Towards the Understanding a Metal-Tumour-Metabolism

Información del proyecto

ToMeTuM

Identificador del acuerdo de subvención: 759585

DOI

10.3030/759585

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 22 Noviembre 2017

Fecha de inicio 1 Enero 2018

Fecha de finalización 28 Febrero 2023

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 377 495,00

Aportación de la UE

€ 1 377 495,00

Coordinado por

VYSOKE UCENI TECHNICKE V BRNE
Czechia

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Publicaciones

Peer reviewed articles (21)

Hypoxia-inducible factors: master regulators of hypoxic tumor immune escape

Autores: Qinghua Wu; Li You; Eugenie Nepovimova; Zbynek Heger; Wenda Wu; Kamil Kuca; Vojtech Adam
Publicado en: Journal of Hematology & Oncology, Edición vol. 15, issue 1, 2022, Página(s) 1-18, ISSN 1756-8722
Editor: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13045-022-01292-6

Homology modeling in the time of collective and artificial intelligence

Autores: HAMEDUH; Tareq; Yazan Abdulmajeed Eyadh HADDAD; Vojtěch ADAM; Zbyněk HEGER
Publicado en: Computational and Structural Biotechnology Journal, Edición vol. 18, issue 1, 2021, Página(s) 3494-3506, ISSN 2001-0370
Editor: Elsevier
DOI: 10.1016/j.csbj.2020.11.007

The Anti-Proliferative Activity of Coordination Compound-Based ZnO Nanoparticles as a Promising Agent Against Triple Negative Breast Cancer Cells

Autores: Stepankova H; Swiatkowski M; Kruszynski R; Svec P; Michalkova H; Smolikova V; Ridoskova A; Splichal Z; Michalek P; Richtera L; Kopel P; Adam V; Heger Z; Rex S;
Publicado en: International Journal of Nanomedicine, Edición vol. 16, issue 1, 2021, Página(s) 4431-4449, ISSN 1178-2013
Editor: Dove Press
DOI: 10.2147/ijn.s304902

Metallothionein dimerization evidenced by QD-based Förster resonance energy transfer and capillary electrophoresis

Autores: PAVELICOVÁ, K.; POMPEIANO VANÍČKOVÁ, L.; HADDAD, Y.; NEJDL, L.; ZÍTKA, J.; KOČIOVÁ, S.; MRAVEC, F.; VACULOVIČ, T.; MACKA, M.; VACULOVIČOVÁ, M.; ADAM, V.
Publicado en: International Journal of Biological Macromolecules, Edición Volume 170, 2021, Página(s) 53-60, ISSN 0141-8130
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2020.12.105

Metal- and Affinity-Specific Dual Labeling of Cysteine-Rich Proteins for Identification of Metal-Binding Sites

Autores: Manuel David Peris-Díaz, Roman Guran, Ondrej Zitka, Vojtech Adam, Artur Krężel
Publicado en: Analytical Chemistry, Edición 92/19, 2020, Página(s) 12950-12958, ISSN 0003-2700
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.0c01604

Metallothionein-3 promotes cisplatin chemoresistance remodelling in neuroblastoma

Autores: Miguel Angel Merlos Rodrigo, Hana Michalkova, Vladislav Strmiska, Berta Casar, Piero Crespo, Vivian de los Rios, J. Ignacio Casal, Yazan Haddad, Roman Guran, Tomas Eckschlager, Petra Pokorna, Zbynek Heger, Vojtech Adam
Publicado en: Scientific Report, Edición vol. 11, issue 1, 2021, Página(s) 1-14, ISSN 2045-2322
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-84185-x

Mass Spectrometry-Based Structural Analysis of Cysteine-Rich Metal-Binding Sites in Proteins with MetaOdysseus R Software

Autores: Manuel David Peris-Díaz, Roman Guran, Ondrej Zitka, Vojtech Adam, Artur Krężel
Publicado en: Journal of Proteome Research, Edición vol. 20, issue 1, 2020, Página(s) 776-785, ISSN 1535-3893
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jproteome.0c00651

Proteomic Signature of Neuroblastoma Cells UKF-NB-4 Reveals Key Role of Lysosomal Sequestration and the Proteasome Complex in Acquiring Chemoresistance to Cisplatin

Autores: Miguel Angel Merlos Rodrigo, Hana Buchtelova, Vivian de los Rios, José Ignacio Casal, Tomas Eckschlager, Jan Hrabeta, Marie Belhajova, Zbynek Heger, Vojtech Adam
Publicado en: Journal of Proteome Research, Edición 18/3, 2019, Página(s) 1255-1263, ISSN 1535-3893
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jproteome.8b00867

Molecularly imprinted polymers coupled to mass spectrometric detection for metallothionein sensing

Autores: Tereza Vaneckova, Lucie Vanickova, Michaela Tvrdonova, Adam Pomorski, Artur Krężel, Tomas Vaculovic, Viktor Kanicky, Marketa Vaculovicova, Vojtech Adam
Publicado en: Talanta, Edición 198, 2019, Página(s) 224-229, ISSN 0039-9140
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.talanta.2019.01.089

Transcriptomic Landscape of Cisplatin-Resistant Neuroblastoma Cells

Autores: Miguel Rodrigo, Hana Buchtelova, Ana Jimenez, Pavlina Adam, Petr Babula, Zbynek Heger, Vojtech Adam
Publicado en: Cells, Edición 8/3, 2019, Página(s) 235, ISSN 2073-4409
Editor: MDPI AG
DOI: 10.3390/cells8030235

