Nonadiabaticity in Biomolecular Vibrational Dynamics

Informations projet

NONABVD

N° de convention de subvention: 802817

DOI

10.3030/802817

Projet clôturé

Date de signature de la CE 22 Août 2018

Date de début 1 Janvier 2019

Date de fin 31 Decembre 2024

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 486 805,00

Contribution de l’UE

€ 1 486 805,00

Coordonné par

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

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Publications

Peer reviewed articles (19)

The mutual interactions of RNA, counterions and water – quantifying the electrostatics at the phosphate–water interface

Auteurs: Benjamin Philipp Fingerhut
Publié dans: Chem. Commun., Numéro 57, 2021, Page(s) 12880-12897, ISSN 1364-548X
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cc05367a

Hydration structure and dynamics of phosphoric acid and its anions—Ultrafast 2D-IR spectroscopy and <i>ab initio</i> molecular dynamics simulations

Auteurs: Achintya Kundu, Benjamin P. Fingerhut, Thomas Elsaesser
Publié dans: The Journal of Chemical Physics, Numéro 161, 2024, Page(s) 084503, ISSN 0021-9606
Éditeur: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0216640

Coherent polaron dynamics of electrons solvated in polar liquids

Auteurs: Poonam Singh, Jia Zhang, Ahmed Ghalgaoui, Klaus Reimann, Benjamin P Fingerhut, Michael Woerner, Thomas Elsaesser
Publié dans: PNAS Nexus, Numéro 1, 2022, Page(s) pgac078, ISSN 2752-6542
Éditeur: NAS/Oxford University Press
DOI: 10.1093/pnasnexus/pgac078

Ultrafast terahertz Stark spectroscopy reveals the excited-state dipole moments of retinal in bacteriorhodopsin

Auteurs: Jia Zhang, Poonam Singh, Dieter Engel, Benjamin P. Fingerhut, Matthias Broser, Peter Hegemann, Thomas Elsaesser
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 121, 2024, Page(s) e2319676121, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2319676121

Transient Terahertz Stark Effect: A Dynamic Probe of Electric Interactions in Polar Liquids

Auteurs: Poonam Singh; Jia Zhang; Dieter Engel; Benjamin P. Fingerhut; Thomas Elsaesser
Publié dans: J. Phys. Chem. Lett., Numéro 14, 2023, Page(s) 5505–5510, ISSN 1948-7185
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.3c01079

Numerically efficient quasi-adiabatic propagator path integral approach with two independent non-commuting baths

Auteurs: R. Ovcharenko, B. P. Fingerhut
Publié dans: The Journal of Chemical Physics, Numéro 163, 2025, Page(s) 014109, ISSN 0021-9606
Éditeur: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0271212

Infrared and NMR Spectroscopic Fingerprints of the Asymmetric H 7 + O 3 Complex in Solution

Auteurs: Eve Kozari, Mark Sigalov, Dina Pines, Benjamin P. Fingerhut, Ehud Pines
Publié dans: ChemPhysChem, Numéro 22/8, 2021, Page(s) 716-725, ISSN 1439-4235
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cphc.202001046

Short-Range Cooperative Slow-down of Water Solvation Dynamics Around SO₄^2––Mg²⁺Ion Pairs

Auteurs: Achintya Kundu; Shavkat I. Mamatkulov; Florian N. Brünig; Douwe Jan Bonthuis; Roland R. Netz; Thomas Elsaesser; Benjamin P. Fingerhut
Publié dans: ACS Phys. Chem Au, Numéro 2, 2022, Page(s) 506–514, ISSN 2694-2445
Éditeur: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/acsphyschemau.2c00034

Field-Induced Electron Generation in Water: Solvation Dynamics and Many-Body Interactions

Auteurs: Michael Woerner, Benjamin P. Fingerhut, Thomas Elsaesser
Publié dans: The Journal of Physical Chemistry B, Numéro 126, 2022, Page(s) 2621–2634, ISSN 1520-5215
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.2c01102

Phosphate Vibrations Probe Electric Fields in Hydrated Biomolecules: Spectroscopy, Dynamics, and Interactions

Auteurs: Thomas Elsaesser, Jakob Schauss, Achintya Kundu, Benjamin P. Fingerhut
Publié dans: The Journal of Physical Chemistry B, Numéro 125/15, 2021, Page(s) 3899-3908, ISSN 1520-6106
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.1c01502

On the role of non-diagonal system–environment interactions in bridge-mediated electron transfer

Auteurs: Nirmalendu Acharyya, Roman Ovcharenko, Benjamin P. Fingerhut
Publié dans: The Journal of Chemical Physics, Numéro 153/18, 2020, Page(s) 185101, ISSN 0021-9606
Éditeur: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0027976

Hydrated Excess Protons in Acetonitrile/Water Mixtures: Solvation Species and Ultrafast Proton Motions

