Opis projektu
Mechanizm interakcji samoistnie nieuporządkowanych białek
W odróżnieniu od większości białek, samoistnie nieuporządkowane białka (ang. intrinsically disordered proteins, IDP) są pozbawione stabilnych struktur trzecio- i/lub drugorzędowych w warunkach fizjologicznych in vivo. Mimo to pełnią cały szereg ważnych funkcji biologicznych. Badacze z finansowanego ze środków UE projektu MultiMotif chcą poznać mechanizmy molekularne interakcji białek IDP. Naukowcy skoncentrują się na endocytozie – procesie, w toku którego komórki wychwytują materiał, w tym składniki odżywcze i płyny, z otaczającego je środowiska. Endocytoza oznacza przenikanie cząsteczek do pęcherzyków w ramach procesu, który jest energochłonny i obejmuje różne białka, na przykład klatrynę i IDP. Badania dadzą bardziej szczegółowy wgląd w to, jak motywy liniowe IDP pośredniczą w interakcjach z innymi białkami i lipidami.
Cel
Linear motifs are short sequence stretches that occur in intrinsically disordered protein regions (IDRs) lacking stable secondary and tertiary structure, and mediate vital interactions within various biological systems. An exemplary system for the presence of IDRs and a high concentration of linear motifs is the clathrin mediated endocytosis machinery of the eukaryotic cell, where a complex interaction network of IDR-rich adaptor proteins enables both protein and lipid interactions. The molecular mechanism of such interactions, especially when multiple motifs act in concert, is however only poorly understood particularly since the dynamic and flexible nature of IDRs makes them a very difficult object to study. I aim to develop an integrative approach based on single molecule fluorescence and NMR spectroscopies to characterize the molecular principles of IDRs in clathrin mediated endocytosis. A systematic analysis of IDRs with different types of motifs and various interaction partners will not only shed light on the molecular functions of linear motifs within endocytosis, but also on how multiplicities of linear motifs may work in various biological processes in general. In vitro structural studies will be connected with single molecule imaging to relate molecular conformation with function within the cell.
Dziedzina nauki
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
ERC-STG - Starting GrantInstytucja przyjmująca
12489 Berlin
Niemcy