ABIOtic Synthesis of RNA: an investigation on how life started before biology existed

Informazioni relative al progetto

ABIOS

ID dell’accordo di sovvenzione: 757111

DOI

10.3030/757111

Progetto chiuso

Data della firma CE 12 Settembre 2017

Data di avvio 1 Febbraio 2018

Data di completamento 31 Dicembre 2024

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 497 031,00

Contributo UE

€ 1 497 031,00

Coordinato da

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (10)

Simulation-Guided Conformational Space Exploration to Assess Reactive Conformations of a Ribozyme

Autori: Sélène Forget, Marie Juillé, Élise Duboué-Dijon, Guillaume Stirnemann
Pubblicato in: Journal of Chemical Theory and Computation, 2024, ISSN 1549-9618
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.26434/chemrxiv-2024-cmtnf

ArcaNN: automated enhanced sampling generation of training sets for chemically reactive machine learning interatomic potentials

Autori: Rolf David, Miguel de la Puente, Axel Gomez, Olaia Anton, Guillaume Stirnemann, Damien Laage
Pubblicato in: Digital Discovery, Numero 4, 2025, Pagina/e 54-72, ISSN 2635-098X
Editore: RSC
DOI: 10.1039/d4dd00209a

Mass effects for thermodiffusion in dilute aqueous solutions

Autori: Alejandro Diaz-Marquez; Guillaume Stirnemann
Pubblicato in: The European Physical Journal E, Numero 45, 2022, Pagina/e 37, ISSN 1292-8941
Editore: Springer Verlag
DOI: 10.1140/epje/s10189-022-00193-3

Toward a Molecular Mechanism of Complementary RNA Duplexes Denaturation

Autori: Aimeric Dabin, Guillaume Stirnemann
Pubblicato in: The Journal of Physical Chemistry B, Numero 127, 2023, Pagina/e 6015-6028, ISSN 1520-6106
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.3c00908

Atomistic simulations of RNA duplex thermal denaturation: Sequence- and forcefield-dependence

Autori: Aimeric Dabin, Guillaume Stirnemann
Pubblicato in: Biophysical Chemistry, Numero 307, 2024, Pagina/e 107167, ISSN 0301-4622
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bpc.2023.107167

Molecular mechanisms of phosphoester bond formation in abiotic conditions with reactive neural network potentials

Autori: Zakarya Benayad, Rolf David, Guillaume Stirnemann
Pubblicato in: PNAS, 2023, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.26434/chemrxiv-2023-8c1mt

In silico all-atom approach to thermodiffusionin dilute aqueous solutions

Autori: Alejandro Diaz-Marquez; Guillaume Stirnemann
Pubblicato in: The Journal of Chemical Physics, Numero 155, 2021, Pagina/e 174503, ISSN 0021-9606
Editore: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0067756

Computer-aided comprehensive explorations of RNA structural polymorphism through complementary simulation methods

Autori: Konstantin Röder, Guillaume Stirnemann, Pietro Faccioli, Samuela Pasquali
Pubblicato in: QRB Discovery, Numero 3, 2022, ISSN 2633-2892
Editore: QRB
DOI: 10.1017/qrd.2022.19

Effect of Ions on Water Dynamics in Dilute and Concentrated Aqueous Salt Solutions

Autori: Damien Laage, Guillaume Stirnemann
Pubblicato in: The Journal of Physical Chemistry B, Numero 123/15, 2019, Pagina/e 3312-3324, ISSN 1520-6106
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.9b01053

Molecular Mechanisms of Phosphoester Bond Formation in Water Using Tight-Binding Ab Initio Molecular Dynamics

Autori: Zakarya Benayad, Matthias Bova Saint-André, Guillaume Stirnemann
Pubblicato in: The Journal of Physical Chemistry B, Numero 126, 2023, Pagina/e 8251-8265, ISSN 1520-6106
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.2c04259