Genomic basis of convergent evolution in the Trinidadian Guppy

Informations projet

GUPPYCon

N° de convention de subvention: 758382

DOI 10.3030/758382

Projet clôturé

Date de signature de la CE 26 Septembre 2017

Date de début 1 Janvier 2018

Date de fin 31 Mars 2024

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total € 1 488 763,00

Contribution de l’UE € 1 488 763,00

Coordonné par

THE UNIVERSITY OF EXETER
United Kingdom

Livrables

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Publications

Peer reviewed articles (7)

Improved reference genome uncovers novel sex-linked regions in the guppy (Poecilia reticulata)

Auteurs: Bonnie A Fraser, James R Whiting, Josephine R Paris, Cameron J Weadick, Paul J Parsons, Deborah Charlesworth, Roberta Bergero, Felix Bemm, Margarete Hoffmann, Verena A Kottler, Chang Liu, Christine Dreyer, Detlef Weigel
Publié dans: Genome Biology and Evolution, 2020, ISSN 1759-6653
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evaa187

Rapid genomic convergent evolution in experimental populations of Trinidadian guppies (Poecilia reticulata)

Auteurs: Mijke J van der Zee, James R Whiting, Josephine R Paris, Ron D Bassar, Joseph Travis, Detlef Weigel, David N Reznick, Bonnie A Fraser
Publié dans: Evolution Letters, 2022, ISSN 2056-3744
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1002/evl3.272

<scp>AF‐vapeR</scp>: A multivariate genome scan for detecting parallel evolution using allele frequency change vectors

Auteurs: James R. Whiting; Josephine R. Paris; Mijke J. van der Zee; Bonnie A. Fraser
Publié dans: Crossref, Numéro 2, 2022, ISSN 2041-210X
Éditeur: John Wiley and Sons Inc.
DOI: 10.1111/2041-210x.13952

What can be learned by scanning the genome for molecular convergence in wild populations?

Auteurs: Bonnie A. Fraser, James R. Whiting
Publié dans: Annals of the New York Academy of Sciences, 2019, Page(s) 1–20, ISSN 0077-8923
Éditeur: New York Academy of Sciences
DOI: 10.1111/nyas.14177

Contingent Convergence: The Ability To Detect Convergent Genomic Evolution Is Dependent on Population Size and Migration

Auteurs: James R. Whiting, Bonnie A. Fraser
Publié dans: "G3&amp;#58; Genes|Genomes|Genetics", Numéro 10/2, 2020, Page(s) 677-693, ISSN 2160-1836
Éditeur: Genetics Society of America
DOI: 10.1534/g3.119.400970

Drainage-structuring of ancestral variation and a common functional pathway shape limited genomic convergence in natural high- and low-predation guppies

Auteurs: James R. Whiting; Josephine R. Paris; Mijke J. van der Zee; Paul J. Parsons; Detlef Weigel; Bonnie A. Fraser
Publié dans: PLoS Genetics, Numéro 2, 2021, ISSN 1553-7390
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1101/2020.10.14.339333

On the genetic architecture of rapidly adapting and convergent life history traits in guppies

Auteurs: James R Whiting, Josephine R Paris, Paul J Parsons, Sophie Matthews, Yuridia Reynoso, Kimberly A Hughes, David Reznick, Bonnie A Fraser
Publié dans: Heredity, 2022, ISSN 0018-067X
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41437-022-00512-6