Mucus-Penetrating Microbiota: Characterization, Mechanism and Therapeutic in Metabolic Disease

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Publications

Tolerogenic Dendritic Cells Shape a Transmissible Gut Microbiota that Protects from Metabolic Diseases

Auteurs: Emelyne Lécuyer, Tiphaine Le Roy, Aurélie Gestin, Amélie Lacombe, Catherine Philippe, Maharajah Ponnaiah, Jean-Baptiste Huré, Magali Fradet, Farid Ichou, Samira Boudebbouze, Thierry Huby, Emmanuel Gautier, Moez Rhimi, Emmanuelle Maguin, Nathalie Kapel, Philippe Gérard, Nicolas Venteclef, Michèle Garlatti, Benoit Chassaing, Philippe Lesnik
Publié dans: Diabetes, 2024, ISSN 1939-327X
Éditeur: Diabetes
DOI: 10.1101/2020.10.22.350033

Substitution of polysorbates by plant-based emulsifiers: impact on vitamin D bioavailability and gut health

Auteurs: Angela Bravo-Nunez, Angélique Berthomé, Charlotte Sabran, Donato Vairo, Jean-Charles Martin, Katherine Alvarado-Ramos, Benoit Chassaing, Julie Tomas, Emmanuelle Reboul
Publié dans: communications biology, 2025, ISSN 2399-3642
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.21203/rs.3.rs-5818990/v1

Diet standardization reduces intra-individual microbiome variation

Auteurs: Clara Delaroque, Gary D. Wu, Charlene Compher, Josephine Ni, Lindsey Albenberg, Qing Liu, Yuan Tian, Andrew D. Patterson, James D. Lewis, Andrew T. Gewirtz, Benoit Chassaing
Publié dans: Gut Microbes, Numéro 14, 2025, ISSN 1949-0976
Éditeur: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/19490976.2022.2149047

Soluble Fiber Inulin Consumption Limits Alterations of the Gut Microbiota and Hepatic Fatty Acid Metabolism Caused by High-Fat Diet

Auteurs: Mayssa Albouery, Alexis Bretin, Bénédicte Buteau, Stéphane Grégoire, Lucy Martine, Ségolène Gambert, Alain M. Bron, Niyazi Acar, Benoit Chassaing, Marie-Agnès Bringer
Publié dans: Nutrients, Numéro 13/3, 2021, Page(s) 1037, ISSN 2072-6643
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/nu13031037

Brain effects of gestating germ-free persist in mouse neonates despite acquisition of a microbiota at birth

Auteurs: Alexandra Castillo-Ruiz, Aviva Gars, Hannah Sturgeon, Nicole M. Ronczkowski, Dhanya N. Pyaram, Charlène J. G. Dauriat, Benoit Chassaing, Nancy G. Forger
Publié dans: Frontiers in Neuroscience, Numéro 17, 2023, ISSN 1662-453X
Éditeur: Frontiers in Neuroscience
DOI: 10.3389/fnins.2023.1130347

Local Delivery of Streptomycin in Microcontainers Facilitates Colonization of Streptomycin-Resistant Escherichia coli in the Rat Colon

Auteurs: Anders M. Torp, Khorshid Kamguyan, Juliane F. Christfort, Katja Ann Kristensen, Priscila Guerra, Noëmie Daniel, Line Hagner Nielsen, Kinga Zòr, Benoit Chassaing, Anja Boisen, Martin I. Bahl, Tine Rask Licht
Publié dans: Applied and Environmental Microbiology, Numéro 88, 2022, ISSN 0099-2240
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aem.00734-22

Substitution of polysorbates by plant-based emulsifiers: impact on vitamin D bioavailability and gut health in mice

Auteurs: Ángela Bravo-Núñez, Angélique Berthomé, Charlotte Sabran, Donato Vairo, Jean-Charles Martin, Katherine Alvarado-Ramos, Benoit Chassaing, Julie Tomas, Emmanuelle Reboul
Publié dans: Communications Biology, Numéro 8, 2025, ISSN 2399-3642
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42003-025-08293-4

Angry bugs! Dysbiotic intestinal microbiota promotes aggressive behaviors

Auteurs: Andrew T. Gewirtz, Benoit Chassaing
Publié dans: Brain, Behavior, and Immunity, Numéro 123, 2025, Page(s) 884-885, ISSN 0889-1591
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.bbi.2024.10.041

Individualized microbiotas dictate the impact of dietary fiber on colitis sensitivity

Auteurs: Erica Bonazzi 1 , Alexis Bretin 2 , Lucile Vigué 3 , Fuhua Hao 4 , Andrew D Patterson 3 , Andrew T Gewirtz 2 , Benoit Chassaing 5
Publié dans: Microbiome, 2024, ISSN 2049-2618
Éditeur: Microbiome
DOI: 10.1186/s40168-023-01724-6

Food additive mixtures and type 2 diabetes incidence: Results from the NutriNet-Santé prospective cohort

Auteurs: Marie Payen de la Garanderie, Anaïs Hasenbohler, Nicolas Dechamp, Guillaume Javaux, Fabien Szabo de Edelenyi, Cédric Agaësse, Alexandre De Sa, Laurent Bourhis, Raphaël Porcher, Fabrice Pierre, Xavier Coumoul, Emmanuelle Kesse-Guyot, Benjamin Allès, Léopold K. Fezeu, Emmanuel Cosson, Sopio Tatulashvili, Inge Huybrechts, Serge Hercberg, Mélanie Deschasaux-Tanguy, Benoit Chassaing, Héloïse R
Publié dans: PLOS Medicine, Numéro 22, 2025, Page(s) e1004570, ISSN 1549-1676
Éditeur: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/journal.pmed.1004570

