Objectif
In eukaryotes, the complex regulation of temporal- and tissue-specific gene expression is controlled by the binding of transcription factors to enhancers, which in turn interact with the promoter of their target gene(s) via the formation of a chromatin loop. Despite their importance, the properties governing enhancer function and enhancer-promoter loops in the context of the three-dimensional organisation of the genome are still poorly understood.
My recent work suggests that (i) developmental genes are often regulated by multiple enhancers, sometimes located at great linear distances, (ii) the spatio-temporal activity of a large fraction of those enhancers remains unknown, (iii) enhancer-promoter interactions are usually established before the target gene is expressed and are largely stable during embryogenesis, and (iv) stable interactions seem to be associated with the presence of paused RNA Polymerase II at the promoter before gene activation.
Building upon these results, we propose to advance to the next level in the dissection of enhancer-promoter interaction functionality in the context of Drosophila embryogenesis. Specifically, we will address three important questions: (i) What determines the specificity of promoter-enhancer interactions in a complex genome? (ii) Are enhancer-promoter interactions tissue-specific, and what are the drivers of this specificity? (iii) Are all enhancer-promoter interactions functional, and how does the activity of an enhancer relate to the expression of the gene it interacts with?
To this end, my group will apply an interdisciplinary approach, combining state-of-the-art methods in genetics and genomics, including novel single-cell techniques, using Drosophila embryogenesis as a model system. Our results will provide a unique view of the functionality of enhancer-promoter interactions in a developing embryo, a significant step towards understanding the link between chromatin organisation and transcription regulation.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
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ERC-STG - Starting Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2017-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75794 PARIS
France
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