Obiettivo
Droplet microfluidics has recently become one of the breakthrough technologies for high throughput screening in microbiology and biochemistry, including single cell studies and new approaches to in vitro evolution. Here we propose a development of a novel microfluidic system for unsupervised execution of multiple cycles of in vivo continuous evolution in hundreds of thousands of picoliter droplets. Each evolutionary cycle will comprise: i) encapsulation of single bacteria cells in water-in-oil compartments ii) growth of the cells coupled with production of economically relevant biomolecules iii) selection of the most efficient populations using ultra-high-throughput sorting of picodroplets, iv) dilution of each population via merging with 100 times larger nanoliter droplet containing fresh nutrients and v) passive splitting of each of the resulting nanoliter droplets to the libraries of picoliter droplets containing single cells. Confinement of the reaction in small volume and active sorting of droplets will facilitate and accelerate the process of in vivo evolution. Droplet format will also enable for various screening schemes, so far not available for continuous evolution strategies – e.g. based on high throughput fluorescence or absorbance measurements of the droplet content. The second stage of the project will comprise a series of proof-of-concept experiments presenting directed continuous evolution of the tryptophan synthase (TrpS) in E.coli bacteria. The technology proposed here would be very useful for broad community of biotechnologists, evolutionary biologists and industrial specialists without the experience in microfluidics. The proposed research will be conducted at Dr. Hollfelder´s laboratory that specializes in directed evolution of enzymes and application of microfluidics to industrial biotechnology. The project comprise broad and extensive training in research and complementary soft skills that will aid professional development of the Beneficiary.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze fisiche meccanica classica meccanica dei fluidi microfluidics
- ingegneria e tecnologia biotecnologia industriale
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia batteriologia
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine enzimi
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMMA PRINCIPALE
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2016
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
CB2 1TN CAMBRIDGE
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.