Descripción del proyecto DEENESFRITPL El modesto erizo de mar arroja luz sobre la evolución del desarrollo y sus reguladores El desarrollo es un proceso complejo altamente regulado. Entre los reguladores de la expresión genética se encuentran elementos reguladores del ADN como los promotores y los potenciadores. Las mutaciones de los reguladores desempeñan un papel no solo en los estados patológicos, sino también en la evolución de morfologías nuevas. De este modo, comprender la evolución de las redes reguladoras genéticas del desarrollo constituye un elemento importante del rompecabezas del desarrollo. El proyecto financiado con fondos europeos evolSingleCellGRN aplica metodologías unicelulares avanzadas en los erizos de mar, incluyendo un ensayo de accesibilidad de la cromatina (ATAC-Seq) recientemente desarrollado, el cual señala áreas «abiertas» a la unión y, por consiguiente, a la regulación. Facilita asimismo el estudio de las modificaciones epigenéticas a escala de todo el genoma. La identificación de elementos reguladores específicos de los tejidos y la evaluación de los efectos cuando mutan debería arrojar luz sobre cómo evoluciona el desarrollo. Mostrar el objetivo del proyecto Ocultar el objetivo del proyecto Objetivo Cell types in development arise from precise patterns of gene expression driven by differential usage of DNA regulatory elements. Mutations affecting these elements, or proteins binding them, are major contributors to disease and underlie the evolution of new morphologies. To better understand these elements and how they evolve, I introduce a set of single-cell RNA and ATAC-Seq sequencing technologies that: A) Identify tissue-specific regulatory elements and expression profiles by interrogating individual cells, B) Allow for a precise read-out of developmental responses to mutation and perturbation, including cell-fate re-specification, C) Lead to the development of a regulatory-information based concept of homology that will be used to understand developmental evolution. The research makes use of sea urchins. The well-annotated sea urchin regulatory network, a detailed understanding of inductive interactions in early development, and an active body of evolutionary research justify this choice. Using single-cell ATAC-Seq and a new method for resolving single-cell, nascent transcripts, I will build a detailed atlas of sea urchin development and use this atlas to understand how regulatory landscapes change during specification and how they evolve between closely related species. I will also investigate, at single-cell resolution, how larval skeletal cells are regenerated following the loss of a cell lineage that mirrors euechinoid evolution. To better understand the origins of cell types in sea urchins, I will characterize embryos of the cnidarian Nematostella, using shared regulatory sites to define cell types which I will compare to urchins and my previous work in Drosophila. The work will generate single-cell methods for non-traditional model systems and help to resolve the processes by which, and the paths along which, development evolves. Ámbito científico natural sciencesbiological sciencesgeneticsDNAnatural sciencesbiological sciencesbiochemistrybiomoleculesproteinsnatural sciencesbiological sciencesgeneticsmutationnatural sciencesbiological sciencesgeneticsRNAmedical and health sciencesclinical medicineembryology Palabras clave single-cell Programa(s) H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC) Main Programme Tema(s) ERC-2018-STG - ERC Starting Grant Convocatoria de propuestas ERC-2018-STG Consulte otros proyectos de esta convocatoria Régimen de financiación ERC-STG - Starting Grant Institución de acogida HUMBOLDT-UNIVERSITAET ZU BERLIN Aportación neta de la UEn € 1 499 900,00 Dirección UNTER DEN LINDEN 6 10117 Berlin Alemania Ver en el mapa Región Berlin Berlin Berlin Tipo de actividad Higher or Secondary Education Establishments Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window Participación en los programas de I+D de la UE Opens in new window Red de colaboración de HORIZON Opens in new window Coste total € 1 499 900,00 Beneficiarios (1) Ordenar alfabéticamente Ordenar por aportación neta de la UE Ampliar todo Contraer todo HUMBOLDT-UNIVERSITAET ZU BERLIN Alemania Aportación neta de la UEn € 1 499 900,00 Dirección UNTER DEN LINDEN 6 10117 Berlin Ver en el mapa Región Berlin Berlin Berlin Tipo de actividad Higher or Secondary Education Establishments Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window Participación en los programas de I+D de la UE Opens in new window Red de colaboración de HORIZON Opens in new window Coste total € 1 499 900,00