Fecal dysbiosis associated with colonic hypersensitivity and behavioral alterations in chronically Blastocystis-infected rats

Auteurs: Manon Defaye, Céline Nourrisson, Elodie Baudu, Amandine Lashermes, Maëva Meynier, Mathieu Meleine, Ivan Wawrzyniak, Virginie Bonnin, Julie Barbier, Benoit Chassaing, Catherine Godfraind, Agathe Gelot, Nicolas Barnich, Denis Ardid, Mathilde Bonnet, Frédéric Delbac, Frédéric Antonio Carvalho, Philippe Poirier
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-66156-w

Dietary fiber guar gum-induced shift in gut microbiota metabolism and intestinal immune activity enhances susceptibility to colonic inflammation

Auteurs: Devendra Paudel 1 , Divek V T Nair 1 , Sangshan Tian 1 , Fuhua Hao 2 , Umesh K Goand 1 , Grace Joseph 1 , Eleni Prodes 1 , Zhi Chai 3 , Chloé E M Robert 4 5 , Benoit Chassaing 4 5 , Andrew D Patterson 2 , Vishal Singh 1
Publié dans: Gut Microbes, 2024, ISSN 1949-0984
Éditeur: Gut Microbes
DOI: 10.1080/19490976.2024.2341457

MiniBioReactor Array (MBRA) in vitro gut model: a reliable system to study microbiota-dependent response to antibiotic treatment

Auteurs: C A Hobson, L Vigue, S Naimi, B Chassaing, M Magnan, S Bonacorsi, B Gachet, I El Meouche, A Birgy, O Tenaillon
Publié dans: JAC-Antimicrobial Resistance, Numéro 4, 2022, ISSN 2632-1823
Éditeur: JAC-Antimicrobial Resistance
DOI: 10.1093/jacamr/dlac077

Critical Role of Innate Immunity to Flagellin in the Absence of Adaptive Immunity

Auteurs: Jun Zou, Xu Zhao, Zhenda Shi, Zhan Zhang, Matam Vijay-Kumar, Benoit Chassaing, Andrew T Gewirtz
Publié dans: The Journal of Infectious Diseases, Numéro 223/8, 2020, Page(s) 1478-1487, ISSN 0022-1899
Éditeur: University of Chicago Press
DOI: 10.1093/infdis/jiaa521

Fecal let-7b and miR-21 directly modulate the intestinal microbiota, driving chronic inflammation

Auteurs: Maite Casado-Bedmar, Maryline Roy, Louis Berthet, Jean-Pierre Hugot, Chunhua Yang, Hana Manceau, Katell Peoc’h, Benoit Chassaing, Didier Merlin, Emilie Viennois
Publié dans: Gut Microbes, Numéro 16, 2024, ISSN 1949-0976
Éditeur: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/19490976.2024.2394249

In vitromicrobiota model recapitulates and predicts individualised sensitivity to dietary emulsifier

Auteurs: Héloïse Rytter, Sabrine Naimi, Gary Wu, Jim Lewis, Maeva Duquesnoy, Lucile Vigué, Olivier Tenaillon, Eugeni Belda, Marta Vazquez-Gomez, Nina Touly, Djésia Arnone, Fuhua Hao, Ruth E Ley, Karine Clément, Laurent Peyrin-Biroulet, Andrew D Patterson, Andrew T Gewirtz, Benoit Chassaing
Publié dans: Gut, 2025, Page(s) gutjnl-2024-333925, ISSN 0017-5749
Éditeur: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/gutjnl-2024-333925

Dietary Emulsifiers Exacerbate Food Allergy and Colonic Type 2 Immune Response through Microbiota Modulation

Auteurs: Akihito Harusato, Benoit Chassaing, Charlène J. G. Dauriat, Chihiro Ushiroda, Wooseok Seo, Yoshito Itoh
Publié dans: Nutrients, Numéro 14, 2024, Page(s) 4983, ISSN 2072-6643
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/nu14234983

Inulin Fermentable Fiber Ameliorates Type I Diabetes via IL22 and Short-Chain Fatty Acids in Experimental Models

Auteurs: Jun Zou, Lavanya Reddivari, Zhenda Shi, Shiyu Li, Yanling Wang, Alexis Bretin, Vu L. Ngo, Michael Flythe, Michael Pellizzon, Benoit Chassaing, Andrew T. Gewirtz
Publié dans: Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology, 2021, ISSN 2352-345X
Éditeur: Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.jcmgh.2021.04.014

Commensal epitopes drive differentiation of colonic T regs

Auteurs: Michal P. Kuczma, Edyta A. Szurek, Anna Cebula, Benoit Chassaing, Yu-Jin Jung, Sang-Moo Kang, James G. Fox, Bärbel Stecher, Leszek Ignatowicz
Publié dans: Science Advances, Numéro 6/16, 2020, Page(s) eaaz3186, ISSN 2375-2548
Éditeur: Science Advances
DOI: 10.1126/sciadv.aaz3186

Lipocalin 2 deficiency-induced gut microbiota dysbiosis evokes metabolic syndrome in aged mice

Auteurs: Vishal Singh, Sarah Galla, Rachel M. Golonka, Andrew D. Patterson, Benoit Chassaing, Bina Joe, Matam Vijay-Kumar
Publié dans: Physiological Genomics, Numéro 52, 2020, Page(s) 314-321, ISSN 1094-8341
Éditeur: American Physiological Society
DOI: 10.1152/physiolgenomics.00118.2019

Vaccination against microbiota motility protects mice from the detrimental impact of dietary emulsifier consumption

Auteurs: Melissa C Kordahi 1 , Clara Delaroque 1 , Marie-Florence Bredèche 2 , Andrew T Gewirtz 3 , Benoit Chassaing 1
Publié dans: Plos Biology, 2024, ISSN 1544-9173
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3002289

