Descrizione del progetto
Il meccanismo di interazione delle proteine intrinsecamente disordinate
A differenza della maggior parte delle proteine, le proteine intrinsecamente disordinate (IDP) non presentano strutture terziarie e/o secondarie stabili in condizioni fisiologiche in vitro. Eppure svolgono un’importante serie di funzioni biologiche. Il progetto MultiMotif, finanziato dall’UE, è interessato a comprendere i meccanismi molecolari delle interazioni tra IDP. Gli scienziati si concentreranno sull’endocitosi, il processo attraverso il quale le cellule assorbono materiale, compresi nutrienti e fluidi, dall’ambiente circostante. L’endocitosi comporta l’invaginazione di molecole all’interno di vescicole in un processo dipendente dall’energia che coinvolge varie proteine come la clatrina e le IDP. Il lavoro fornirà prove fondamentali sul modo in cui i motivi lineari delle IDP mediano l’interazione con altre proteine e lipidi.
Obiettivo
Linear motifs are short sequence stretches that occur in intrinsically disordered protein regions (IDRs) lacking stable secondary and tertiary structure, and mediate vital interactions within various biological systems. An exemplary system for the presence of IDRs and a high concentration of linear motifs is the clathrin mediated endocytosis machinery of the eukaryotic cell, where a complex interaction network of IDR-rich adaptor proteins enables both protein and lipid interactions. The molecular mechanism of such interactions, especially when multiple motifs act in concert, is however only poorly understood particularly since the dynamic and flexible nature of IDRs makes them a very difficult object to study. I aim to develop an integrative approach based on single molecule fluorescence and NMR spectroscopies to characterize the molecular principles of IDRs in clathrin mediated endocytosis. A systematic analysis of IDRs with different types of motifs and various interaction partners will not only shed light on the molecular functions of linear motifs within endocytosis, but also on how multiplicities of linear motifs may work in various biological processes in general. In vitro structural studies will be connected with single molecule imaging to relate molecular conformation with function within the cell.
Campo scientifico
Parole chiave
Programma(i)
Argomento(i)
Meccanismo di finanziamento
ERC-STG - Starting GrantIstituzione ospitante
12489 Berlin
Germania