Towards the Understanding a Metal-Tumour-Metabolism

Projektinformationen

ToMeTuM

ID Finanzhilfevereinbarung: 759585

DOI

10.3030/759585

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 22 November 2017

Startdatum 1 Januar 2018

Enddatum 28 Februar 2023

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 377 495,00

EU-Beitrag

€ 1 377 495,00

Koordiniert durch

VYSOKE UCENI TECHNICKE V BRNE
Czechia

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (21)

Hypoxia-inducible factors: master regulators of hypoxic tumor immune escape

Autoren: Qinghua Wu; Li You; Eugenie Nepovimova; Zbynek Heger; Wenda Wu; Kamil Kuca; Vojtech Adam
Veröffentlicht in: Journal of Hematology & Oncology, Ausgabe vol. 15, issue 1, 2022, Seite(n) 1-18, ISSN 1756-8722
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13045-022-01292-6

Homology modeling in the time of collective and artificial intelligence

Autoren: HAMEDUH; Tareq; Yazan Abdulmajeed Eyadh HADDAD; Vojtěch ADAM; Zbyněk HEGER
Veröffentlicht in: Computational and Structural Biotechnology Journal, Ausgabe vol. 18, issue 1, 2021, Seite(n) 3494-3506, ISSN 2001-0370
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.csbj.2020.11.007

The Anti-Proliferative Activity of Coordination Compound-Based ZnO Nanoparticles as a Promising Agent Against Triple Negative Breast Cancer Cells

Autoren: Stepankova H; Swiatkowski M; Kruszynski R; Svec P; Michalkova H; Smolikova V; Ridoskova A; Splichal Z; Michalek P; Richtera L; Kopel P; Adam V; Heger Z; Rex S;
Veröffentlicht in: International Journal of Nanomedicine, Ausgabe vol. 16, issue 1, 2021, Seite(n) 4431-4449, ISSN 1178-2013
Herausgeber: Dove Press
DOI: 10.2147/ijn.s304902

Metallothionein dimerization evidenced by QD-based Förster resonance energy transfer and capillary electrophoresis

Autoren: PAVELICOVÁ, K.; POMPEIANO VANÍČKOVÁ, L.; HADDAD, Y.; NEJDL, L.; ZÍTKA, J.; KOČIOVÁ, S.; MRAVEC, F.; VACULOVIČ, T.; MACKA, M.; VACULOVIČOVÁ, M.; ADAM, V.
Veröffentlicht in: International Journal of Biological Macromolecules, Ausgabe Volume 170, 2021, Seite(n) 53-60, ISSN 0141-8130
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2020.12.105

Metal- and Affinity-Specific Dual Labeling of Cysteine-Rich Proteins for Identification of Metal-Binding Sites

Autoren: Manuel David Peris-Díaz, Roman Guran, Ondrej Zitka, Vojtech Adam, Artur Krężel
Veröffentlicht in: Analytical Chemistry, Ausgabe 92/19, 2020, Seite(n) 12950-12958, ISSN 0003-2700
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.0c01604

Metallothionein-3 promotes cisplatin chemoresistance remodelling in neuroblastoma

Autoren: Miguel Angel Merlos Rodrigo, Hana Michalkova, Vladislav Strmiska, Berta Casar, Piero Crespo, Vivian de los Rios, J. Ignacio Casal, Yazan Haddad, Roman Guran, Tomas Eckschlager, Petra Pokorna, Zbynek Heger, Vojtech Adam
Veröffentlicht in: Scientific Report, Ausgabe vol. 11, issue 1, 2021, Seite(n) 1-14, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-84185-x

Mass Spectrometry-Based Structural Analysis of Cysteine-Rich Metal-Binding Sites in Proteins with MetaOdysseus R Software

Autoren: Manuel David Peris-Díaz, Roman Guran, Ondrej Zitka, Vojtech Adam, Artur Krężel
Veröffentlicht in: Journal of Proteome Research, Ausgabe vol. 20, issue 1, 2020, Seite(n) 776-785, ISSN 1535-3893
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jproteome.0c00651

Proteomic Signature of Neuroblastoma Cells UKF-NB-4 Reveals Key Role of Lysosomal Sequestration and the Proteasome Complex in Acquiring Chemoresistance to Cisplatin

Autoren: Miguel Angel Merlos Rodrigo, Hana Buchtelova, Vivian de los Rios, José Ignacio Casal, Tomas Eckschlager, Jan Hrabeta, Marie Belhajova, Zbynek Heger, Vojtech Adam
Veröffentlicht in: Journal of Proteome Research, Ausgabe 18/3, 2019, Seite(n) 1255-1263, ISSN 1535-3893
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jproteome.8b00867

Molecularly imprinted polymers coupled to mass spectrometric detection for metallothionein sensing

Autoren: Tereza Vaneckova, Lucie Vanickova, Michaela Tvrdonova, Adam Pomorski, Artur Krężel, Tomas Vaculovic, Viktor Kanicky, Marketa Vaculovicova, Vojtech Adam
Veröffentlicht in: Talanta, Ausgabe 198, 2019, Seite(n) 224-229, ISSN 0039-9140
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.talanta.2019.01.089

Transcriptomic Landscape of Cisplatin-Resistant Neuroblastoma Cells

Autoren: Miguel Rodrigo, Hana Buchtelova, Ana Jimenez, Pavlina Adam, Petr Babula, Zbynek Heger, Vojtech Adam
Veröffentlicht in: Cells, Ausgabe 8/3, 2019, Seite(n) 235, ISSN 2073-4409
Herausgeber: MDPI AG
DOI: 10.3390/cells8030235

