Hydrophobic Gating in nanochannels: understanding single channel mechanisms for designing better nanoscale sensors

Publications

Voltage controlled iontronic switches: a computational method to predict electrowetting in hydrophobically gated nanopores

Auteurs: Paulo, Gonçalo; Gubbiotti, Alberto; Di Muccio, Giovanni; Giacomello, Alberto
Publié dans: International Journal of Smart and Nano Materials, Numéro Volume 15, 2024 - Numéro 1, 2024, Page(s) Pages 165-185, ISSN 1687-4129
Éditeur: Taylor & Francis Online
DOI: 10.1080/19475411.2023.2300332

Wetting and recovery of nano-patterned surfaces beyond the classical picture

Auteurs: Sara Marchio, Simone Meloni, Alberto Giacomello, Carlo Massimo Casciola
Publié dans: Nanoscale, Numéro 11/44, 2019, Page(s) 21458-21470, ISSN 2040-3364
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c9nr05105h

Recovering superhydrophobicity in nanoscale and macroscale surface textures

Auteurs: Alberto Giacomello, Lothar Schimmele, Siegfried Dietrich, Mykola Tasinkevych
Publié dans: Soft Matter, Numéro 15/37, 2019, Page(s) 7462-7471, ISSN 1744-683X
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/c9sm01049a

The impact of secondary channels on the wetting properties of interconnected hydrophobic nanopores

Auteurs: Gonçalo Paulo, Alberto Gubbiotti, Yaroslav Grosu, Simone Meloni, Alberto Giacomello
Publié dans: Communications Physics, Numéro 2023 Jan 27;6(1):21, 2023, ISSN 2399-3650
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42005-023-01140-0

Changes in Ion Selectivity Following the Asymmetrical Addition of Charge to the Selectivity Filter of Bacterial Sodium Channels

Auteurs: Olena A. Fedorenko, Igor A. Khovanov, Stephen K. Roberts, Carlo Guardiani
Publié dans: Entropy, Numéro 22/12, 2020, Page(s) 1390, ISSN 1099-4300
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/e22121390

Origin and control of ionic hydration patterns in nanopores

Auteurs: Miraslau L. Barabash, William A. T. Gibby, Carlo Guardiani, Alex Smolyanitsky, Dmitry G. Luchinsky, Peter V. E. McClintock
Publié dans: Communications Materials, Numéro 2/1, 2021, ISSN 2662-4443
Éditeur: Nature
DOI: 10.1038/s43246-021-00162-x

Intrinsic and apparent slip at gas-enriched liquid–liquid interfaces: a molecular dynamics study

Auteurs: Emanuele Telari, Antonio Tinti, Alberto Giacomello
Publié dans: Journal of Fluid Mechanics, Numéro 2022 May;938:A35, 2022, ISSN 1469-7645
Éditeur: Cambridge University Press
DOI: 10.1017/jfm.2022.162

Unveiling the gating mechanism of CRAC channel: a computational study

Auteurs: Carlo Guardiani, Delia Sun and Alberto Giacomello
Publié dans: Frontiers in Molecular Bioscience, 2021, ISSN 2296-889X
Éditeur: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fmolb.2021.773388

Can One Predict a Drop Contact Angle

Auteurs: Marion Silvestrini; Marion Silvestrini; Antonio Tinti; Alberto Giacomello; Carolina Brito
Publié dans: Advanced Meterials Interfaces, Numéro 2021 Nov;8(21):2101005, 2021, ISSN 2196-7350
Éditeur: Wiley Online Library
DOI: 10.1002/admi.202101005

Hydrophobically gated memristive nanopores for neuromorphic applications

Auteurs: Gonçalo Paulo, Ke Sun, Giovanni di Muccio, Alberto Gubbiotti, Blasco Morozzo della Rocca, Jia Geng, Giovanni Maglia, Mauro Chinappi, Alberto Giacomello
Publié dans: Nature Communications, Numéro Article number: 8390 (2023), 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-44019-y

