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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Functional impact of alternative splicing coupled to nonsense-mediated decay in developing neurons

Objetivo

Differentiation of precursor cells into mature neurons relies on transcriptome-wide changes in gene expression that have to be coordinated in a precise spatiotemporal fashion. Alternative pre-mRNA splicing coupled to nonsense-mediated decay (AS-NMD) is a widespread post-transcriptional mechanism known to orchestrate gene expression dynamics in developmental contexts. Earlier studies identified several neural targets of this pathway; however, in most cases, the extent to which AS-NMD contributes to the overall gene expression dynamics and biological significance of this regulation is poorly understood. Moreover, whether AS-NMD target repertoire undergoes considerable changes in developing brain and how this might fit to the global regulation network underlying neuronal differentiation remains unclear. I will address these questions using two separate approaches. First, I will investigate novel AS-NMD targets encoding actin cytoskeleton factors and controlled by an important regulator of neuronal alternative splicing, Ptbp1. I will elucidate the extent of AS-NMD regulation in these genes by modulating the inclusion of the NMD-promoting exons with corresponding antisense oligonucleotides. in mouse embryonic stem cells undergoing neuronal differentiation, neural stem cells and primary neurons. Second, I will systematically analyse how NMD contributes to different stages of neuronal development by acutely inhibiting this pathway in a time-resolved manner using genetic means. I will then identify gene expression effects and functional consequences of NMD inactivation using transcriptome sequencing (RNA-Seq) and appropriate cell biological methods. All in all, this work will provide critical quantitative insights into AS-NMD functions and uncover novel mechanisms allowing neurons to attain their unique morphological and functional properties.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2016

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Coordinador

KING'S COLLEGE LONDON
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 183 454,80
Dirección
STRAND
WC2R 2LS London
Reino Unido

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Región
London Inner London — West Westminster
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 183 454,80
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