Mass spectrometric imaging of cysteine rich proteins in human skin

Autoren: Lucie Vanickova, Roman Guran, Sándor Kollár, Gabriella Emri, Sona Krizkova, Tomas Do, Zbynek Heger, Ondrej Zitka, Vojtech Adam
Veröffentlicht in: International Journal of Biological Macromolecules, Ausgabe 125, 2019, Seite(n) 270-277, ISSN 0141-8130
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2018.11.272

Rotamer Dynamics: Analysis of Rotamers in Molecular Dynamics Simulations of Proteins

Autoren: Yazan Haddad, Vojtech Adam, Zbynek Heger
Veröffentlicht in: Biophysical Journal, Ausgabe 116/11, 2019, Seite(n) 2062-2072, ISSN 0006-3495
Herausgeber: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2019.04.017

Ten quick tips for homology modeling of high-resolution protein 3D structures

Autoren: Yazan Haddad, Vojtech Adam, Zbynek Heger
Veröffentlicht in: PLOS Computational Biology, Ausgabe 16/4, 2020, Seite(n) e1007449, ISSN 1553-7358
Herausgeber: PLOS Computational Biology
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1007449

A chemometric-assisted voltammetric analysis of free and Zn(II)-loaded metallothionein-3 states

Autoren: Manuel David Peris-Díaz, Lukas Richtera, Ondrej Zitka, Artur Krężel, Vojtech Adam
Veröffentlicht in: Bioelectrochemistry, Ausgabe 134, 2020, Seite(n) 107501, ISSN 1567-5394
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bioelechem.2020.107501

Metallothionein isoforms as double agents – Their roles in carcinogenesis, cancer progression and chemoresistance

Autoren: Miguel Angel Merlos Rodrigo, Ana Maria Jimenez Jimemez, Yazan Haddad, Khaldon Bodoor, Pavlina Adam, Sona Krizkova, Zbynek Heger, Vojtech Adam
Veröffentlicht in: Drug Resistance Updates, Ausgabe 52, 2020, Seite(n) 100691, ISSN 1368-7646
Herausgeber: Churchill Livingstone
DOI: 10.1016/j.drup.2020.100691

Efficient Protein Transfection by Swarms of Chemically Powered Plasmonic Virus-Sized Nanorobots

Autoren: Alzbeta Ressnerova, Filip Novotny, Hana Michalkova, Martin Pumera, Vojtech Adam, Zbynek Heger
Veröffentlicht in: ACS Nano, Ausgabe vol. 15, issue 8, 2021, Seite(n) p. 12899-12910, ISSN 1936-0851
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.1c01172

Signal Transducer and Activator of Transcription 3 Signaling in Tumor Immune Evasion

Autoren: Zhang, Luying; Kuča, Kamil; You, Li; Zhao, Yingying; Musílek, Kamil; Nepovimová, Eugenie; Wu, Qinghua; Wu, Wenda; Adam, Vojtěch
Veröffentlicht in: PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS, Ausgabe vol. 230, issue 1, 2022, Seite(n) 1-11, ISSN 0163-7258
Herausgeber: Pergamon Press
DOI: 10.1016/j.pharmthera.2021.107969

A rotamer relay information system in the epidermal growth factor receptor-drug complexes reveals clues to new paradigm in protein conformational change.

Autoren: Tareq Hameduh; Michal Mokry; Michal Mokry; Andrew D. Miller; Vojtech Adam; Vojtech Adam; Zbynek Heger; Zbynek Heger; Yazan Haddad; Yazan Haddad
Veröffentlicht in: Computational and Structural Biotechnology Journal, Ausgabe vol. 19, issue 1, 2021, Seite(n) 5443-5454, ISSN 2001-0370
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.csbj.2021.09.026

Extending the Applicability of In Ovo and Ex Ovo Chicken Chorioallantoic Membrane Assays to Study Cytostatic Activity in Neuroblastoma Cells.

Autoren: Miguel Angel Merlos Rodrigo; Miguel Angel Merlos Rodrigo; Berta Casar; Berta Casar; Hana Michalkova; Hana Michalkova; Ana Maria Jimenez Jimenez; Ana Maria Jimenez Jimenez; Zbynek Heger; Zbynek Heger; Vojtech Adam; Vojtech Adam
Veröffentlicht in: Frontiers in Oncology, Vol 11, Ausgabe vol. 11, issue 9, 2021, Seite(n) 1-10, ISSN 2234-943X
Herausgeber: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fonc.2021.707366

The role of hypoxia-inducible factor 1 in tumor immune evasion.

Autoren: Li You; Wenda Wu; Wenda Wu; Xu Wang; Liurong Fang; Vojtech Adam; Vojtech Adam; Eugenie Nepovimova; Qinghua Wu; Qinghua Wu; Kamil Kuca
Veröffentlicht in: MEDICINAL RESEARCH REVIEWS, Ausgabe vol. 41, issue 3, 2021, Seite(n) p. 1622-1643, ISSN 0198-6325
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/med.21771

An Integrated Mass Spectrometry and Molecular Dynamics Simulations Approach Reveals the Spatial Organization Impact of Metal-Binding Sites on the Stability of Metal-Depleted Metallothionein-2 Species.

Autoren: Manuel David Peris-Díaz; Roman Guran; Roman Guran; Carmen Domene; Carmen Domene; Vivian de los Ríos; Ondrej Zitka; Ondrej Zitka; Vojtech Adam; Vojtech Adam; Artur Krężel
Veröffentlicht in: Journal of the American Chemical Society, Ausgabe vol. 143, issue 40, 2021, Seite(n) 16486-16501, ISSN 0002-7863
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c05495