Descripción del proyecto
Análisis de la cromatina con precisión a nivel monomolecular
La unidad fundamental de la cromatina en la célula viva es el nucleosoma, compuesto por un octámero de histonas. El gran número de modificaciones de histonas, remodeladores de cromatina y factores de transcripción que interactúan con nuestro genoma sugiere que múltiples elementos actúan de manera combinatoria. El proyecto financiado con fondos europeos SM-Epigen demostró recientemente una prueba de principio de un sistema monomolecular para cartografiar las modificaciones combinatorias de la cromatina. El método identifica directamente combinaciones únicas de marcadores epigenéticos y revela módulos reguladores con una resolución monomolecular. El proyecto desarrollará sistemas robustos de alto rendimiento para investigar las interacciones combinatorias de la cromatina y los factores de transcripción, incluida la regulación epigenética durante el desarrollo temprano. La nueva tecnología ayudará a revelar el tejido de origen del ADN circulante que transita como nucleosomas en la sangre, y a desarrollar estrategias novedosas para la detección temprana del cáncer y otras enfermedades.
Objetivo
Genes and genomic elements are packaged by chromatin structures that regulate their activity. The fundamental unit of chromatin is the nucleosome, composed of an octamer of histones. The large numbers of histone modifications, chromatin remodelers and transcription factors (TFs) that interact with our genome has fuelled speculation that multiple elements act combinatorially to direct specific outcomes. However, the field lacks technologies for detection and analysis of such combinations, thus impeding our ability to test this hypothesis and shed light on human genome regulation.
Our recent proof-of-principle for a single-molecule system for mapping combinatorial chromatin modifications holds the technological solution. This powerful method can identify directly unique combinations of epigenetic marks and reveal regulatory modules that can only be ascertained by single-molecule studies.
The proposed project will scale-up and advance our technology to establish robust high-throughput systems for investigating combinatorial chromatin and TF interactions and identify their genomic locations, thus bridging the gap between single-molecule proteomics and genomics. We will apply it to address basic questions in epigenetic regulation during early development, and define the network of interactions between histone marks, DNA methylation and the core TFs in stem cells and differentiated cells. We will also harness our technology to reveal the tissue-of-origin of cell-free DNA circulating in our blood in the form of nucleosomes, and apply it to devise novel strategies for early detection of cancer and other diseases.
Successful implementation and dissemination of these novel systems will yield a transformative new technology for functional genomics that will unravel the chromatin language during early development. This work will open new research directions at the interface of genomics and proteomics, and pave the way for the development of therapeutic and diagnostic tools.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: https://op.europa.eu/es/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: https://op.europa.eu/es/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias médicas y de la salud biotecnología médica tecnologías celulares células madre
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica oncología
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
ERC-STG - Starting Grant
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2018-STG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
7610001 Rehovot
Israel
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.