Mass spectrometric imaging of cysteine rich proteins in human skin

Autores: Lucie Vanickova, Roman Guran, Sándor Kollár, Gabriella Emri, Sona Krizkova, Tomas Do, Zbynek Heger, Ondrej Zitka, Vojtech Adam
Publicado en: International Journal of Biological Macromolecules, Edición 125, 2019, Página(s) 270-277, ISSN 0141-8130
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2018.11.272

Rotamer Dynamics: Analysis of Rotamers in Molecular Dynamics Simulations of Proteins

Autores: Yazan Haddad, Vojtech Adam, Zbynek Heger
Publicado en: Biophysical Journal, Edición 116/11, 2019, Página(s) 2062-2072, ISSN 0006-3495
Editor: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2019.04.017

Ten quick tips for homology modeling of high-resolution protein 3D structures

Autores: Yazan Haddad, Vojtech Adam, Zbynek Heger
Publicado en: PLOS Computational Biology, Edición 16/4, 2020, Página(s) e1007449, ISSN 1553-7358
Editor: PLOS Computational Biology
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1007449

A chemometric-assisted voltammetric analysis of free and Zn(II)-loaded metallothionein-3 states

Autores: Manuel David Peris-Díaz, Lukas Richtera, Ondrej Zitka, Artur Krężel, Vojtech Adam
Publicado en: Bioelectrochemistry, Edición 134, 2020, Página(s) 107501, ISSN 1567-5394
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bioelechem.2020.107501

Metallothionein isoforms as double agents – Their roles in carcinogenesis, cancer progression and chemoresistance

Autores: Miguel Angel Merlos Rodrigo, Ana Maria Jimenez Jimemez, Yazan Haddad, Khaldon Bodoor, Pavlina Adam, Sona Krizkova, Zbynek Heger, Vojtech Adam
Publicado en: Drug Resistance Updates, Edición 52, 2020, Página(s) 100691, ISSN 1368-7646
Editor: Churchill Livingstone
DOI: 10.1016/j.drup.2020.100691

Efficient Protein Transfection by Swarms of Chemically Powered Plasmonic Virus-Sized Nanorobots

Autores: Alzbeta Ressnerova, Filip Novotny, Hana Michalkova, Martin Pumera, Vojtech Adam, Zbynek Heger
Publicado en: ACS Nano, Edición vol. 15, issue 8, 2021, Página(s) p. 12899-12910, ISSN 1936-0851
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.1c01172

Signal Transducer and Activator of Transcription 3 Signaling in Tumor Immune Evasion

Autores: Zhang, Luying; Kuča, Kamil; You, Li; Zhao, Yingying; Musílek, Kamil; Nepovimová, Eugenie; Wu, Qinghua; Wu, Wenda; Adam, Vojtěch
Publicado en: PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS, Edición vol. 230, issue 1, 2022, Página(s) 1-11, ISSN 0163-7258
Editor: Pergamon Press
DOI: 10.1016/j.pharmthera.2021.107969

A rotamer relay information system in the epidermal growth factor receptor-drug complexes reveals clues to new paradigm in protein conformational change.

Autores: Tareq Hameduh; Michal Mokry; Michal Mokry; Andrew D. Miller; Vojtech Adam; Vojtech Adam; Zbynek Heger; Zbynek Heger; Yazan Haddad; Yazan Haddad
Publicado en: Computational and Structural Biotechnology Journal, Edición vol. 19, issue 1, 2021, Página(s) 5443-5454, ISSN 2001-0370
Editor: Elsevier
DOI: 10.1016/j.csbj.2021.09.026

Extending the Applicability of In Ovo and Ex Ovo Chicken Chorioallantoic Membrane Assays to Study Cytostatic Activity in Neuroblastoma Cells.

Autores: Miguel Angel Merlos Rodrigo; Miguel Angel Merlos Rodrigo; Berta Casar; Berta Casar; Hana Michalkova; Hana Michalkova; Ana Maria Jimenez Jimenez; Ana Maria Jimenez Jimenez; Zbynek Heger; Zbynek Heger; Vojtech Adam; Vojtech Adam
Publicado en: Frontiers in Oncology, Vol 11, Edición vol. 11, issue 9, 2021, Página(s) 1-10, ISSN 2234-943X
Editor: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fonc.2021.707366

The role of hypoxia-inducible factor 1 in tumor immune evasion.

Autores: Li You; Wenda Wu; Wenda Wu; Xu Wang; Liurong Fang; Vojtech Adam; Vojtech Adam; Eugenie Nepovimova; Qinghua Wu; Qinghua Wu; Kamil Kuca
Publicado en: MEDICINAL RESEARCH REVIEWS, Edición vol. 41, issue 3, 2021, Página(s) p. 1622-1643, ISSN 0198-6325
Editor: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/med.21771

An Integrated Mass Spectrometry and Molecular Dynamics Simulations Approach Reveals the Spatial Organization Impact of Metal-Binding Sites on the Stability of Metal-Depleted Metallothionein-2 Species.

Autores: Manuel David Peris-Díaz; Roman Guran; Roman Guran; Carmen Domene; Carmen Domene; Vivian de los Ríos; Ondrej Zitka; Ondrej Zitka; Vojtech Adam; Vojtech Adam; Artur Krężel
Publicado en: Journal of the American Chemical Society, Edición vol. 143, issue 40, 2021, Página(s) 16486-16501, ISSN 0002-7863
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c05495