Ingestion of probiotic (Lactobacillus helveticus and Bifidobacterium longum) alters intestinal microbial structure and behavioral expression following social defeat stress

Auteurs: Katherine A. Partrick, Anna M. Rosenhauer, Jérémie Auger, Amanda R. Arnold, Nicole M. Ronczkowski, Lanaya M. Jackson, Magen N. Lord, Sara M. Abdulla, Benoit Chassaing, Kim L. Huhman
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 11/1, 2021, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-021-83284-z

IL-22–induced cell extrusion and IL-18–induced cell death prevent and cure rotavirus infection

Auteurs: Zhan Zhang, Jun Zou, Zhenda Shi, Benyue Zhang, Lucie Etienne-Mesmin, Yanling Wang, Xuyan Shi, Feng Shao, Benoit Chassaing, Andrew T. Gewirtz
Publié dans: Science Immunology, Numéro 5/52, 2020, Page(s) eabd2876, ISSN 2470-9468
Éditeur: Sci Immunol.
DOI: 10.1126/sciimmunol.abd2876

Amelioration of metabolic syndrome by metformin associates with reduced indices of low-grade inflammation independently of the gut microbiota

Auteurs: Aneseh Adeshirlarijaney, Jun Zou, Hao Q. Tran, Benoit Chassaing, Andrew T. Gewirtz
Publié dans: American Journal of Physiology-Endocrinology and Metabolism, Numéro 317/6, 2019, Page(s) E1121-E1130, ISSN 0193-1849
Éditeur: American Physiological Society
DOI: 10.1152/ajpendo.00245.2019

Enhanced E. coli LF82 Translocation through the Follicle-associated Epithelium in Crohn’s Disease is Dependent on Long Polar Fimbriae and CEACAM6 expression, and Increases Paracellular Permeability

Auteurs: Åsa V Keita, Lina Yakymenko Alkaissi, Elin B Holm, Stéphanie D S Heil, Benoit Chassaing, Arlette Darfeuille-Michaud, Derek M McKay, Johan D Söderholm
Publié dans: Journal of Crohn's and Colitis, Numéro 14/2, 2019, Page(s) 216-229, ISSN 1873-9946
Éditeur: Elsevier Science
DOI: 10.1093/ecco-jcc/jjz144

Fungal lysozyme leverages the gut microbiota to curb DSS-induced colitis.

Auteurs: Ida S. Larsen; Benjamin A. H. Jensen; Benjamin A. H. Jensen; Erica Bonazzi; Béatrice S.-Y. Choi; Nanna N. Kristensen; Esben Gjerløff Wedebye Schmidt; Annika Suenderhauf; Laurence Morin; Peter Bjarke Olsen; Lea Benedicte Skov Hansen; Torsten Schröder; Christian Sina; Benoit Chassaing; André Marette
Publié dans: Gut Microbes, Numéro 1, 2021, ISSN 1949-0976
Éditeur: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/19490976.2021.1988836

Dietary emulsifier consumption alters gene expression in the amygdala and paraventricular nucleus of the hypothalamus in mice

Auteurs: Amanda R. Arnold, Benoit Chassaing, Bradley D. Pearce, Kim L. Huhman
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 12, 2022, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-022-13021-7

Impact of PepT1 deletion on microbiota composition and colitis requires multiple generations

Auteurs: Emilie Viennois, Adani Pujada, Junsik Sung, Chunhua Yang, Andrew T. Gewirtz, Benoit Chassaing, Didier Merlin
Publié dans: npj Biofilms and Microbiomes, Numéro 6/1, 2020, ISSN 2055-5008
Éditeur: npj Biofilms and Microbiomes
DOI: 10.1038/s41522-020-0137-y

Food additive emulsifiers and risk of cardiovascular disease in the NutriNet-Santé cohort: prospective cohort study

Auteurs: Laury Sellem 1 , Bernard Srour 2 , Guillaume Javaux 1 , Eloi Chazelas 1 , Benoit Chassaing 3 , Emilie Viennois 4 , Charlotte Debras 1 , Clara Salamé 1 , Nathalie Druesne-Pecollo 1 , Younes Esseddik 1 , Fabien Szabo de Edelenyi 1 , Cédric Agaësse 1 , Alexandre De Sa 1 , Rebecca Lutchia 1 , Erwan Louveau 1 , Inge Huybrechts 5 , Fabrice Pierre 6 , Xavier Coumoul 7 , Léopold K Fe
Publié dans: The BMJ, 2024, ISSN 1756-1833
Éditeur: The BMJ
DOI: 10.1136/bmj-2023-076058

“Western Diet”-Induced Adipose Inflammation Requires a Complex Gut Microbiota

Auteurs: Hao Q. Tran, Alexis Bretin, Aneseh Adeshirlarijaney, Beng San Yeoh, Matam Vijay-Kumar, Jun Zou, Timothy L. Denning, Benoit Chassaing, Andrew T. Gewirtz
Publié dans: Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology, Numéro 9/2, 2020, Page(s) 313-333, ISSN 2352-345X
Éditeur: Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.jcmgh.2019.09.009

Western diet promotes endometriotic lesion growth in mice and induces depletion of Akkermansia muciniphila in intestinal microbiota

Auteurs: Guillaume Parpex, Benoît Chassaing, Mathilde Bourdon, Pietro Santulli, Ludivine Doridot, Marine Thomas, Frédéric Batteux, Sandrine Chouzenoux, Charles Chapron, Carole Nicco, Louis Marcellin
Publié dans: BMC Medicine, Numéro 22, 2024, ISSN 1741-7015
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12916-024-03738-9

