Dissecting epistasis for enhanced crop productivity

Projektinformationen

EPICROP

ID Finanzhilfevereinbarung: 802008

DOI

10.3030/802008

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 14 Januar 2019

Startdatum 1 August 2019

Enddatum 31 Juli 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 499 903,00

EU-Beitrag

€ 1 499 903,00

Koordiniert durch

UNIVERSITE DE LAUSANNE
Switzerland

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (4)

Meristem transitions and plant architecture—learning from domestication for crop breeding

Autoren: Natalia Gaarslev, Gwen Swinnen, Sebastian Soyk
Veröffentlicht in: Plant Physiology, Ausgabe Volume 187, Ausgabe 3, Nov 2021, 2021, Seite(n) 1045-1056, ISSN 0032-0889
Herausgeber: American Society of Plant Biologists
DOI: 10.1093/plphys/kiab388

Automated assembly scaffolding using RagTag elevates a new tomato system for high-throughput genome editing

Autoren: Michael Alonge, Ludivine Lebeigle, Melanie Kirsche, Katie Jenike, Shujun Ou, Sergey Aganezov, Xingang Wang, Zachary B. Lippman, Michael C. Schatz and Sebastian Soyk
Veröffentlicht in: Genome biology, Ausgabe 23:258, p1-19, 2022, ISSN 1474-760X
Herausgeber: BioMed Central / Springer Nature
DOI: 10.1186/s13059-022-02823-7

Repairing a deleterious domestication variant in a floral regulator gene of tomato by base editing

Autoren: Anna N. Glaus, Marion Brechet, Gwen Swinnen, Ludivine Lebeigle, Justyna Iwaszkiewicz, Giovanna Ambrosini, Irene Julca, Jing Zhang, Robyn Roberts, Christian Iseli, Nicolas Guex, José Jiménez-Gómez, Natasha Glover, Gregory B. Martin, Susan Strickler, Sebastian Soyk
Veröffentlicht in: Nature Genetics, Ausgabe 57, 2025, Seite(n) 231-241, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-024-02026-9

Application of a <scp>GRF</scp>‐<scp>GIF</scp> chimera enhances plant regeneration for genome editing in tomato

Autoren: Gwen Swinnen, Eléonore Lizé, Miguel Loera Sánchez, Stéphanie Stolz, Sebastian Soyk
Veröffentlicht in: Plant Biotechnology Journal, Ausgabe 23, 2025, Seite(n) 4044-4056, ISSN 1467-7644
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/pbi.70212

Other (3)

Repairing a deleterious domestication variant in a floral regulator of tomato by base editing

Autoren: Anna N. Glaus, Marion Brechet, Ludivine Lebeigle, Justyna Iwaszkiewicz, Giovanna Ambrosini, Irene Julca, Jing Zhang, Robyn Roberts, Christian Iseli, Nicolas Guex, José Jiménez-Gómez, Natasha Glover, Gregory B. Martin, Susan Strickler, Sebastian Soyk
Veröffentlicht in: bioRxiv, Ausgabe Posted January 31, 2024, 2024
Herausgeber: bioRxiv
DOI: 10.1101/2024.01.29.577624

Automated assembly scaffolding elevates a new tomato system for high-throughput genome editing

Autoren: Michael Alonge, Ludivine Lebeigle, Melanie Kirsche, Sergey Aganezov, Xingang Wang, Zachary B. Lippman, Michael C. Schatz, and Sebastian Soyk
Veröffentlicht in: bioRxiv, Ausgabe Posted November 19, 2021., 2021
Herausgeber: Cold Spring Harbor Press
DOI: 10.1101/2021.11.18.469135

Application of a GRF-GIF chimera enhances plant regeneration for genome editing in tomato

Autoren: Gwen Swinnen, Eléonore Lizé, Miguel Loera Sánchez, Stéphanie Stolz, Sebastian Soyk
Veröffentlicht in: bioRxiv, Ausgabe Posted December 21, 2024, 2024
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.12.20.628945

Non-peer reviewed articles (1)

New Horizons for Dissecting Epistasis in Crop Quantitative Trait Variation

Autoren: Sebastian Soyk, Matthias Benoit, and Zachary B. Lippman
Veröffentlicht in: Annual Review of Genetics, Ausgabe Vol. 54 (Volume publication date November 2020), 2020, Seite(n) 287-307, ISSN 0066-4197
Herausgeber: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-genet-050720-122916