Objectif
Cell-to-cell variability is an inherent property of populations of cells. As a starting point for symmetry breaking events, it is also an essential building block for self-organised pattern forming systems. Nonetheless, the sources and roles of cell-to-cell variability in symmetry-breaking events during collective cell behavior await a quantitative and mechanistic understanding. To obtain these insights, we will use a model system of intestinal organoids, which recapitulates most of the processes of morphogenesis and patterning observed in intestinal tissue. In this system, the symmetry-breaking event is observed when, despite all single cells in a growing organoid are exposed to uniform environments, only a fraction of cells acquires specific cell fates, generating asymmetric structures such as crypts and villi. This project aims to uncover the extent, sources, and consequences of cell heterogeneity. To this end, we will use advanced multiplexed imaging of intestinal stem cells in 3D organoid development to monitor quantitatively the behaviour of each single cell in the system. Initially, we will identify potential sources of cell-to-cell variability, such as the microenvironment or the cell cycle. Next, we will create models to identify predictors of symmetry breaking and patterning. In parallel, we will determine the extent of cellular heterogeneity by single-cell RNA sequencing during organoid formation. Finally, we will test if cellular heterogeneity is necessary and sufficient to induce symmetry-breaking of intestinal organoids by experimentally inducing and perturbing cell-to-cell variability. Thus, this research proposal will address a major question in developmental biology and collective cell behavior, namely how single cells exposed to a uniform growth-promoting environment generate asymmetric structures. Moreover, it will unravel how local interactions between single cells give rise to emergent, self-organized patterns.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biologie du développement
- sciences médicales et de la santé biotechnologie médicale technologies cellulaires cellule souche
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN transcriptomes
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-STG - Starting Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2017-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
4056 BASEL
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.