Obesity promotes fumonisin B1 hepatotoxicity

Auteurs: Léonie Dopavogui, Marion Régnier, Arnaud Polizzi, Quentin Ponchon, Sarra Smati, Wendy Klement, Frédéric Lasserre, Céline Lukowicz, Yannick Lippi, Anne Fougerat, Justine Bertrand-Michel, Claire Naylies, Cécile Canlet, Laurent Debrauwer, Elodie Rousseau-Bacquié, Laurence Gamet-Payrastre, Charlène Dauriat, Josefina Casas, Siska Croubels, Siegrid De Baere, Hester M. Burger, Benoit Chassaing, S
Publié dans: Science of The Total Environment, Numéro 891, 2024, Page(s) 164436, ISSN 0048-9697
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.scitotenv.2023.164436

Erythroid differentiation regulator-1 induced by microbiota in early life drives intestinal stem cell proliferation and regeneration

Auteurs: Hirohito Abo, Benoit Chassaing, Akihito Harusato, Miguel Quiros, Jennifer C. Brazil, Vu L. Ngo, Emilie Viennois, Didier Merlin, Andrew T. Gewirtz, Asma Nusrat, Timothy L. Denning
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-14258-z

Dietary Inulin Supplementation Affects Specific Plasmalogen Species in the Brain

Auteurs: Jean-Baptiste Bizeau, Mayssa Albouery, Stéphane Grégoire, Bénédicte Buteau, Lucy Martine, Marine Crépin, Alain M. Bron, Olivier Berdeaux, Niyazi Acar, Benoit Chassaing, Marie-Agnès Bringer
Publié dans: Nutrients, Numéro 14, 2024, Page(s) 3097, ISSN 2072-6643
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/nu14153097

The gut microbiome is associated with cocaine behavior and predicts addiction vulnerability in adult male rats

Auteurs: Gregory J Suess, Jennysue Kasiah, Sierra Simpson, Molly Brennan, Dana Conlisk, Lisa Maturin, Olivier L George, Benoit Chassaing, Kyle J Frantz
Publié dans: biorxiv, 2021, ISSN 2692-8205
Éditeur: biorxiv
DOI: 10.1101/2021.07.20.453110

Inhibition of Atg7 in intestinal epithelial cells drives resistance against Citrobacter rodentium

Auteurs: David Cune, Caterina Luana Pitasi, Alessia Rubiola, Trinath Jamma, Luca Simula, Camille Boucher, Apolline Fortun, Lucie Adoux, Franck Letourneur, Benjamin Saintpierre, Emmanuel Donnadieu, Benoît Terris, Pascale Bossard, Benoît Chassaing, Béatrice Romagnolo
Publié dans: Cell Death & Disease, Numéro 16, 2025, ISSN 2041-4889
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41419-025-07422-5

A Listeria monocytogenes Bacteriocin Can Target the Commensal Prevotella copri and Modulate Intestinal Infection

Auteurs: Nathalie Rolhion, Benoit Chassaing, Marie-Anne Nahori, Jana de Bodt, Alexandra Moura, Marc Lecuit, Olivier Dussurget, Marion Bérard, Massimo Marzorati, Hannah Fehlner-Peach, Dan R. Littman, Andrew T. Gewirtz, Tom Van de Wiele, Pascale Cossart
Publié dans: Cell Host & Microbe, Numéro 26, 2022, Page(s) 691-701.e5, ISSN 1931-3128
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2019.10.016

The TOTUM-63 Supplement and High-Intensity Interval Training Combination Limits Weight Gain, Improves Glycemic Control, and Influences the Composition of Gut Mucosa-Associated Bacteria in Rats on a High Fat Diet

Auteurs: Marine Dupuit, Vivien Chavanelle, Benoit Chassaing, Fanny Perriere, Monique Etienne, Claire Plissonneau, Audrey Boscaro, Nicolas Barnich, Vincent Pialoux, Thierry Maugard, Florian Le Joubioux, Sébastien Peltier, Pascal Sirvent, Yolanda F. Otero, Nathalie Boisseau
Publié dans: Nutrients, Numéro 13/5, 2021, Page(s) 1569, ISSN 2072-6643
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/nu13051569

Adaptation of adherent-invasive E. coli to gut environment: Impact on flagellum expression and bacterial colonization ability

Auteurs: Gwladys Sevrin; Sébastien Massier; Benoit Chassaing; Allison Agus; Julien Delmas; Jérémy Denizot; Elisabeth Billard; Nicolas Barnich
Publié dans: Gut Microbes, Numéro 1, 2020, ISSN 1949-0984
Éditeur: Taylor and Francis Online
DOI: 10.1080/19490976.2017.1421886

Akkermansia muciniphilacounteracts the deleterious effects of dietary emulsifiers on microbiota and host metabolism

Auteurs: Noëmie Daniel; Andrew T Gewirtz; Benoit Chassaing
Publié dans: Gut, Numéro 11, 2023, ISSN 1468-3288
Éditeur: BMJ Journals
DOI: 10.1136/gutjnl-2021-326835

Dietary Emulsifiers Directly Impact Adherent-Invasive E. coli Gene Expression to Drive Chronic Intestinal Inflammation

Auteurs: Emilie Viennois, Alexis Bretin, Philip E. Dubé, Alexander C. Maue, Charlène J.G. Dauriat, Nicolas Barnich, Andrew T. Gewirtz, Benoit Chassaing
Publié dans: Cell Reports, Numéro 33/1, 2020, Page(s) 108229, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2020.108229

Food additive emulsifiers and the risk of type 2 diabetes: analysis of data from the NutriNet-Santé prospective cohort study

Auteurs: Clara Salame 1 , Guillaume Javaux 1 , Laury Sellem 2 , Emilie Viennois 3 , Fabien Szabo de Edelenyi 1 , Cédric Agaësse 1 , Alexandre De Sa 1 , Inge Huybrechts 4 , Fabrice Pierre 5 , Xavier Coumoul 6 , Chantal Julia 7 , Emmanuelle Kesse-Guyot 2 , Benjamin Allès 1 , Léopold K Fezeu 1 , Serge Hercberg 8 , Mélanie Deschasaux-Tanguy 2 , Emmanuel Cosson 9 , Sopio Tatulashvili 9 ,
Publié dans: Lancet Diabetes Endocrinol, 2024, ISSN 2213-8587
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/s2213-8587(24)00086-x

Dietary fat and low fiber in purified diets differently impact the gut-liver axis to promote obesity-linked metabolic impairments.

