Genomic basis of convergent evolution in the Trinidadian Guppy

Informazioni relative al progetto

GUPPYCon

ID dell’accordo di sovvenzione: 758382

DOI 10.3030/758382

Progetto chiuso

Data della firma CE 26 Settembre 2017

Data di avvio 1 Gennaio 2018

Data di completamento 31 Marzo 2024

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale € 1 488 763,00

Contributo UE € 1 488 763,00

Coordinato da

THE UNIVERSITY OF EXETER
United Kingdom

Risultati finali

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (7)

Improved reference genome uncovers novel sex-linked regions in the guppy (Poecilia reticulata)

Autori: Bonnie A Fraser, James R Whiting, Josephine R Paris, Cameron J Weadick, Paul J Parsons, Deborah Charlesworth, Roberta Bergero, Felix Bemm, Margarete Hoffmann, Verena A Kottler, Chang Liu, Christine Dreyer, Detlef Weigel
Pubblicato in: Genome Biology and Evolution, 2020, ISSN 1759-6653
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gbe/evaa187

Rapid genomic convergent evolution in experimental populations of Trinidadian guppies (Poecilia reticulata)

Autori: Mijke J van der Zee, James R Whiting, Josephine R Paris, Ron D Bassar, Joseph Travis, Detlef Weigel, David N Reznick, Bonnie A Fraser
Pubblicato in: Evolution Letters, 2022, ISSN 2056-3744
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1002/evl3.272

<scp>AF‐vapeR</scp>: A multivariate genome scan for detecting parallel evolution using allele frequency change vectors

Autori: James R. Whiting; Josephine R. Paris; Mijke J. van der Zee; Bonnie A. Fraser
Pubblicato in: Crossref, Numero 2, 2022, ISSN 2041-210X
Editore: John Wiley and Sons Inc.
DOI: 10.1111/2041-210x.13952

What can be learned by scanning the genome for molecular convergence in wild populations?

Autori: Bonnie A. Fraser, James R. Whiting
Pubblicato in: Annals of the New York Academy of Sciences, 2019, Pagina/e 1–20, ISSN 0077-8923
Editore: New York Academy of Sciences
DOI: 10.1111/nyas.14177

Contingent Convergence: The Ability To Detect Convergent Genomic Evolution Is Dependent on Population Size and Migration

Autori: James R. Whiting, Bonnie A. Fraser
Pubblicato in: "G3&amp;#58; Genes|Genomes|Genetics", Numero 10/2, 2020, Pagina/e 677-693, ISSN 2160-1836
Editore: Genetics Society of America
DOI: 10.1534/g3.119.400970

Drainage-structuring of ancestral variation and a common functional pathway shape limited genomic convergence in natural high- and low-predation guppies

Autori: James R. Whiting; Josephine R. Paris; Mijke J. van der Zee; Paul J. Parsons; Detlef Weigel; Bonnie A. Fraser
Pubblicato in: PLoS Genetics, Numero 2, 2021, ISSN 1553-7390
Editore: Public Library of Science
DOI: 10.1101/2020.10.14.339333

On the genetic architecture of rapidly adapting and convergent life history traits in guppies

Autori: James R Whiting, Josephine R Paris, Paul J Parsons, Sophie Matthews, Yuridia Reynoso, Kimberly A Hughes, David Reznick, Bonnie A Fraser
Pubblicato in: Heredity, 2022, ISSN 0018-067X
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41437-022-00512-6