Objectif
Droplet microfluidics has recently become one of the breakthrough technologies for high throughput screening in microbiology and biochemistry, including single cell studies and new approaches to in vitro evolution. Here we propose a development of a novel microfluidic system for unsupervised execution of multiple cycles of in vivo continuous evolution in hundreds of thousands of picoliter droplets. Each evolutionary cycle will comprise: i) encapsulation of single bacteria cells in water-in-oil compartments ii) growth of the cells coupled with production of economically relevant biomolecules iii) selection of the most efficient populations using ultra-high-throughput sorting of picodroplets, iv) dilution of each population via merging with 100 times larger nanoliter droplet containing fresh nutrients and v) passive splitting of each of the resulting nanoliter droplets to the libraries of picoliter droplets containing single cells. Confinement of the reaction in small volume and active sorting of droplets will facilitate and accelerate the process of in vivo evolution. Droplet format will also enable for various screening schemes, so far not available for continuous evolution strategies – e.g. based on high throughput fluorescence or absorbance measurements of the droplet content. The second stage of the project will comprise a series of proof-of-concept experiments presenting directed continuous evolution of the tryptophan synthase (TrpS) in E.coli bacteria. The technology proposed here would be very useful for broad community of biotechnologists, evolutionary biologists and industrial specialists without the experience in microfluidics. The proposed research will be conducted at Dr. Hollfelder´s laboratory that specializes in directed evolution of enzymes and application of microfluidics to industrial biotechnology. The project comprise broad and extensive training in research and complementary soft skills that will aid professional development of the Beneficiary.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences physiques mécanique classique mécanique des fluides microfluidics
- ingénierie et technologie biotechnologie industrielle
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2016
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
CB2 1TN CAMBRIDGE
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.