Nonadiabaticity in Biomolecular Vibrational Dynamics

Informazioni relative al progetto

NONABVD

ID dell’accordo di sovvenzione: 802817

DOI

10.3030/802817

Progetto chiuso

Data della firma CE 22 Agosto 2018

Data di avvio 1 Gennaio 2019

Data di completamento 31 Dicembre 2024

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 486 805,00

Contributo UE

€ 1 486 805,00

Coordinato da

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (19)

The mutual interactions of RNA, counterions and water – quantifying the electrostatics at the phosphate–water interface

Autori: Benjamin Philipp Fingerhut
Pubblicato in: Chem. Commun., Numero 57, 2021, Pagina/e 12880-12897, ISSN 1364-548X
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cc05367a

Hydration structure and dynamics of phosphoric acid and its anions—Ultrafast 2D-IR spectroscopy and <i>ab initio</i> molecular dynamics simulations

Autori: Achintya Kundu, Benjamin P. Fingerhut, Thomas Elsaesser
Pubblicato in: The Journal of Chemical Physics, Numero 161, 2024, Pagina/e 084503, ISSN 0021-9606
Editore: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0216640

Coherent polaron dynamics of electrons solvated in polar liquids

Autori: Poonam Singh, Jia Zhang, Ahmed Ghalgaoui, Klaus Reimann, Benjamin P Fingerhut, Michael Woerner, Thomas Elsaesser
Pubblicato in: PNAS Nexus, Numero 1, 2022, Pagina/e pgac078, ISSN 2752-6542
Editore: NAS/Oxford University Press
DOI: 10.1093/pnasnexus/pgac078

Ultrafast terahertz Stark spectroscopy reveals the excited-state dipole moments of retinal in bacteriorhodopsin

Autori: Jia Zhang, Poonam Singh, Dieter Engel, Benjamin P. Fingerhut, Matthias Broser, Peter Hegemann, Thomas Elsaesser
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 121, 2024, Pagina/e e2319676121, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2319676121

Transient Terahertz Stark Effect: A Dynamic Probe of Electric Interactions in Polar Liquids

Autori: Poonam Singh; Jia Zhang; Dieter Engel; Benjamin P. Fingerhut; Thomas Elsaesser
Pubblicato in: J. Phys. Chem. Lett., Numero 14, 2023, Pagina/e 5505–5510, ISSN 1948-7185
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.3c01079

Numerically efficient quasi-adiabatic propagator path integral approach with two independent non-commuting baths

Autori: R. Ovcharenko, B. P. Fingerhut
Pubblicato in: The Journal of Chemical Physics, Numero 163, 2025, Pagina/e 014109, ISSN 0021-9606
Editore: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0271212

Infrared and NMR Spectroscopic Fingerprints of the Asymmetric H 7 + O 3 Complex in Solution

Autori: Eve Kozari, Mark Sigalov, Dina Pines, Benjamin P. Fingerhut, Ehud Pines
Pubblicato in: ChemPhysChem, Numero 22/8, 2021, Pagina/e 716-725, ISSN 1439-4235
Editore: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cphc.202001046

Short-Range Cooperative Slow-down of Water Solvation Dynamics Around SO₄^2––Mg²⁺Ion Pairs

Autori: Achintya Kundu; Shavkat I. Mamatkulov; Florian N. Brünig; Douwe Jan Bonthuis; Roland R. Netz; Thomas Elsaesser; Benjamin P. Fingerhut
Pubblicato in: ACS Phys. Chem Au, Numero 2, 2022, Pagina/e 506–514, ISSN 2694-2445
Editore: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/acsphyschemau.2c00034

Field-Induced Electron Generation in Water: Solvation Dynamics and Many-Body Interactions

Autori: Michael Woerner, Benjamin P. Fingerhut, Thomas Elsaesser
Pubblicato in: The Journal of Physical Chemistry B, Numero 126, 2022, Pagina/e 2621–2634, ISSN 1520-5215
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.2c01102

Phosphate Vibrations Probe Electric Fields in Hydrated Biomolecules: Spectroscopy, Dynamics, and Interactions

Autori: Thomas Elsaesser, Jakob Schauss, Achintya Kundu, Benjamin P. Fingerhut
Pubblicato in: The Journal of Physical Chemistry B, Numero 125/15, 2021, Pagina/e 3899-3908, ISSN 1520-6106
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.1c01502

On the role of non-diagonal system–environment interactions in bridge-mediated electron transfer

Autori: Nirmalendu Acharyya, Roman Ovcharenko, Benjamin P. Fingerhut
Pubblicato in: The Journal of Chemical Physics, Numero 153/18, 2020, Pagina/e 185101, ISSN 0021-9606
Editore: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0027976

Hydrated Excess Protons in Acetonitrile/Water Mixtures: Solvation Species and Ultrafast Proton Motions

Autori: Achintya Kundu, Fabian Dahms, Benjamin P. Fingerhut, Erik T. J. Nibbering, Ehud Pines, Thomas Elsaesser
Pubblicato in: The Journal of Physical Chemistry Letters, Numero 10/9, 2019, Pagina/e 2287-2294, ISSN 1948-7185
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.9b00756

