Objetivo
TET2 (Tet Methylcytosine Dioxygenase 2) is a DNA demethylase frequently mutated in patients with Acute Myeloid Leukemia (AML). DNA methylation is an epigenetic modification with key roles in the specification of cellular identity, and, when deregulated, in cancer. DNA methylation is a reversible process and, only recently, it was discovered that TET (Ten-eleven Translocation) proteins mediate DNA demethylation. Mammals have three TET homologues (TET1-3). While TET1 and TET3 share an N-terminal DNA-binding domain (CXXC motif), TET2 has lost its CXXC motif during evolution. Therefore, it is not understood how TET2 binds DNA. Due to the lack of a known DNA-binding domain in TET2, I hypothesize that TET2 may require to interact with proteins to be recruited to DNA, which is essential for its function.
Hence, the main goal of my proposal is to understand how TET2 binds to DNA and to identify interacting proteins that participate in this recruitment. I also aim to unveil whether cancer-associated mutations affect TET2 recruitment.
To achieve these goals, I will perform a structural-functional analysis of TET2. First, I will perform Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) followed by whole genome sequencing of wildtype and truncated TET2. Thus, I will identify the region(s) required for the binding of TET2 to DNA. Next, I will seek proteins that interact with TET2 through the previously identified region by Mass Spectrometry and I will test their involvement in TET2 recruitment to DNA. Furthermore, I will perform similar experiments to inspect the impact of TET2 missense mutations found in human cancer on TET2 recruitment to DNA.
Altogether, this project will yield a better understanding of how TET2 is recruited to DNA. The results obtained will significantly impact the epigenetic field and allow for a better understanding of the mechanisms by which TET2 exerts its function in normal cells and how TET2 mutations contribute to cancer.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética mutación
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica oncología leucemia
- ciencias naturales ciencias químicas química analítica espectrometría de masas
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2017
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
1165 KOBENHAVN
Dinamarca
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.