Programmable nucleic acid toolkits for cell-free diagnostics and genetically encoded biosensing

Informations projet

PRO-TOOLKITS

N° de convention de subvention: 819160

DOI

10.3030/819160

Projet clôturé

Date de signature de la CE 22 Mars 2019

Date de début 1 Octobre 2019

Date de fin 30 Septembre 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 999 375,00

Contribution de l’UE

€ 1 999 375,00

Coordonné par

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI ROMA TOR VERGATA
Italy

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Publications

Peer reviewed articles (17)

Synthetic DNA-based nanoswimmers driven by enzyme catalysis

Auteurs: Tania Patiño; Serena Gentile; Lorena Baranda; Erica Del Grosso; Rafael Mestre; Samuel Sanchez; Francesco Ricci
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 21, 2024, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.26434/chemrxiv-2023-bxsbh

Programmable Cell-Free Transcriptional Switches for Antibody Detection

Auteurs: Aitor Patino Diaz; Sara Bracaglia; Simona Ranallo; Tania Patino; Alessandro Porchetta; Francesco Ricci
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 5, 2022, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c11706

Using antibodies to control DNA-templated chemical reactions

Auteurs: Lorena Baranda Pellejero, Malihe Mahdifar, Gianfranco Ercolani, Jonathan Watson, Tom Brown, Francesco Ricci
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-20024-3

Autonomous and programmable reorganization of DNA-based polymers using redox chemistry

Auteurs: Gentile, Serena; Del Grosso, Erica; Prins, Leonard J; Ricci, Francesco
Publié dans: Chemistry a European Journal, Numéro 12, 2022, ISSN 0947-6539
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.26434/chemrxiv-2022-vjbbz

Spontaneous Reorganization of DNA-Based Polymers in Higher Ordered Structures Fueled by RNA

Auteurs: Serena Gentile; Erica Del Grosso; Passa E. Pungchai; Elisa Franco; Leonard J. Prins; Francesco Ricci
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 2, 2021, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c09503

Reorganization of Self‐Assembled DNA‐Based Polymers using Orthogonally Addressable Building Blocks**

Auteurs: Serena Gentile, Erica Del Grosso, Leonard J. Prins, Francesco Ricci
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 60/23, 2021, Page(s) 12911-12917, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202101378

Non-natural protein-protein communication mediated by a DNA-based, antibody-responsive device

Auteurs: Simona Ranallo; Daniela Sorrentino; Elisabetta Delibato; Gianfranco Ercolani; Kevin W. Plaxco; Francesco Ricci
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 4, 2021, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202115680

Orthogonal enzyme-driven timers for DNA strand displacement reactions

Auteurs: Bucci, Juliette; Irmisch, Patrick; Del Grosso, Erica; Seidel, Ralf; Ricci, Francesco
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 8, 2023, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.26434/chemrxiv-2022-2qzzj

Thermo-Programmed Synthetic DNA-Based Receptors

Auteurs: Mariottini, Davide; Idili, Andrea; Ercolani, Gianfranco; Ricci, Francesco
Publié dans: ACS nano, 2023, ISSN 1936-0851
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.2c07039

Dissipative operation of pH-responsive DNA-based nanodevices.

Auteurs: Davide Mariottini; Daniele Del Giudice; Gianfranco Ercolani; Stefano Di Stefano; Francesco Ricci
Publié dans: Chemical Science, Numéro 1, 2021, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1sc03435a

Timed Pulses in DNA strand displacement reactions

Auteurs: Juliette Bucci; Patrick Irmisch; Erica Del Grosso; Ralf Seidel; Francesco Ricci
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 14, 2023, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.26434/chemrxiv-2023-99815

Programmable, Multiplexed DNA Circuits Supporting Clinically Relevant, Electrochemical Antibody Detection.

Auteurs: Sara Bracaglia; Simona Ranallo; Simona Ranallo; Kevin W. Plaxco; Francesco Ricci
Publié dans: ACS sensors, vol 6, iss 6, Numéro 3, 2021, ISSN 2379-3694
Éditeur: ACS
DOI: 10.1021/acssensors.1c00790

Protein‐Controlled Actuation of Dynamic Nucleic Acid Networks by Using Synthetic DNA Translators**

Auteurs: Alessandro Bertucci, Alessandro Porchetta, Erica Del Grosso, Tania Patiño, Andrea Idili, Francesco Ricci
Publié dans: Angewandte Chemie, Numéro 132/46, 2020, Page(s) 20758-20762, ISSN 0044-8249
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/ange.202008553

Rational Control of the Activity of a Cu 2+ -Dependent DNAzyme by Re-engineering Purely Entropic Intrinsically Disordered Domains

Auteurs: Daniela Sorrentino, Simona Ranallo, Francesco Ricci
Publié dans: ACS Applied Materials & Interfaces, Numéro 13/8, 2021, Page(s) 9300-9305, ISSN 1944-8244
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsami.0c09472

Synthetic Genes For Dynamic Regulation Of DNA‐Based Receptors

Auteurs: Daniela Sorrentino; Simona Ranallo; Eiji Nakamura; Elisa Franco; Francesco Ricci
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 8, 2024, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202319382

Orthogonal regulation of DNA nanostructure self-assembly and disassembly using antibodies

Auteurs: Simona Ranallo, Daniela Sorrentino, Francesco Ricci
Publié dans: Nature Communications, Numéro 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-13104-6

Synthetic Antigen-Conjugated DNA Systems for Antibody Detection and Characterization

Auteurs: Ranallo, Simona; Bracaglia, Sara; Sorrentino, Daniela; Ricci, Francesco
Publié dans: ACS Sensors, Numéro 6, 2022, ISSN 2379-3694
Éditeur: ACS
DOI: 10.1021/acssensors.3c00564