Contact Ion Pairs of Phosphate Groups in Water: Two-Dimensional Infrared Spectroscopy of Dimethyl Phosphate and ab Initio Simulations

Autori: Jakob Schauss, Achintya Kundu, Benjamin P. Fingerhut, Thomas Elsaesser
Pubblicato in: The Journal of Physical Chemistry Letters, Numero 10/20, 2019, Pagina/e 6281-6286, ISSN 1948-7185
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.9b02157

Aqueous Contact Ion Pairs of Phosphate Groups with Na+, Ca2+ and Mg2+ – Structural Discrimination by Femtosecond Infrared Spectroscopy and Molecular Dynamics Simulations

Autori: Benjamin P. Fingerhut, Jakob Schauss, Achintya Kundu, Thomas Elsaesser
Pubblicato in: Zeitschrift für Physikalische Chemie, Numero 0/0, 2020, Pagina/e 22, ISSN 0942-9352
Editore: Oldenbourg Wissenschaftsverlag GmbH
DOI: 10.1515/zpch-2020-1614

Change of Hydration Patterns upon RNA Melting Probed by Excitations of Phosphate Backbone Vibrations

Autori: Achintya Kundu, Jakob Schauss, Benjamin P. Fingerhut, Thomas Elsaesser
Pubblicato in: The Journal of Physical Chemistry B, Numero 124/11, 2020, Pagina/e 2132-2138, ISSN 1520-6106
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.0c01474

Contact pairs of RNA with magnesium ions-electrostatics beyond the Poisson-Boltzmann equation

Autori: Benjamin Philipp Fingerhut, Jakob Schauss, Achintya Kundu, Thomas Elsaesser
Pubblicato in: Biophysical Journal, Numero 120, 2021, Pagina/e 5322-5332, ISSN 0006-3495
Editore: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2021.10.029

Terahertz Polaron Oscillations of Electrons Solvated in Liquid Water

Autori: Ahmed Ghalgaoui, Benjamin P. Fingerhut, Klaus Reimann, Thomas Elsaesser, Michael Woerner
Pubblicato in: Physical Review Letters, Numero 126/9, 2021, ISSN 0031-9007
Editore: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevlett.126.097401

Magnesium Contact Ions Stabilize the Tertiary Structure of Transfer RNA: Electrostatics Mapped by Two-Dimensional Infrared Spectra and Theoretical Simulations

Autori: Jakob Schauss, Achintya Kundu, Benjamin P. Fingerhut, Thomas Elsaesser
Pubblicato in: The Journal of Physical Chemistry B, Numero 125/3, 2021, Pagina/e 740-747, ISSN 1520-6106
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.0c08966

Field-Induced Tunneling Ionization and Terahertz-Driven Electron Dynamics in Liquid Water

Autori: Ahmed Ghalgaoui, Lisa-Marie Koll, Bernd Schütte, Benjamin P. Fingerhut, Klaus Reimann, Michael Woerner, Thomas Elsaesser
Pubblicato in: The Journal of Physical Chemistry Letters, 2020, ISSN 1948-7185
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.0c02312

Other (3)

Front Cover: Infrared and NMR Spectroscopic Fingerprints of the Asymmetric H 7 + O 3 Complex in Solution (8/2021)

Autori: Eve Kozari, Mark Sigalov, Dina Pines, Benjamin P. Fingerhut, Ehud Pines
Pubblicato in: ChemPhysChem, Numero 22/8, 2021, Pagina/e 708-708, ISSN 1439-4235
Editore: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cphc.202100231

Coherent Dynamics of the Off-Diagonal Spin-Boson Model in the Ultra-Strong Coupling Regime

Autori: Nirmalendu Acharyya, Martin Richter, Benjamin P. Fingerhut
Pubblicato in: 2020
Editore: arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2009.12296

Scalable Distributed Memory Implementation of the Quasi-Adiabatic Propagator Path Integral

Autori: Roman Ovcharenko, Benjamin P. Fingerhut
Pubblicato in: 2025
Editore: Arxiv
DOI: 10.48550/arxiv.2506.03127

Book chapters (1)

Noncovalent Interactions of Hydrated DNA and RNA Mapped by 2D-IR Spectroscopy

Autori: Benjamin P. Fingerhut, Thomas Elsaesser
Pubblicato in: Coherent Multidimensional Spectroscopy, Numero 226, 2019, Pagina/e 171-195, ISBN 978-981-13-9752-3
Editore: Springer Singapore
DOI: 10.1007/978-981-13-9753-0_8

Non-peer reviewed articles (1)

Quantendynamik offener Systeme, Trendbericht Theoretische Chemie 2020, Teil 3

Autori: Benjamin Fingerhut
Pubblicato in: Nachrichten aus der Chemie, Numero 68/11, 2020, Pagina/e 57-60, ISSN 1439-9598
Editore: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/nadc.20204102077