Description du projet
Le mécanisme d’interaction des protéines intrinsèquement désordonnées
Contrairement à la plupart des protéines, les protéines intrinsèquement désordonnées (IDP pour «intrinsically disordered proteins») n’ont pas de structures tertiaires et/ou secondaires stables dans des conditions physiologiques in vitro. Pourtant, elles remplissent un grand nombre de fonctions biologiques. Le projet MultiMotif, financé par l’UE, vise à comprendre les mécanismes moléculaires des interactions entre les IDP. Les scientifiques se concentreront sur l’endocytose, le processus par lequel les cellules absorbent des matières, notamment des nutriments et des fluides, provenant du milieu environnant. L’endocytose implique l’engloutissement de molécules dans des vésicules au cours d’un processus dépendant de l’énergie qui fait intervenir diverses protéines telles que la clathrine ainsi que des IDP. Les travaux fourniront des preuves essentielles de la manière dont les motifs linéaires des IDP médient l’interaction avec d’autres protéines et lipides.
Objectif
Linear motifs are short sequence stretches that occur in intrinsically disordered protein regions (IDRs) lacking stable secondary and tertiary structure, and mediate vital interactions within various biological systems. An exemplary system for the presence of IDRs and a high concentration of linear motifs is the clathrin mediated endocytosis machinery of the eukaryotic cell, where a complex interaction network of IDR-rich adaptor proteins enables both protein and lipid interactions. The molecular mechanism of such interactions, especially when multiple motifs act in concert, is however only poorly understood particularly since the dynamic and flexible nature of IDRs makes them a very difficult object to study. I aim to develop an integrative approach based on single molecule fluorescence and NMR spectroscopies to characterize the molecular principles of IDRs in clathrin mediated endocytosis. A systematic analysis of IDRs with different types of motifs and various interaction partners will not only shed light on the molecular functions of linear motifs within endocytosis, but also on how multiplicities of linear motifs may work in various biological processes in general. In vitro structural studies will be connected with single molecule imaging to relate molecular conformation with function within the cell.
Champ scientifique
Mots‑clés
Programme(s)
Thème(s)
Régime de financement
ERC-STG - Starting GrantInstitution d’accueil
12489 Berlin
Allemagne