apical hook

Auteurs: Min Cao, Rong Chen, Pan Li, Yongqiang Yu, Rui Zheng, Danfeng Ge, Wei Zheng, Xuhui Wang, Yangtao Gu, Zuzana Gelová, Jiří Friml, Heng Zhang, Renyi Liu, Jun He, Tongda Xu
Publié dans: Nature, Numéro 568/7751, 2019, Page(s) 240-243, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1069-7

The Inhibitor Endosidin 4 Targets SEC7 Domain-Type ARF GTPase Exchange Factors and Interferes with Subcellular Trafficking in Eukaryotes

Auteurs: Urszula Kania, Tomasz Nodzyński, Qing Lu, Glenn R. Hicks, Wim Nerinckx, Kiril Mishev, François Peurois, Jacqueline Cherfils, Riet De Rycke, Peter Grones, Stéphanie Robert, Eugenia Russinova, Jiří Friml
Publié dans: The Plant Cell, Numéro 30/10, 2018, Page(s) 2553-2572, ISSN 1040-4651
Éditeur: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1105/tpc.18.00127

The Chara Genome: Secondary Complexity and Implications for Plant Terrestrialization

Auteurs: Tomoaki Nishiyama, Hidetoshi Sakayama, Jan de Vries, Henrik Buschmann, Denis Saint-Marcoux, Kristian K. Ullrich, Fabian B. Haas, Lisa Vanderstraeten, Dirk Becker, Daniel Lang, Stanislav Vosolsobě, Stephane Rombauts, Per K.I. Wilhelmsson, Philipp Janitza, Ramona Kern, Alexander Heyl, Florian Rümpler, Luz Irina A. Calderón Villalobos, John M. Clay, Roman Skokan, Atsushi Toyoda, Yutaka Suzuki, Hir
Publié dans: Cell, Numéro 174/2, 2018, Page(s) 448-464.e24, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2018.06.033

Evolution of fast root gravitropism in seed plants

Auteurs: Yuzhou Zhang, Guanghui Xiao, Xiaojuan Wang, Xixi Zhang, Jiří Friml
Publié dans: Nature Communications, Numéro 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-11471-8

Targeted cell ablation-based insights into wound healing and restorative patterning

Auteurs: Lukas Hoermayer, Jiří Friml
Publié dans: Current Opinion in Plant Biology, Numéro 52, 2019, Page(s) 124-130, ISSN 1369-5266
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.pbi.2019.08.006

Clathrin-mediated trafficking and PIN trafficking are required for auxin canalization and vascular tissue formation in Arabidopsis

Auteurs: Ewa Mazur, Michelle Gallei, Maciek Adamowski, Huibin Han, Hélène S. Robert, Jiří Friml
Publié dans: Plant Science, Numéro 293, 2020, Page(s) 110414, ISSN 0168-9452
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.plantsci.2020.110414

Auxin signalling in growth: Schrödinger’s cat out of the bag

Auteurs: Michelle Gallei, Christian Luschnig, Jiří Friml
Publié dans: Current Opinion in Plant Biology, Numéro 53, 2020, Page(s) 43-49, ISSN 1369-5266
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.pbi.2019.10.003

Salicylic Acid Targets Protein Phosphatase 2A to Attenuate Growth in Plants

Auteurs: Shutang Tan, Melinda Abas, Inge Verstraeten, Matouš Glanc, Gergely Molnár, Jakub Hajný, Pavel Lasák, Ivan Petřík, Eugenia Russinova, Jan Petrášek, Ondřej Novák, Jiří Pospíšil, Jiří Friml
Publié dans: Current Biology, Numéro 30/3, 2020, Page(s) 381-395.e8, ISSN 0960-9822
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2019.11.058

Auxin guides roots to avoid obstacles during gravitropic growth

Auteurs: Yuzhou Zhang, Jiří Friml
Publié dans: New Phytologist, Numéro 225/3, 2020, Page(s) 1049-1052, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.16203

