Objetivo
In dilution cultures, marine planktonic Archaea are subject to mortality due to viral lysis. It has been shown that the frequency of lysogenized bacterial cells increases with depth and that marine Archaea constitute a numerically dominant group in the meso- and bathypelagic zone. These recent findings serve as the motivation for the proposed project, which is addressing the lack of knowledge on the functional role of planktonic Archaea in the meso- and bathypelagic zone by studying the relationship to thei r viruses.
The first objective is to determine the phylogenetic affiliation (Bacteria, Euryarchaeota, Crenarchaeota) of the lysogenized cells and to determine changes over depth. Objective one will be tackled by using a virus-dilution approach to measure t he fraction of lysogenized prokaryotic cells in combination with catalysed reporter deposition fluorescence in situ hybridisation (CARD-FISH) to determine the phylogenetic affiliation of the bacterial cells.
The second objective is to determine the dynamic s of dominant populations of lytic and lysogenic viruses and their hosts over depth and across seasons in relation to total virio- and bacterioplankton community composition. This will be achieved by using population specific virioplankton probes, prepared by randomly amplified polymorphic DNA polymerase chain reaction (RAPD-PCR). Subsequently, these probes will be used to identify dominant populations of lytic and lysogenic viruses by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and hybridization analysis. Upon infection, lysogenic viruses integrate their genome into the genome of the host.
Thus, it will also be possible to track the populations of lysogenized prokaryotes. The third objective is to determine the partial nucleotide sequences of the genomes of dominant lysogenic viruses by cloning and sequencing to assess the phylogenetic affiliation of these lysogenic viruses. For the first time, archaeal viruses and their hosts will be studied in a pelagic system.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología bacteriología
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología virología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología microbiomas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP6-2002-MOBILITY-5
Consulte otros proyectos de esta convocatoria
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
VALBONNE
Francia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.