Auteurs: Noëmie Daniel; Laίs Rossi Perazza; Thibault V. Varin; Jocelyn Trottier; Bruno Marcotte; Philippe St-Pierre; Olivier Barbier; Benoit Chassaing; André Marette
Publié dans: American Journal of Physiology - Gastrointestinal and Liver Physiology, Numéro 3, 2021, ISSN 0193-1857
Éditeur: American Physiological Society
DOI: 10.1152/ajpgi.00028.2021

Prognostic value of a combination of innovative factors (gut microbiota, sarcopenia, obesity, metabolic syndrome) to predict surgical/oncologic outcomes following surgery for sporadic colorectal cancer: a prospective cohort study protocol (METABIOTE)

Auteurs: Julie Veziant, Karine Poirot, Caroline Chevarin, Lucie Cassagnes, Pierre Sauvanet, Benoit Chassaing, Frederic Robin, Catherine Godfraind, Nicolas Barnich, Denis Pezet, Bruno Pereira, Johan Gagniere, Mathilde Bonnet
Publié dans: BMJ Open, Numéro 10/1, 2020, Page(s) e031472, ISSN 2044-6055
Éditeur: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/bmjopen-2019-031472

Minibioreactor arrays to model microbiome response to alcohol and tryptophan in the context of alcohol-associated liver disease

Auteurs: Anne-Marie Cassard, Wanchao Hu, Sabrine Naimi, Nicolas Trainel, Vanessa Liévin-Le Moal, Gabriel Perlemuter, Benoit Chassaing, Dragos Ciocan
Publié dans: NPJ Biofilm Microbiome, 2024, ISSN 2055-5008
Éditeur: NPJ Biofilms and Microbiomes
DOI: 10.21203/rs.3.rs-4383814/v1

Social overcrowding impacts gut microbiota, promoting stress, inflammation, and dysglycemia.

Auteurs: Clara Delaroque; Mélissa Chervy; Andrew T. Gewirtz; Benoit Chassaing
Publié dans: Gut Microbes, Numéro 3, 2021, ISSN 1949-0976
Éditeur: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/19490976.2021.2000275

Effect of Concurrent Training on Body Composition and Gut Microbiota in Postmenopausal Women with Overweight or Obesity

Auteurs: MARINE DUPUIT, MÉLANIE RANCE, CLAIRE MOREL, PATRICE BOUILLON, AUDREY BOSCARO, VINCENT MARTIN, EMILIE VAZEILLE, NICOLAS BARNICH, BENOIT CHASSAING, NATHALIE BOISSEAU
Publié dans: Medicine & Science in Sports & Exercise, Numéro 54, 2023, Page(s) 517-529, ISSN 0195-9131
Éditeur: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1249/mss.0000000000002809

Beneficial Effects of Linseed Supplementation on Gut Mucosa-Associated Microbiota in a Physically Active Mouse Model of Crohn’s Disease

Auteurs: Claire Plissonneau, Adeline Sivignon, Benoit Chassaing, Frederic Capel, Vincent Martin, Monique Etienne, Ivan Wawrzyniak, Pierre Chausse, Frederic Dutheil, Guillaume Mairesse, Guillaume Chesneau, Nathalie Boisseau, Nicolas Barnich
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 23, 2024, Page(s) 5891, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms23115891

The postnatal window is critical for the development of sex-specific metabolic and gut microbiota outcomes in offspring.

Auteurs: Laurence Daoust; Béatrice S.-Y. Choi; Sébastien Lacroix; Vanessa Vilela; Thibault V. Varin; Stéphanie Dudonné; Geneviève Pilon; Denis Roy; Emile Levy; Emile Levy; Yves Desjardins; Benoit Chassaing; André Marette
Publié dans: Gut Microbes, Numéro 1, 2021, ISSN 1949-0976
Éditeur: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/19490976.2021.2004070

Randomized Controlled-Feeding Study of Dietary Emulsifier Carboxymethylcellulose Reveals Detrimental Impacts on the Gut Microbiota and Metabolome

Auteurs: Benoit Chassaing 1 , Charlene Compher 2 , Brittaney Bonhomme 3 , Qing Liu 4 , Yuan Tian 4 , William Walters 5 , Lisa Nessel 6 , Clara Delaroque 7 , Fuhua Hao 4 , Victoria Gershuni 8 , Lillian Chau 9 , Josephine Ni 9 , Meenakshi Bewtra 10 , Lindsey Albenberg 11 , Alexis Bretin 12 , Liam McKeever 3 , Ruth E Ley 5 , Andrew D Patterson 4 , Gary D Wu 9 , Andrew T Gewirtz 13 , James
Publié dans: Gastroenterology, 2022, ISSN 0016-5085
Éditeur: W. B. Saunders Co., Ltd.
DOI: 10.1053/j.gastro.2021.11.006

Food additive emulsifiers and cancer risk: Results from the French prospective NutriNet-Santé cohort

