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Molecular machines based on coiled-coil protein origami

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Publicaciones

Peer reviewed articles (19)
The art of designed coiled-coils for the regulation of mammalian cells (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Tjaša Plaper, Erik Rihtar, Taja Železnik Ramuta, Vida Forstnerič, Vid Jazbec, Filip Ivanovski, Mojca Benčina, Roman Jerala
Publicado en: Cell Chemical Biology, Edición 31, 2024, Página(s) 1460-1472, ISSN 2451-9456
Editor: Springer Nature
DOI: 10.1016/j.chembiol.2024.06.001

Coiled Coils as Versatile Modules for Mammalian Cell Regulation (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Estera Merljak, Anja Golob-Urbanc, Tjaša Plaper, Roman Jerala
Publicado en: Synthetic Biology and Engineering, Edición 1, 2024, Página(s) 1-10, ISSN 2958-9053
Editor: SCIEPublish
DOI: 10.35534/sbe.2023.10006

Subunits of an E3 Ligase Complex as Degrons for Efficient Degradation of Cytosolic, Nuclear, and Membrane Proteins (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Anže Verbič, Tina Lebar, Arne Praznik, Roman Jerala
Publicado en: ACS Synthetic Biology, Edición 13, 2024, Página(s) 792-803, ISSN 2161-5063
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.3c00588

Designed allosteric protein logic (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Tjaša Plaper, Estera Merljak, Tina Fink, Tadej Satler, Ajasja Ljubetič, Duško Lainšček, Vid Jazbec, Mojca Benčina, Sintija Stevanoska, Sašo Džeroski, Roman Jerala
Publicado en: Cell Discovery, Edición 10, 2024, ISSN 2056-5968
Editor: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41421-023-00635-y

A nanobody toolbox targeting dimeric coiled-coilmodules for functionalization of designedprotein origami structures (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Andreja Majerle, San Hadži, Jana Aupič, Tadej Satler, Fabio Lapenta, Žiga Strmšek, Jurij Lah, Remy Loris, and Roman Jerala,
Publicado en: Proc Natl Acad Sci USA, 2021, ISSN 1091-6490
Editor: National Academy of Science
DOI: 10.1073/pnas.2021899118

Coiled-coil heterodimer-based recruitment of an exonuclease to CRISPR/Cas for enhanced gene editing (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Duško Lainšček, Vida Forstnerič, Veronika Mikolič, Špela Malenšek, Peter Pečan, Mojca Benčina, Matjaž Sever, Helena Podgornik & Roman Jerala
Publicado en: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-31386-1

Engineering a scalable and orthogonal platform for synthetic communication in mammalian cells (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Anna-Maria Makri Pistikou, Glenn A. O. Cremers, Bryan L. Nathalia, Theodorus J. Meuleman, Bas W. A. Bögels, Bruno V. Eijkens, Anne de Dreu, Maarten T. H. Bezembinder, Oscar M. J. A. Stassen, Carlijn C. V. Bouten, Maarten Merkx, Roman Jerala, Tom F. A. de Greef
Publicado en: Nature Communications, Edición 14, 2023, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-42810-5

Programmable de novo designed coiled coil-mediated phase separation in mammalian cells (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Maruša Ramšak, Dominique A. Ramirez, Loren E. Hough, Michael R. Shirts, Sara Vidmar, Kristina Eleršič Filipič, Gregor Anderluh, Roman Jerala
Publicado en: Nature Communications, Edición 14, 2023, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43742-w

A multiplexed bacterial two-hybrid for rapid characterization of protein–protein interactions and iterative protein design (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: W. Clifford Boldridge, Ajasja Ljubetič, Hwangbeom Kim, Nathan Lubock, Dániel Szilágyi, Jonathan Lee, Andrej Brodnik, Roman Jerala, Sriram Kosuri
Publicado en: Nature Communications, Edición 14, 2023, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38697-x

A tunable orthogonal coiled-coil interaction toolbox for engineering mammalian cells (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Tina Lebar, Duško Lainšček, Estera Merljak, Jana Aupič, Roman Jerala
Publicado en: Nature Chemical Biology, 2020, ISSN 1552-4450
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-019-0443-y