PIN-driven auxin transport emerged early in streptophyte evolution

Auteurs: Roman Skokan, Eva Medvecká, Tom Viaene, Stanislav Vosolsobě, Marta Zwiewka, Karel Müller, Petr Skůpa, Michal Karady, Yuzhou Zhang, Dorina P. Janacek, Ulrich Z. Hammes, Karin Ljung, Tomasz Nodzyński, Jan Petrášek, Jiří Friml
Publié dans: Nature Plants, Numéro 5/11, 2019, Page(s) 1114-1119, ISSN 2055-0278
Éditeur: Nature Research
DOI: 10.1038/s41477-019-0542-5

Evolutionarily unique mechanistic framework of clathrin-mediated endocytosis in plants

Auteurs: Madhumitha Narasimhan, Alexander Johnson, Roshan Prizak, Walter Anton Kaufmann, Shutang Tan, Barbara Casillas-Pérez, Jiří Friml
Publié dans: eLife, Numéro 9, 2020, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.52067

Auxin canalization and vascular tissue formation by TIR1/AFB‐mediated auxin signaling in Arabidopsis

Auteurs: Ewa Mazur, Ivan Kulik, Jakub Hajný, Jiří Friml
Publié dans: New Phytologist, Numéro 226/5, 2020, Page(s) 1375-1383, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.16446

The lipid code-dependent phosphoswitch PDK1–D6PK activates PIN-mediated auxin efflux in Arabidopsis

Auteurs: Shutang Tan, Xixi Zhang, Wei Kong, Xiao-Li Yang, Gergely Molnár, Zuzana Vondráková, Roberta Filepová, Jan Petrášek, Jiří Friml, Hong-Wei Xue
Publié dans: Nature Plants, Numéro 6/5, 2020, Page(s) 556-569, ISSN 2055-0278
Éditeur: Nature Research
DOI: 10.1038/s41477-020-0648-9

Arabidopsis Flippases Cooperate with ARF GTPase Exchange Factors to Regulate the Trafficking and Polarity of PIN Auxin Transporters

Auteurs: Xixi Zhang, Maciek Adamowski, Petra Marhava, Shutang Tan, Yuzhou Zhang, Lesia Rodriguez, Marta Zwiewka, Vendula Pukyšová, Adrià Sans Sánchez, Vivek Kumar Raxwal, Christian S. Hardtke, Tomasz Nodzyński, Jiří Friml
Publié dans: The Plant Cell, Numéro 32/5, 2020, Page(s) 1644-1664, ISSN 1040-4651
Éditeur: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1105/tpc.19.00869

Directional auxin fluxes in plants by intramolecular domain–domain coevolution of PIN auxin transporters

Auteurs: Yuzhou Zhang, Corinna Hartinger, Xiaojuan Wang, Jiří Friml
Publié dans: New Phytologist, Numéro 227/5, 2020, Page(s) 1406-1416, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.16629

SCF TIR1 /AFB Auxin Signaling for Bending Termination during Shoot Gravitropism

Auteurs: Huibin Han, Hana Rakusová, Inge Verstraeten, Yuzhou Zhang, Jiří Friml
Publié dans: Plant Physiology, Numéro 183/1, 2020, Page(s) 37-40, ISSN 0032-0889
Éditeur: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1104/pp.20.00212

Wounding-induced changes in cellular pressure and localized auxin signalling spatially coordinate restorative divisions in roots

Auteurs: Lukas Hoermayer, Juan Carlos Montesinos, Petra Marhava, Eva Benková, Saiko Yoshida, Jiří Friml
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 117/26, 2020, Page(s) 15322-15331, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2003346117

Receptor kinase module targets PIN-dependent auxin transport during canalization

Auteurs: Jakub Hajný; Jakub Hajný; Tomáš Prát; Nikola Rydza; Lesia Rodriguez; Shutang Tan; Inge Verstraeten; David Domjan; Ewa Mazur; Ewa Mazur; Elwira Smakowska-Luzan; Elwira Smakowska-Luzan; Wouter Smet; Eliana Mor; Jonah Nolf; Bao-Jun Yang; Wim Grunewald; Gergely Molnár; Gergely Molnár; Youssef Belkhadir; Bert De Rybel; Jiří Friml
Publié dans: Science, Numéro 4, 2020, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aba3178

