In situ Structural Analysis of Molecular Crowding and Phase Separation

Informations projet

3DCellPhase-

N° de convention de subvention: 760067

DOI

10.3030/760067

Projet clôturé

Date de signature de la CE 16 Novembre 2017

Date de début 1 Février 2018

Date de fin 31 Decembre 2023

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 228 125,00

Contribution de l’UE

€ 1 228 125,00

Coordonné par

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Germany

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (17)

Molecular mechanisms of stress-induced reactivation in mumps virus condensates

Auteurs: Zhang X, Sridharan S, Zagoriy I, Eugster Oegema C, Ching C, Pflaesterer T, Fung KHH, Poser I, Müller C, Hyman AA, Savitski M, Mahamid J
Publié dans: Cell, 2023, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.03.015

Addressing the challenge of in situ structural studies of RNP granules in light of emerging opportunities

Auteurs: Zhang X, Mahamid J
Publié dans: Current Opinion in Structural Biology, 2020, ISSN 0959-440X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2020.06.012

Liquid-to-solid phase transition of oskar ribonucleoprotein granules is essential for their function in Drosophila embryonic development.

Auteurs: Bose M, Lampe M, Mahamid J, Ephrussi A
Publié dans: Cell, 2022, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2022.02.022

RNA-Induced Conformational Switching and Clustering of G3BP Drive Stress Granule Assembly by Condensation

Auteurs: Jordina Guillén-Boixet,1,8 Andrii Kopach,3,8 Alex S. Holehouse,2,7 Sina Wittmann,3 Marcus Jahnel,1,3 Raimund Schlüßler,1 Kyoohyun Kim,1 Irmela R.E.A. Trussina,1 Jie Wang,3 Daniel Mateju,3,9 Ina Poser,3 Shovamayee Maharana,1 Martine Ruer-Gruß,3 Doris Richter,1 Xiaojie Zhang,6 Young-Tae Chang,4,5 Jochen Guck,1 Alf Honigmann,3 Julia Mahamid,6 Anthony A. Hyman,3 Rohit V. Pappu,2 Simon Alberti,1,3,
Publié dans: Cell, 2020, ISSN 1097-4172
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2020.03.049

Visualizing molecular architectures of cellular condensates: hints of complex coacervation scenarios

Auteurs: Goetz SK, Mahamid J
Publié dans: Developmental Cell, 2020, ISSN 1534-5807
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2020.09.003

Convolutional networks for supervised mining of molecular patterns within cellular context

Auteurs: Irene de Teresa; Sara K. Goetz; Alexander Mattausch; Frosina Stojanovska; Christian E. Zimmerli; Mauricio Toro-Nahuelpan; Dorothy W.C. Cheng; Fergus Tollervey; Constantin Pape; Martin Beck; Anna Kreshuk; Julia Mahamid; Judith Zaugg
Publié dans: Nature Methods, Numéro 1, 2023, ISSN 1548-7105
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41592-022-01746-2

Nuclear pores dilate and constrict in cellulo

Auteurs: Zimmerli CE, Allegretti M, Rantos V, Goetz SK, Obarska-Kosinska A, Zagoriy I, Halavatyi A, Hummer G, Mahamid J, Kosinski J, Beck M
Publié dans: Science, 2021, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.abd9776

Multi-particle cryo-EM refinement with M visualizes ribosome-antibiotic complex at 3.5 Å in cells

Auteurs: Dimitry Tegunov, Liang Xue, Christian Dienemann, Patrick Cramer, Julia Mahamid
Publié dans: Nature Methods, Numéro 18/2, 2021, Page(s) 186-193, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-020-01054-7

In-cell architecture of an actively transcribing-translating expressome

Auteurs: Francis J. O’Reilly; Liang Xue; Andrea Graziadei; Ludwig Sinn; Swantje Lenz; Dimitry Tegunov; Cedric Blötz; Wim J. H. Hagen; Patrick Cramer; Jörg Stülke; Julia Mahamid; Juri Rappsilber
Publié dans: Science, Numéro 1, 2020, ISSN 1095-9203
Éditeur: American Association for the Advancement of Scienc
DOI: 10.1101/2020.02.28.970111

