Dissecting epistasis for enhanced crop productivity

Informations projet

EPICROP

N° de convention de subvention: 802008

DOI

10.3030/802008

Projet clôturé

Date de signature de la CE 14 Janvier 2019

Date de début 1 Août 2019

Date de fin 31 Juillet 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 499 903,00

Contribution de l’UE

€ 1 499 903,00

Coordonné par

UNIVERSITE DE LAUSANNE
Switzerland

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Publications

Peer reviewed articles (4)

Meristem transitions and plant architecture—learning from domestication for crop breeding

Auteurs: Natalia Gaarslev, Gwen Swinnen, Sebastian Soyk
Publié dans: Plant Physiology, Numéro Volume 187, Numéro 3, Nov 2021, 2021, Page(s) 1045-1056, ISSN 0032-0889
Éditeur: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1093/plphys/kiab388

Automated assembly scaffolding using RagTag elevates a new tomato system for high-throughput genome editing

Auteurs: Michael Alonge, Ludivine Lebeigle, Melanie Kirsche, Katie Jenike, Shujun Ou, Sergey Aganezov, Xingang Wang, Zachary B. Lippman, Michael C. Schatz and Sebastian Soyk
Publié dans: Genome biology, Numéro 23:258, p1-19, 2022, ISSN 1474-760X
Éditeur: BioMed Central / Springer Nature
DOI: 10.1186/s13059-022-02823-7

Repairing a deleterious domestication variant in a floral regulator gene of tomato by base editing

Auteurs: Anna N. Glaus, Marion Brechet, Gwen Swinnen, Ludivine Lebeigle, Justyna Iwaszkiewicz, Giovanna Ambrosini, Irene Julca, Jing Zhang, Robyn Roberts, Christian Iseli, Nicolas Guex, José Jiménez-Gómez, Natasha Glover, Gregory B. Martin, Susan Strickler, Sebastian Soyk
Publié dans: Nature Genetics, Numéro 57, 2025, Page(s) 231-241, ISSN 1061-4036
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-024-02026-9

Application of a <scp>GRF</scp>‐<scp>GIF</scp> chimera enhances plant regeneration for genome editing in tomato

Auteurs: Gwen Swinnen, Eléonore Lizé, Miguel Loera Sánchez, Stéphanie Stolz, Sebastian Soyk
Publié dans: Plant Biotechnology Journal, Numéro 23, 2025, Page(s) 4044-4056, ISSN 1467-7644
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/pbi.70212

Other (3)

Repairing a deleterious domestication variant in a floral regulator of tomato by base editing

Auteurs: Anna N. Glaus, Marion Brechet, Ludivine Lebeigle, Justyna Iwaszkiewicz, Giovanna Ambrosini, Irene Julca, Jing Zhang, Robyn Roberts, Christian Iseli, Nicolas Guex, José Jiménez-Gómez, Natasha Glover, Gregory B. Martin, Susan Strickler, Sebastian Soyk
Publié dans: bioRxiv, Numéro Posted January 31, 2024, 2024
Éditeur: bioRxiv
DOI: 10.1101/2024.01.29.577624

Automated assembly scaffolding elevates a new tomato system for high-throughput genome editing

Auteurs: Michael Alonge, Ludivine Lebeigle, Melanie Kirsche, Sergey Aganezov, Xingang Wang, Zachary B. Lippman, Michael C. Schatz, and Sebastian Soyk
Publié dans: bioRxiv, Numéro Posted November 19, 2021., 2021
Éditeur: Cold Spring Harbor Press
DOI: 10.1101/2021.11.18.469135

Application of a GRF-GIF chimera enhances plant regeneration for genome editing in tomato

Auteurs: Gwen Swinnen, Eléonore Lizé, Miguel Loera Sánchez, Stéphanie Stolz, Sebastian Soyk
Publié dans: bioRxiv, Numéro Posted December 21, 2024, 2024
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.12.20.628945

Non-peer reviewed articles (1)

New Horizons for Dissecting Epistasis in Crop Quantitative Trait Variation

Auteurs: Sebastian Soyk, Matthias Benoit, and Zachary B. Lippman
Publié dans: Annual Review of Genetics, Numéro Vol. 54 (Volume publication date November 2020), 2020, Page(s) 287-307, ISSN 0066-4197
Éditeur: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-genet-050720-122916