ABIOtic Synthesis of RNA: an investigation on how life started before biology existed

Informations projet

ABIOS

N° de convention de subvention: 757111

DOI

10.3030/757111

Projet clôturé

Date de signature de la CE 12 Septembre 2017

Date de début 1 Février 2018

Date de fin 31 Decembre 2024

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 497 031,00

Contribution de l’UE

€ 1 497 031,00

Coordonné par

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

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Publications

Peer reviewed articles (10)

Simulation-Guided Conformational Space Exploration to Assess Reactive Conformations of a Ribozyme

Auteurs: Sélène Forget, Marie Juillé, Élise Duboué-Dijon, Guillaume Stirnemann
Publié dans: Journal of Chemical Theory and Computation, 2024, ISSN 1549-9618
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.26434/chemrxiv-2024-cmtnf

ArcaNN: automated enhanced sampling generation of training sets for chemically reactive machine learning interatomic potentials

Auteurs: Rolf David, Miguel de la Puente, Axel Gomez, Olaia Anton, Guillaume Stirnemann, Damien Laage
Publié dans: Digital Discovery, Numéro 4, 2025, Page(s) 54-72, ISSN 2635-098X
Éditeur: RSC
DOI: 10.1039/d4dd00209a

Mass effects for thermodiffusion in dilute aqueous solutions

Auteurs: Alejandro Diaz-Marquez; Guillaume Stirnemann
Publié dans: The European Physical Journal E, Numéro 45, 2022, Page(s) 37, ISSN 1292-8941
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1140/epje/s10189-022-00193-3

Toward a Molecular Mechanism of Complementary RNA Duplexes Denaturation

Auteurs: Aimeric Dabin, Guillaume Stirnemann
Publié dans: The Journal of Physical Chemistry B, Numéro 127, 2023, Page(s) 6015-6028, ISSN 1520-6106
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.3c00908

Atomistic simulations of RNA duplex thermal denaturation: Sequence- and forcefield-dependence

Auteurs: Aimeric Dabin, Guillaume Stirnemann
Publié dans: Biophysical Chemistry, Numéro 307, 2024, Page(s) 107167, ISSN 0301-4622
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bpc.2023.107167

Molecular mechanisms of phosphoester bond formation in abiotic conditions with reactive neural network potentials

Auteurs: Zakarya Benayad, Rolf David, Guillaume Stirnemann
Publié dans: PNAS, 2023, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.26434/chemrxiv-2023-8c1mt

In silico all-atom approach to thermodiffusionin dilute aqueous solutions

Auteurs: Alejandro Diaz-Marquez; Guillaume Stirnemann
Publié dans: The Journal of Chemical Physics, Numéro 155, 2021, Page(s) 174503, ISSN 0021-9606
Éditeur: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0067756

Computer-aided comprehensive explorations of RNA structural polymorphism through complementary simulation methods

Auteurs: Konstantin Röder, Guillaume Stirnemann, Pietro Faccioli, Samuela Pasquali
Publié dans: QRB Discovery, Numéro 3, 2022, ISSN 2633-2892
Éditeur: QRB
DOI: 10.1017/qrd.2022.19

Effect of Ions on Water Dynamics in Dilute and Concentrated Aqueous Salt Solutions

Auteurs: Damien Laage, Guillaume Stirnemann
Publié dans: The Journal of Physical Chemistry B, Numéro 123/15, 2019, Page(s) 3312-3324, ISSN 1520-6106
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.9b01053

Molecular Mechanisms of Phosphoester Bond Formation in Water Using Tight-Binding Ab Initio Molecular Dynamics

Auteurs: Zakarya Benayad, Matthias Bova Saint-André, Guillaume Stirnemann
Publié dans: The Journal of Physical Chemistry B, Numéro 126, 2023, Page(s) 8251-8265, ISSN 1520-6106
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.2c04259