Functional innovations of PIN auxin transporters mark crucial evolutionary transitions during rise of flowering plants

Auteurs: Yuzhou Zhang, Lesia Rodriguez, Lanxin Li, Xixi Zhang, Jiří Friml
Publié dans: Science Advances, Numéro 6/50, 2020, Page(s) eabc8895, ISSN 2375-2548
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciadv.abc8895

Auxin-mediated statolith production for root gravitropism

Auteurs: 31. Zhang Y, He P, Ma X, Yang Z, Pang C, Yu J, Wang G, Friml J, Xiao G.
Publié dans: New Phytologist, 2019, ISSN 0028-646x
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.15932

Systematic analysis of specific and nonspecific auxin effects on endocytosis and trafficking

Auteurs: 6. Narasimhan M, Gallei M, Tan S, Johnson A, Verstraeten I, Li L, Rodriguez L, Han H, Himschoot E, Wang R, Vanneste S, Sánchez-Simarro J, Aniento F, Adamowski M, Friml J
Publié dans: Plant Physiology, 2021, ISSN 0032-0889
Éditeur: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1093/plphys/kiab134

Synaptotagmins at the endoplasmic reticulum-plasma membrane contact sites maintain diacylglycerol homeostasis during abiotic stress

Auteurs: 5. Ruiz-Lopez N, Pérez-Sancho J, Esteban Del Valle A, Haslam RP, Vanneste S, Catalá R, Perea-Resa C, Van Damme D, García-Hernández S, Albert A, Vallarino J, Lin J, Friml J, Macho AP, Salinas J, Rosado A, Napier JA, Amorim-Silva V, Botella MA.
Publié dans: Plant Cell, 2021, ISSN 1040-4651
Éditeur: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1093/plcell/koab122

Naphthylphthalamic acid associates with and inhibits PIN auxin transporters

Auteurs: Lindy Abas, Martina Kolb, Johannes Stadlmann, Dorina P. Janacek, Kristina Lukic, Claus Schwechheimer, Leonid A. Sazanov, Lukas Mach, Jiří Friml, Ulrich Z. Hammes
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 118/1, 2020, Page(s) e2020857118, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2020857118

Strigolactones inhibit auxin feedback on PIN-dependent auxin transport canalization.

Auteurs: Jing Zhang; Ewa Mazur; Ewa Mazur; Jozef Balla; Jozef Balla; Michelle Gallei; Petr Kalousek; Zuzana Medveďová; Yang Li; Yaping Wang; Tomáš Prát; Mina Vasileva; Vilém Reinöhl; Stanislav Procházka; Rostislav Halouzka; Petr Tarkowski; Christian Luschnig; Philip B. Brewer; Jiří Friml
Publié dans: Nature Communications, Numéro 1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-17252-y

Non-steroidal Anti-inflammatory Drugs Target TWISTED DWARF1-Regulated Actin Dynamics and Auxin Transport-Mediated Plant Development

Auteurs: Shutang Tan, Martin Di Donato, Matouš Glanc, Xixi Zhang, Petr Klíma, Jie Liu, Aurélien Bailly, Noel Ferro, Jan Petrášek, Markus Geisler, Jiří Friml
Publié dans: Cell Reports, Numéro 33/9, 2020, Page(s) 108463, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2020.108463

Book chapters (1)

Evaluation of gravitropism in non-seed plants

Auteurs: 41. Zhang Y, Li L, Friml J.
Publié dans: 2021, ISBN 978-1-0716-1676-5
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1007/978-1-0716-1677-2_2

Other (1)

Rapid and reversible root growth inhibition by TIR1 auxin signalling

Auteurs: 40. Fendrych M, Akhmanova M, Merrin J, Glanc M, Hagihara S, Takahashi K, Uchida N, Torii KU, Friml J.
Publié dans: Nature Plants, 2018
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41477-018-0190-1