Auteurs: Laury Sellem 1 2 , Bernard Srour 1 2 , Guillaume Javaux 1 , Eloi Chazelas 1 2 , Benoit Chassaing 2 3 , Emilie Viennois 4 , Charlotte Debras 1 2 , Nathalie Druesne-Pecollo 1 2 , Younes Esseddik 1 , Fabien Szabo de Edelenyi 1 , Nathalie Arnault 1 , Cédric Agaësse 1 , Alexandre De Sa 1 , Rebecca Lutchia 1 , Inge Huybrechts 5 , Augustin Scalbert 5 , Fabrice Pierre 2 6
Publié dans: Plos Medicine, 2024, ISSN 1549-1277
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pmed.1004338

Mirroring Amino Acids Hold Sway to Scare Pathobionts Away

Auteurs: Jeremy Denizot, Benoit Chassaing
Publié dans: Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology, Numéro 16, 2023, Page(s) 1038-1039, ISSN 2352-345X
Éditeur: Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.jcmgh.2023.09.009

Hyaluronan nanoplatelets exhibit extended residence time compared to spherical and ellipsoidal nanomaterials with equivalent surface potentials and volumes after oral delivery in rats

Auteurs: Hicheme Hadji, Catherine Cailleau, Benoit Chassaing, Mickaël Bourge, Gilles Ponchel, Kawthar Bouchemal
Publié dans: Biomaterials Science, Numéro 12, 2024, Page(s) 5812-5823, ISSN 2047-4830
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4bm00672k

Microbiome differences related to metformin intolerance among Black individuals with diabetes, a pilot cross-sectional study

Auteurs: Maya Fayfman 1 2 , Andrew T Gewirtz 3 , Clara Delaroque 4 , Gerardo Blanco 1 2 , Seid Gibanica 1 2 , Shanthi Srinivasan 5 , Benoit Chassaing 4
Publié dans: Matabolism Open, 2024, ISSN 2589-9368
Éditeur: Matabolism Open
DOI: 10.1016/j.metop.2023.100256

A Microbiota-Dependent Response to Anticancer Treatment in an In Vitro Human Microbiota Model: A Pilot Study With Hydroxycarbamide and Daunorubicin

Auteurs: Claire Amaris Hobson, Lucile Vigué, Mélanie Magnan, Benoit Chassaing, Sabrine Naimi, Benoit Gachet, Pauline Claraz, Thomas Storme, Stephane Bonacorsi, Olivier Tenaillon, André Birgy
Publié dans: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, Numéro 12, 2023, ISSN 2235-2988
Éditeur: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fcimb.2022.886447

Prevention and cure of murine C. difficile infection by a Lachnospiraceae strain

Auteurs: Juan Noriega Tejada, William A. Walters, Yanling Wang, Melissa Kordahi, Benoit Chassaing, Joseph Pickard, Gabriel Nunez, Ruth Ley, Andrew T. Gewirtz
Publié dans: Gut Microbes, Numéro 16, 2024, ISSN 1949-0976
Éditeur: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/19490976.2024.2392872

The Intestinal Microbiota: Our Best Frenemy in Radiation-Induced Damages?

Auteurs: Melissa C. Kordahi, Benoit Chassaing
Publié dans: Cell Host & Microbe, Numéro 29/1, 2021, Page(s) 7-9, ISSN 1931-3128
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2020.12.013

10.1186/s12934-024-02449-3.

Auteurs: Luis G Bermúdez-Humarán 1 , Benoit Chassaing 2 3 , Philippe Langella 4
Publié dans: Microbial cell factories, 2024, ISSN 1475-2859
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12934-024-02449-3

Flagellin-elicited adaptive immunity suppresses flagellated microbiota and vaccinates against chronic inflammatory diseases

Auteurs: Hao Q. Tran, Ruth E. Ley, Andrew T. Gewirtz, Benoit Chassaing
Publié dans: Nature Communications, Numéro 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-13538-y

Consumption of Select Dietary Emulsifiers Exacerbates the Development of Spontaneous Intestinal Adenoma

Auteurs: Emilie Viennois, Benoit Chassaing
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 22/5, 2021, Page(s) 2602, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms22052602

Ultra-processed foods and food additives in gut health and disease

Auteurs: Kevin Whelan 1 , Aaron S Bancil 2 , James O Lindsay 3 , Benoit Chassaing 4
Publié dans: Nature Review Gastroenterology and Hepatology, 2024, ISSN 1759-5045
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41575-024-00893-5

High-Intensity Interval Training and α-Linolenic Acid Supplementation Improve DHA Conversion and Increase the Abundance of Gut Mucosa-Associated Oscillospira Bacteria

Auteurs: Claire Plissonneau, Frederic Capel, Benoit Chassaing, Marine Dupuit, Florie Maillard, Ivan Wawrzyniak, Lydie Combaret, Frederic Dutheil, Monique Etienne, Guillaume Mairesse, Guillaume Chesneau, Nicolas Barnich, Nathalie Boisseau
Publié dans: Nutrients, Numéro 13/3, 2021, Page(s) 788, ISSN 2072-6643
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/nu13030788

Human Intestinal Microbiome Determines Individualized Inflammatory Response to Dietary Emulsifier Carboxymethylcellulose Consumption

Auteurs: Noëmie Daniel 1 , Gary D Wu 2 , William Walters 3 , Charlene Compher 4 , Josephine Ni 2 , Clara Delaroque 1 , Lindsey Albenberg 5 , Ruth E Ley 3 , Andrew D Patterson 6 , James D Lewis 7 , Andrew T Gewirtz 8 , Benoit Chassaing 9
Publié dans: Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology, 2024, ISSN 2352-345X
Éditeur: Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.jcmgh.2023.11.001

Probiotic: is diet part of the efficacy equation?