Design of fast proteolysis-based signaling and logic circuits in mammalian cells (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Tina Fink, Jan Lonzarić, Arne Praznik, Tjaša Plaper, Estera Merljak, Katja Leben, Nina Jerala, Tina Lebar, Žiga Strmšek, Fabio Lapenta, Mojca Benčina, Roman Jerala
Publicado en: Nature Chemical Biology, Edición 15/2, 2019, Página(s) 115-122, ISSN 1552-4450
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-018-0181-6

Crystal Structure of <i>de Novo</i> Designed Coiled-Coil Protein Origami Triangle (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Tadej Satler, San Hadži, Roman Jerala
Publicado en: Journal of the American Chemical Society, Edición 145, 2023, Página(s) 16995-17000, ISSN 0002-7863
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.3c05531

Regulation of protein secretion through chemicalregulation of endoplasmic reticulum retentionsignal cleavage (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Arne Praznik, Tina Fink, Nik Franko, Jan Lonzarić, Mojca Benčina, Nina Jerala, Tjaša Plaper, Samo Roškar & Roman Jerala
Publicado en: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-28971-9

A Nanoscaffolded Spike-RBD Vaccine Provides Protectionagainst SARS-CoV-2 with Minimal Anti-Scaffold Response (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Duško Lainšček, Tina Fink, Vida Forstnerič, Iva Hafner-Bratkovič, Sara Orehek, Žiga Strmšek, Mateja Manček-Keber, Peter Pečan, Hana Esih, Špela Malenšek, Jana Aupič, Petra Dekleva, Tjaša Plaper, Sara Vidmar, Lucija Kadunc, Mojca Benčina, Neža Omersa, Gregor Anderluh, Florence Pojer, Kelvin Lau, David Hacker, Bruno E. Correia, David Peterhoff, Ralf Wagner, Valter Bergant, Alexander H
Publicado en: Vaccines, 2021, ISSN 2076-393X
Editor: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/vaccines9050431

Metal ion–regulated assembly of designedmodular protein cages (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Jana Aupič, Fabio Lapenta, Žiga Strmšek, Estera Merljak, Tjaša Plaper, Roman Jerala
Publicado en: Science Advances, 2022, ISSN 2375-2548
Editor: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.abm8243

Preorganized cyclic modules facilitate the self-assembly of protein nanostructures (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Jaka Snoj, Fabio Lapenta, Roman Jerala
Publicado en: Chemical Science, Edición 15, 2024, Página(s) 3673-3686, ISSN 2041-6520
Editor: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3sc06658d

Designed folding pathway of modular coiled-coil-based proteins (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Jana Aupič, Žiga Strmšek, Fabio Lapenta, David Pahovnik, Tomaž Pisanski, Igor Drobnak, Ajasja Ljubetič, Roman Jerala
Publicado en: Nature Communications, Edición 12/1, 2021, Página(s) 1-12, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-21185-5

Self-assembly and regulation of protein cages from pre-organised coiled-coil modules (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Fabio Lapenta, Jana Aupič, Marco Vezzoli, Žiga Strmšek, Stefano Da Vela, Dmitri I. Svergun, José María Carazo, Roberto Melero, Roman Jerala
Publicado en: Nature Communications, Edición 12/1, 2021, Página(s) 1-12, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-21184-6

Segmentation strategy of de novo designed four-helical bundles expands protein oligomerization modalities for cell regulation (se abrirá en una nueva ventana)

Autores: Estera Merljak, Benjamin Malovrh, Roman Jerala
Publicado en: Nature Communications, Edición 14, 2023, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-37765-6

Derechos de propiedad intelectual

Patent (3)
REGULATION OF PROTEIN FUNCTION BY INSERTION OF INTERACTION PEPTIDES

Número de solicitud/publicación: 20 22085613
Fecha: 2022-12-13
Solicitante(s): KEMIJSKI INSTITUT

VACCINES BASED ON AN ANTIGEN PROTEIN FUSED TO A NANOSTRUCTURING SCAFFOLD

Número de solicitud/publicación: 20 21073632
Fecha: 2021-08-26
Solicitante(s): KEMIJSKI INSTITUT

COILED-COIL MEDIATED TETHERING OF CRISPR-CAS AND EXONUCLEASES FOR ENHANCED GENOME EDITING

Número de solicitud/publicación: 19 192490
Fecha: 2019-08-20
Solicitante(s): KEMIJSKI INSTITUT

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Última actualización: 23 Diciembre 2024

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