MicroRNA functions in single cells

Informations projet

miRCell

N° de convention de subvention: 758397

DOI

10.3030/758397

Projet clôturé

Date de signature de la CE 15 Novembre 2017

Date de début 1 Mars 2018

Date de fin 28 Février 2023

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 497 650,02

Contribution de l’UE

€ 1 497 650,02

Coordonné par

STOCKHOLMS UNIVERSITET
Sweden

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Publications

Other (1)

agoTRIBE detects miRNA-target interactions transcriptome-wide in single cells

Auteurs: Vaishnovi Sekar, Emilio Mármol-Sánchez, Panagiotis Kalogeropoulos, Laura Stanicek, Eduardo A. Sagredo, Evangelos Doukoumopoulos, Franziska Bonath, Inna Biryukova, Marc R. Friedländer
Publié dans: bioRxiv, 2022
Éditeur: bioRxiv
DOI: 10.1101/2022.08.10.503472

Peer reviewed articles (6)

MirGeneDB 2.1: toward a complete sampling of all major animal phyla.

Auteurs: "Fromm, Bastian; Hø ye, Eirik; Domanska, Diana; Zhong, Xiangfu; Aparicio-Puerta, Ernesto; Ovchinnikov, Vladimir; Umu, Sinan U; Chabot, Peter J; Kang, Wenjing; Aslanzadeh, Morteza; Tarbier, Marcel; Má rmol-Sá nchez, Emilio; Urgese, Gianvito; Johansen, Morten; Hovig, Eivind; Hackenberg, Michael; Friedlä nder, Marc R; Peterson, Kevin J"
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 13624962, 2022, ISSN 1362-4962
Éditeur: Oxford academic
DOI: 10.1093/nar/gkab1101

Nuclear gene proximity and protein interactions shape transcript covariations in mammalian single cells

Auteurs: Marcel Tarbier, Sebastian D. Mackowiak, João Frade, Silvina Catuara-Solarz, Inna Biryukova, Eleni Gelali, Diego Bárcena Menéndez, Luis Zapata, Stephan Ossowski, Magda Bienko, Caroline J. Gallant, Marc R. Friedländer
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-19011-5

MapToCleave: high-throughput profiling of microRNA biogenesis in living cells

Auteurs: Wenjing Kang; Bastian Fromm; Anna J.S. Houben; Eirik Høye; Daniela Bezdan; Carme Arnan; Kim Thrane; Michaela Asp; Rory Johnson; Inna Biryukova; Marc R. Friedländer
Publié dans: Cell Reports, 2021, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.48350/162005

The SWI/SNF subunit BRG1 affects alternative splicing by changing RNA binding factor interactions with nascent RNA

Auteurs: Antoni Gañez-Zapater; Sebastian D. Mackowiak; Yuan Guo; Marcel Tarbier; Antonio Jordán-Pla; Marc R. Friedländer; Neus Visa; Ann-Kristin Östlund Farrants
Publié dans: Molecular Genetics and Genomics, 2022, ISSN 1617-4615
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00438-022-01863-9

Combined mRNA and protein single cell analysis in a dynamic cellular system using SPARC

Auteurs: Johan Reimegård; Marcus Danielsson; Marcel Tarbier; Jens Schuster; Sathishkumar Baskaran; Styliani Panagiotou; Niklas Dahl; Marc R. Friedländer; Caroline J. Gallant
Publié dans: Nature Communications Biology, 2021, ISSN 2399-3642
Éditeur: NPG
DOI: 10.1038/s42003-021-02142-w

Cytoplasmic protein misfolding titrates Hsp70 to activate nuclear Hsf1

Auteurs: Anna E Masser; Wenjing Kang; Joydeep Roy; Jayasankar Mohanakrishnan Kaimal; Jany Quintana-Cordero; Marc R Friedländer; Claes Andréasson
Publié dans: eLife, 2019, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.47791