In cell architecture of the nuclear pore complex and snapshots of its turnover

Auteurs: Matteo Allegretti; Christian E. Zimmerli; Vasileios Rantos; Florian Wilfling; Paolo Ronchi; Herman K.H. Fung; Chia-Wei Lee; Wim Hagen; Beata Turonova; Kai Karius; Xiaojie Zhang; Christoph Müller; Yannick Schwab; Julia Mahamid; Boris Pfander; Jan Kosinski; Martin Beck
Publié dans: Nature, Numéro 1, 2020, ISSN 1476-4687
Éditeur: Macmillan Journals ltd.
DOI: 10.1101/2020.02.04.933820

A cryo-FIB lift-out technique enables molecular-resolution cryo-ET within native Caenorhabditis elegans tissue

Auteurs: Miroslava Schaffer, Stefan Pfeffer, Julia Mahamid, Stephan Kleindiek, Tim Laugks, Sahradha Albert, Benjamin D. Engel, Andreas Rummel, Andrew J. Smith, Wolfgang Baumeister, Juergen M. Plitzko
Publié dans: Nature Methods, Numéro 16/8, 2019, Page(s) 757-762, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-019-0497-5

High-precision targeting workflow for volume electron microscopy.

Auteurs: Ronchi P, Mizzon G, Machado P, D'Imprima E, Best BT, Cassella L, Schnorrenberg S, Montero MG, Jechlinger M, Ephrussi A, Leptin M, Mahamid J, Schwab Y
Publié dans: journal of cell biology, 2021, ISSN 0021-9525
Éditeur: Rockefeller University Press
DOI: 10.1083/jcb.202104069

Intracellular nanoscale architecture as a master regulator of calcium carbonate crystallization in marine microalgae

Auteurs: Kadan Y, Tollervey F, Varsano N, Mahamid J, Gal A
Publié dans: PNAS, Numéro 00278424, 2021, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2025670118

Protein condensates as aging Maxwell fluids

Auteurs: Louise Jawerth, Elisabeth Fischer-Friedrich, Suropriya Saha, Jie Wang, Titus Franzmann, Xiaojie Zhang, Jenny Sachweh, Martine Ruer, Mahdiye Ijavi, Shambaditya Saha, Julia Mahamid, Anthony A. Hyman, Frank Jülicher
Publié dans: Science, Numéro 370/6522, 2020, Page(s) 1317-1323, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aaw4951

A modular platform for automated cryo-FIB workflows.

Auteurs: Klumpe S, Fung HKH, Goetz SK, Zagoriy I, Hampoelz B, Zhang X, Erdmann PS, Baumbach J, Müller CW, Beck M, Plitzko JM, Mahamid J
Publié dans: elife, 2021, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.70506

Locating macromolecular assemblies in cells by 2D template matching with cisTEM.

Auteurs: Bronwyn A Lucas; Benjamin A Himes; Liang Xue; Timothy Grant; Julia Mahamid; Nikolaus Grigorieff
Publié dans: eLife, Numéro 2050084X, 2021, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.68946

Tailoring cryo-electron microscopy grids by photo-micropatterning for in-cell structural studies

Auteurs: Mauricio Toro-Nahuelpan; Ievgeniia Zagoriy; Fabrice Senger; Laurent Blanchoin; Manuel Théry; Julia Mahamid
Publié dans: Nature Methods, Numéro 1, 2020, ISSN 1548-7105
Éditeur: Nature Pub. Group
DOI: 10.1101/676189

Book chapters (1)

Cryo-Electron Tomography of Reconstituted Biomolecular Condensate

Auteurs: Tollervey F, Zhang X, Bose M, Sachweh J, Woodruff JB, Franzmann TM, Mahamid J
Publié dans: Methods in Molecular Biology - volume on “Phase-Separated Biomolecular Condensates”, Numéro MIMB,volume 2563, 2022, Page(s) pp 297–324, ISBN 978-1-0716-2663-4
Éditeur: Springer
DOI: 10.1007/978-1-0716-2663-4_15