Auteurs: Achintya Kundu, Fabian Dahms, Benjamin P. Fingerhut, Erik T. J. Nibbering, Ehud Pines, Thomas Elsaesser
Publié dans: The Journal of Physical Chemistry Letters, Numéro 10/9, 2019, Page(s) 2287-2294, ISSN 1948-7185
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.9b00756

Contact Ion Pairs of Phosphate Groups in Water: Two-Dimensional Infrared Spectroscopy of Dimethyl Phosphate and ab Initio Simulations

Auteurs: Jakob Schauss, Achintya Kundu, Benjamin P. Fingerhut, Thomas Elsaesser
Publié dans: The Journal of Physical Chemistry Letters, Numéro 10/20, 2019, Page(s) 6281-6286, ISSN 1948-7185
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.9b02157

Aqueous Contact Ion Pairs of Phosphate Groups with Na+, Ca2+ and Mg2+ – Structural Discrimination by Femtosecond Infrared Spectroscopy and Molecular Dynamics Simulations

Auteurs: Benjamin P. Fingerhut, Jakob Schauss, Achintya Kundu, Thomas Elsaesser
Publié dans: Zeitschrift für Physikalische Chemie, Numéro 0/0, 2020, Page(s) 22, ISSN 0942-9352
Éditeur: Oldenbourg Wissenschaftsverlag GmbH
DOI: 10.1515/zpch-2020-1614

Change of Hydration Patterns upon RNA Melting Probed by Excitations of Phosphate Backbone Vibrations

Auteurs: Achintya Kundu, Jakob Schauss, Benjamin P. Fingerhut, Thomas Elsaesser
Publié dans: The Journal of Physical Chemistry B, Numéro 124/11, 2020, Page(s) 2132-2138, ISSN 1520-6106
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.0c01474

Contact pairs of RNA with magnesium ions-electrostatics beyond the Poisson-Boltzmann equation

Auteurs: Benjamin Philipp Fingerhut, Jakob Schauss, Achintya Kundu, Thomas Elsaesser
Publié dans: Biophysical Journal, Numéro 120, 2021, Page(s) 5322-5332, ISSN 0006-3495
Éditeur: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2021.10.029

Terahertz Polaron Oscillations of Electrons Solvated in Liquid Water

Auteurs: Ahmed Ghalgaoui, Benjamin P. Fingerhut, Klaus Reimann, Thomas Elsaesser, Michael Woerner
Publié dans: Physical Review Letters, Numéro 126/9, 2021, ISSN 0031-9007
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevlett.126.097401

Magnesium Contact Ions Stabilize the Tertiary Structure of Transfer RNA: Electrostatics Mapped by Two-Dimensional Infrared Spectra and Theoretical Simulations

Auteurs: Jakob Schauss, Achintya Kundu, Benjamin P. Fingerhut, Thomas Elsaesser
Publié dans: The Journal of Physical Chemistry B, Numéro 125/3, 2021, Page(s) 740-747, ISSN 1520-6106
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.0c08966

Field-Induced Tunneling Ionization and Terahertz-Driven Electron Dynamics in Liquid Water

Auteurs: Ahmed Ghalgaoui, Lisa-Marie Koll, Bernd Schütte, Benjamin P. Fingerhut, Klaus Reimann, Michael Woerner, Thomas Elsaesser
Publié dans: The Journal of Physical Chemistry Letters, 2020, ISSN 1948-7185
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.0c02312

Other (3)

Front Cover: Infrared and NMR Spectroscopic Fingerprints of the Asymmetric H 7 + O 3 Complex in Solution (8/2021)

Auteurs: Eve Kozari, Mark Sigalov, Dina Pines, Benjamin P. Fingerhut, Ehud Pines
Publié dans: ChemPhysChem, Numéro 22/8, 2021, Page(s) 708-708, ISSN 1439-4235
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cphc.202100231

Coherent Dynamics of the Off-Diagonal Spin-Boson Model in the Ultra-Strong Coupling Regime

Auteurs: Nirmalendu Acharyya, Martin Richter, Benjamin P. Fingerhut
Publié dans: 2020
Éditeur: arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2009.12296

Scalable Distributed Memory Implementation of the Quasi-Adiabatic Propagator Path Integral

Auteurs: Roman Ovcharenko, Benjamin P. Fingerhut
Publié dans: 2025
Éditeur: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2506.03127

Book chapters (1)

Noncovalent Interactions of Hydrated DNA and RNA Mapped by 2D-IR Spectroscopy

Auteurs: Benjamin P. Fingerhut, Thomas Elsaesser
Publié dans: Coherent Multidimensional Spectroscopy, Numéro 226, 2019, Page(s) 171-195, ISBN 978-981-13-9752-3
Éditeur: Springer Singapore
DOI: 10.1007/978-981-13-9753-0_8

Non-peer reviewed articles (1)

Quantendynamik offener Systeme, Trendbericht Theoretische Chemie 2020, Teil 3

Auteurs: Benjamin Fingerhut
Publié dans: Nachrichten aus der Chemie, Numéro 68/11, 2020, Page(s) 57-60, ISSN 1439-9598
Éditeur: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/nadc.20204102077