Auteurs: Héloïse Rytter, Emilie Combet, Benoit Chassaing
Publié dans: Gut Microbes, Numéro 15, 2024, ISSN 1949-0976
Éditeur: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/19490976.2023.2222438

IL-22–induced cell extrusion and IL-18–induced cell death prevent and cure rotavirus infection

Auteurs: Zhan Zhang; Jun Zou; Zhenda Shi; Benyue Zhang; Lucie Etienne-Mesmin; Lucie Etienne-Mesmin; Yanling Wang; Xuyan Shi; Feng Shao; Benoit Chassaing; Andrew T. Gewirtz
Publié dans: Science Immunology, Numéro 1, 2021, ISSN 2470-9468
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/sciimmunol.abd2876

Dietary emulsifier consumption accelerates type 1 diabetes development in NOD mice

Auteurs: Clara Delaroque 1 , Benoit Chassaing 2
Publié dans: NPJ Biofilms Microbiomes, 2024, ISSN 2055-5008
Éditeur: NPJ Biofilms Microbiomes
DOI: 10.1038/s41522-023-00475-4

Beneficial Effects of Natural Mineral Waters on Intestinal Inflammation and the Mucosa-Associated Microbiota

Auteurs: Nicolas Barnich, Michael Rodrigues, Pierre Sauvanet, Caroline Chevarin, Sylvain Denis, Olivier Le Goff, Danielle Faure-Imbert, Thierry Hanh, Christian F Roques, Benoit Chassaing, Monique Alric
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 22/9, 2021, Page(s) 4336, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms22094336

The intestinal microbiota regulates host cholesterol homeostasis

Auteurs: Tiphaine Le Roy, Emelyne Lécuyer, Benoit Chassaing, Moez Rhimi, Marie Lhomme, Samira Boudebbouze, Farid Ichou, Júlia Haro Barceló, Thierry Huby, Maryse Guerin, Philippe Giral, Emmanuelle Maguin, Nathalie Kapel, Philippe Gérard, Karine Clément, Philippe Lesnik
Publié dans: BMC Biology, Numéro 17/1, 2019, ISSN 1741-7007
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12915-019-0715-8

Comparative analysis of the duodenojejunal microbiome with the oral and fecal microbiomes reveals its stronger association with obesity and nutrition

Auteurs: Emilie Steinbach, Eugeni Belda, Rohia Alili, Solia Adriouch, Charlène J. G. Dauriat, Gianfranco Donatelli, Jean-Loup Dumont, Filippo Pacini, Thierry Tuszynski, Véronique Pelloux, Flavien Jacques, Laura Creusot, Emavieve Coles, Paul Taillandier, Marta Vazquez Gomez, Davide Masi, Véronique Mateo, Sébastien André, Melissa Kordahi, Christine Rouault, Jean-Daniel Zucker, Harry Sokol, Laurent Gense
Publié dans: Gut Microbes, Numéro 16, 2024, ISSN 1949-0976
Éditeur: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/19490976.2024.2405547

Connecting the Dots: Dietary Fat, Microbiota Dysbiosis, Altered Metabolome, and Colon Cancer

Auteurs: Emilie Viennois 1 , Andrew T Gewirtz 2 , Benoit Chassaing 3
Publié dans: Gastroenterology, 2023, ISSN 0016-5085
Éditeur: W. B. Saunders Co., Ltd.
DOI: 10.1053/j.gastro.2021.10.018

Direct impact of commonly used dietary emulsifiers on human gut microbiota

Auteurs: Sabrine Naimi, Emilie Viennois, Andrew T. Gewirtz, Benoit Chassaing
Publié dans: Microbiome, Numéro 9/1, 2021, ISSN 2049-2618
Éditeur: Microbiome
DOI: 10.1186/s40168-020-00996-6

Food Additive Emulsifiers and Their Impact on Gut Microbiome, Permeability, and Inflammation: Mechanistic Insights in Inflammatory Bowel Disease

Auteurs: Aaron S Bancil, Alicia M Sandall, Megan Rossi, Benoit Chassaing, James O Lindsay, Kevin Whelan
Publié dans: Journal of Crohn's and Colitis, 2020, ISSN 1873-9946
Éditeur: Elsevier Science
DOI: 10.1093/ecco-jcc/jjaa254

Organ-level protein networks as a reference for the host effects of the microbiome

Auteurs: Robert H. Mills, Jacob M. Wozniak, Alison Vrbanac, Anaamika Campeau, Benoit Chassaing, Andrew Gewirtz, Rob Knight, David J. Gonzalez
Publié dans: Genome Research, Numéro 30/2, 2020, Page(s) 276-286, ISSN 1088-9051
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.256875.119

Microbiota fermentation-NLRP3 axis shapes the impact of dietary fibres on intestinal inflammation

Auteurs: Vishal Singh, Beng San Yeoh, Rachel E Walker, Xia Xiao, Piu Saha, Rachel M Golonka, Jingwei Cai, Alexis Charles Andre Bretin, Xi Cheng, Qing Liu, Michael D Flythe, Benoit Chassaing, Gregory C Shearer, Andrew D Patterson, Andrew T Gewirtz, Matam Vijay-Kumar
Publié dans: Gut, Numéro 68/10, 2019, Page(s) 1801-1812, ISSN 0017-5749
Éditeur: BMJ Publishing Group
DOI: 10.1136/gutjnl-2018-316250

Segmented Filamentous Bacteria Prevent and Cure Rotavirus Infection

Auteurs: Zhenda Shi, Jun Zou, Zhan Zhang, Xu Zhao, Juan Noriega, Benyue Zhang, Chunyu Zhao, Harshad Ingle, Kyle Bittinger, Lisa M. Mattei, Andrea J. Pruijssers, Richard K. Plemper, Timothy J. Nice, Megan T. Baldridge, Terence S. Dermody, Benoit Chassaing, Andrew T. Gewirtz
Publié dans: Cell, Numéro 179/3, 2019, Page(s) 644-658.e13, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2019.09.028

Vers un vaccin contre les maladies inflammatoires chroniques ?