Mechanism of Water Intrusion into Flexible ZIF-8: Liquid Is Not Vapor

Auteurs: Eder Amayuelas, Marco Tortora, Luis Bartolomé, Josh David Littlefair, Gonçalo Paulo, Andrea Le Donne, Benjamin Trump, Andrey Andreevich Yakovenko, Mirosław Chorążewski, Alberto Giacomello, Paweł Zajdel, Simone Meloni, Yaroslav Grosu
Publié dans: Nano Letters, Numéro 2023, 23, 12, 5430–5436, 2023, ISSN 1520-5126
Éditeur: American Chemical Society.
DOI: 10.1021/acs.nanolett.3c00235

Integrated Approach Including Docking, MD Simulations, and Network Analysis Highlights the Action Mechanism of the Cardiac hERG Activator RPR260243

Auteurs: Flavio Costa, Riccardo Ocello, Carlo Guardiani, Alberto Giacomello, Matteo Masetti
Publié dans: Journal of Chemical Information and Modeling, Numéro 2023 Jul 28;63(15):4888-99, 2023, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jcim.3c00596

Hierarchical macro-nanoporous metals for leakage-free high-thermal conductivity shape-stabilized phase change materials

Auteurs: Yaroslav Grosu, Yanqi Zhao, Alberto Giacomello, Simone Meloni, Jean-Luc Dauvergne, Artem Nikulin, Elena Palomo, Yulong Ding, Abdessamad Faik
Publié dans: Applied Energy, Numéro 269, 2020, Page(s) 115088, ISSN 0306-2619
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.apenergy.2020.115088

Molecular dynamics simulations suggest possible activation and deactivation pathways in the hERG channel

Auteurs: Flavio Costa, Carlo Guardiani, and Alberto Giacomello
Publié dans: Nature - Communications Biology, Numéro 2022 Feb 24;5(1):165, 2022, ISSN 2399-3642
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42003-022-03074-9

Bubble formation in nanopores: a matter of hydrophobicity, geometry, and size

Auteurs: Alberto Giacomello, Roland Roth
Publié dans: Advances in Physics: X, Numéro 5/1, 2020, Page(s) 1817780, ISSN 2374-6149
Éditeur: Taylor and Francis Ltd.
DOI: 10.1080/23746149.2020.1817780

Gas-Induced Drying of Nanopores

Auteurs: Gaia Camisasca, Antonio Tinti, Alberto Giacomello
Publié dans: The Journal of Physical Chemistry Letters, Numéro 11/21, 2020, Page(s) 9171-9177, ISSN 1948-7185
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.0c02600

Metastable elastocapillary systems with negative compressibility

Auteurs: Caprini, Davide; Battista, Francesco; Zajdel, Pawel; Di Muccio, Giovanni; Guardiani, Carlo; Trump, Benjamin; Carter, Marcus; Yakovenko, Andrey A.; Amayuelas, Eder; Bartolomé, Luis; Meloni, Simone; Grosu, Yaroslav; Casciola, Carlo Massimo; Giacomello, Alberto
Publié dans: ArXiv.org, 2023, ISSN 2331-8422
Éditeur: Cornell University
DOI: 10.48550/arxiv.2310.07580

Optimization of the wetting-drying characteristics of hydrophobic metal organic frameworks via crystallite size: The role of hydrogen bonding between intruded and bulk liquid

Auteurs: Liam J.W. Johnson, Gonçalo Paulo, Luis Bartolomé, Eder Amayuelas, Alberto Gubbiotti, Diego Mirani, Andrea Le Donne, Gabriel A. López, Giulia Grancini, Paweł Zajdel, Simone Meloni, Alberto Giacomello, Yaroslav Grosu
Publié dans: Journal of Colloid and Interface Science Volume 645, September 2023, Pages 775-783, Numéro Volume 645, September 2023, Pages 775-783, 2023, ISSN 1095-7103
Éditeur: Elsevier Ltd
DOI: 10.1016/j.jcis.2023.04.059

Correlation, response and entropy approaches to allosteric behaviors: a critical comparison on the ubiquitin case

Auteurs: F. Cecconi, G. Costantini, C. Guardiani, M. Baldovin, A. Vulpiani
Publié dans: Physical Biology, Numéro Volume 20, Number 5, 2023 Jun 26, 2023, ISSN 1478-3967
Éditeur: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1478-3975/ace1c5

Classical nucleation of vapor between hydrophobic plates

Auteurs: Antonio Tinti, Alberto Giacomello, Simone Meloni, Carlo Massimo Casciola
Publié dans: The Journal of Chemical Physics, Numéro 2023 Apr 7;158(13), 2023, ISSN 1089-7690
Éditeur: AIP Publishing
DOI: 10.1063/5.0140736

What keeps nanopores boiling

Auteurs: Alberto Giacomello
Publié dans: The Journal of Chemical Physics, Numéro Volume 159, Numéro 11, 21 September 2023, 2023, ISSN 1089-7690
Éditeur: AIP Publishing
DOI: 10.1063/5.0167530

Structure and dynamics of water confined in cylindrical nanopores with varying hydrophobicity

Auteurs: Antonio Tinti, Gaia Camisasca, Alberto Giacomello
Publié dans: Philosophical Transactions of the Royal Society A, Numéro 379/2208, 2021, Page(s) 20200403, ISSN 1471-2962
Éditeur: Royal Society Publishing
DOI: 10.1098/rsta.2020.0403

Computational methods and theory for ion channel research

Auteurs: C. Guardiani, F. Cecconi, L. Chiodo, G. Cottone, P. Malgaretti, L. Maragliano, M.L. Barabash, G.
Publié dans: Advances in Physics: X, Numéro 022 Dec 31;7(1):2080587, 2022, ISSN 2374-6149
Éditeur: Taylor & Francis Grou
DOI: 10.1080/23746149.2022.2080587

Electroosmosis in nanopores: computational methods and technological applications

Auteurs: Alberto Gubbiotti, Matteo Baldelli, Giovanni Di Muccio, Paolo Malgaretti, Sophie Marbach, and Mauro Chinappi
Publié dans: Advances in Physics: X, Numéro 2022 Dec 31;7(1):2036638, 2022, ISSN 2374-6149
Éditeur: Taylor & Francis Group
DOI: 10.1080/23746149.2022.2036638

Exploring K v 1.2 Channel Inactivation Through MD Simulations and Network Analysis

Auteurs: Flavio Costa, Carlo Guardiani, Alberto Giacomello
Publié dans: Frontiers in Molecular Biosciences, Numéro 2021 Dec 20;8:784276, 2021, ISSN 2296-889X
Éditeur: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fmolb.2021.784276

Noncanonical electromechanical coupling paths in cardiac hERG potassium channel

Auteurs: Carlos A. Z. Bassetto Jr, Flavio Costa, Carlo Guardiani, Francisco Bezanilla, Alberto Giacomello
Publié dans: Nature Communications, Numéro 2023 Feb 27;14(1):1110, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-36730-7

The interplay among gas, liquid and solid interactions determines the stability of surface nanobubbles

Auteurs: Marco Tortora, Simone Meloni, Beng Hau Tan, Alberto Giacomello, Claus-Dieter Ohl, Carlo Massimo Casciola
Publié dans: Nanoscale, Numéro 12/44, 2020, Page(s) 22698-22709, ISSN 2040-3364
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0nr05859a

Application of a Statistical and Linear Response Theory to Multi-Ion Na+ Conduction in NaChBac

Auteurs: William A. T. Gibby, Olena A. Fedorenko, Carlo Guardiani, Miraslau L. Barabash, Thomas Mumby, Stephen K. Roberts, Dmitry G. Luchinsky, Peter V. E. McClintock
Publié dans: Entropy, Numéro 23/2, 2021, Page(s) 249, ISSN 1099-4300
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/e23020249

An atomistically informed multiscale approach to the intrusion and extrusion of water in hydrophobic nanopores

Auteurs: Gonçalo Paulo, Alberto Gubbiotti, Alberto Giacomello
Publié dans: Journal of Chemical Physics, Numéro 2023 May 28;158(20), 2023, ISSN 0021-9606
Éditeur: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0147647

Grafting heterogeneities rule water intrusion and extrusion in nanopores

Auteurs: Sonia Cambiaso, Fabio Rasera, Antonio Tinti, Davide Bochicchio, Yaroslav Grosu,,Giulia Rossi, Alberto Giacomello,
Publié dans: arXiv, Numéro arXiv:2305.15250. 2023 May 24, 2023, ISSN 2331-8422
Éditeur: Cornell University
DOI: 10.48550/arxiv.2305.15250

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