Auteurs: Sabrine Naimi, Benoit Chassaing
Publié dans: médecine/sciences, Numéro 36/8-9, 2020, Page(s) 689-691, ISSN 0767-0974
Éditeur: Editions E D K
DOI: 10.1051/medsci/2020137

Airway environment drives the selection of quorum sensing mutants and promote Staphylococcus aureus chronic lifestyle

Auteurs: Xiongqi Ding, Catherine Robbe-Masselot, Xiali Fu, Renaud Léonard, Benjamin Marsac, Charlene J. G. Dauriat, Agathe Lepissier, Héloïse Rytter, Elodie Ramond, Marion Dupuis, Daniel Euphrasie, Iharilalao Dubail, Cécile Schimmich, Xiaoquan Qin, Jessica Parraga, Maria Leite-de-Moraes, Agnes Ferroni, Benoit Chassaing, Isabelle Sermet-Gaudelus, Alain Charbit, Mathieu Coureuil, Anne Jamet
Publié dans: Nature Communications, Numéro 14, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43863-2

Host/microbiota interactions in health and diseases—Time for mucosal microbiology!

Auteurs: Noëmie Daniel, Emelyne Lécuyer, Benoit Chassaing
Publié dans: Mucosal Immunology, 2020, ISSN 1933-0219
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41385-021-00383-w

Hyaluronan nanoplatelets exhibit extended residence time compared to spherical and ellipsoidal nanomaterials with equivalent surface potentials and volumes after oral delivery in rats

Auteurs: Hadji, Hicheme; Cailleau, Catherine; Chassaing, Benoit; Bourge, Mickaël; Ponchel, Gilles; Bouchemal, Kawthar
Publié dans: Biomaterial Sciences, Numéro 1, 2025, ISSN 2047-4849
Éditeur: Biomaterial Sciences

The Hidden Effect of Nod2 in the Host/Microbiota Relationship

Auteurs: Noëmie Daniel, Benoit Chassaing
Publié dans: Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology, Numéro 10/2, 2020, Page(s) 424-425, ISSN 2352-345X
Éditeur: Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.jcmgh.2020.05.001

Emulsifiers Impact Colonic Length in Mice and Emulsifier Restriction is Feasible in People with Crohn’s Disease

Auteurs: Alicia M. Sandall, Selina R. Cox, James O. Lindsay, Andrew T. Gewirtz, Benoit Chassaing, Megan Rossi, Kevin Whelan
Publié dans: Nutrients, Numéro 12/9, 2020, Page(s) 2827, ISSN 2072-6643
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/nu12092827

Mucus-penetrating microbiota drive chronic low-grade intestinal inflammation and metabolic dysregulation

Auteurs: Melissa C. Kordahi, Noëmie Daniel, Andrew T. Gewirtz, Benoit Chassaing
Publié dans: Gut Microbes, Numéro 17, 2025, ISSN 1949-0976
Éditeur: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/19490976.2025.2455790

Tolerogenic Dendritic Cells Shape a Transmissible Gut Microbiota that Protects from Metabolic Diseases

Auteurs: Emelyne Lécuyer, Tiphaine Le Roy, Aurélie Gestin, Amélie Lacombe, Catherine Philippe, Maharajah Ponnaiah, Jean-Baptiste Huré, Magali Fradet, Farid Ichou, Samira Boudebbouze, Thierry Huby, Emmanuel Gautier, Moez Rhimi, Emmanuelle Maguin, Nathalie Kapel, Philippe Gérard, Nicolas Venteclef, Michéle Garlatti, Benoit Chassaing, Philippe Lesnik
Publié dans: Diabetes, 2021, Page(s) db201177, ISSN 0012-1797
Éditeur: American Diabetes Association
DOI: 10.2337/db20-1177

Impact of a high-fat diet on the fatty acid composition of the retina

Auteurs: Mayssa Albouery, Bénédicte Buteau, Stéphane Grégoire, Lucy Martine, Ségolène Gambert, Alain M. Bron, Niyazi Acar, Benoit Chassaing, Marie-Agnès Bringer
Publié dans: Experimental Eye Research, Numéro 196, 2020, Page(s) 108059, ISSN 0014-4835
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.exer.2020.108059

The Host-Microbiome Response to Hyperbaric Oxygen Therapy in Ulcerative Colitis Patients

Auteurs: Carlos G. Gonzalez, Robert H. Mills, Melissa C. Kordahi, Marvic Carrillo-Terrazas, Henry Secaira-Morocho, Christella E. Widjaja, Matthew S. Tsai, Yash Mittal, Brian A. Yee, Fernando Vargas, Kelly Weldon, Julia M. Gauglitz, Clara Delaroque, Consuelo Sauceda, Leigh-Ana Rossitto, Gail Ackermann, Gregory Humphrey, Austin D. Swafford, Corey A. Siegel, Jay C. Buckey, Laura E. Raffals, Charlotte Sadler,
Publié dans: Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology, Numéro 14, 2023, Page(s) 35-53, ISSN 2352-345X
Éditeur: Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.jcmgh.2022.03.008

Perinatal Morphine Exposure Induces Long-Term Changes in the Intestinal Microbiota of Male and Female Rats

Auteurs: Hannah J. Harder, Charlène J.G. Dauriat, Benoit Chassaing, Anne Z. Murphy
Publié dans: 2023
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.09.20.558694

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