Microbial genome defence pathways: from molecular mechanisms to next-generation molecular tools

Informations projet

CRISPR2.0

N° de convention de subvention: 820152

DOI

10.3030/820152

Projet clôturé

Date de signature de la CE 7 Mars 2019

Date de début 1 Mai 2019

Date de fin 31 Octobre 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 996 525,00

Contribution de l’UE

€ 1 996 525,00

Coordonné par

UNIVERSITAT ZURICH
Switzerland

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Publications

Peer reviewed articles (12)

Past, present, and future of CRISPR genome editing technologies

Auteurs: Martin Pacesa, Oana Pelea, Martin Jinek
Publié dans: Cell, Numéro 187, 2024, Page(s) 1076-1100, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2024.01.042

Target DNA-dependent activation mechanism of the prokaryotic immune system SPARTA

Auteurs: Giada Finocchio; Balwina Koopal; Ana Potocnik; Clint Heijstek; Adrie H Westphal; Martin Jinek; Daan C Swarts
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad1248

Multiplexed Single-Molecule Experiments Reveal Nucleosome Invasion Dynamics of the Cas9 Genome Editor

Auteurs: Kristina Makasheva; Louise C. Bryan; Carolin Anders; Sherin Panikulam; Martin Jinek; Beat Fierz
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 143, 2021, Page(s) 16313–16319, ISSN 1520-5126
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.5167/uzh-210326

DNA end sensing and cleavage by the Shedu anti-phage defense system

Auteurs: Luuk Loeff, Alexander Walter, Gian Tizio Rosalen, Martin Jinek
Publié dans: Cell, Numéro 3, 2025, Page(s) 721-733, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1101/2023.08.10.552762

Substrate selectivity and catalytic activation of the type III CRISPR ancillary nuclease Can2

Auteurs: Kenny Jungfer, Annina Sigg, Martin Jinek
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad1102

Molecular mechanism of plasmid elimination by the DdmDE defense system

Auteurs: Luuk Loeff, David W. Adams, Christelle Chanez, Sandrine Stutzmann, Laurie Righi, Melanie Blokesch, Martin Jinek
Publié dans: Science, Numéro 385, 2024, Page(s) 188-194, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adq0534

Mechanistic basis for PYROXD1-mediated protection of the human tRNA ligase complex against oxidative inactivation

Auteurs: Luuk Loeff, Alena Kroupova, Igor Asanović, Franziska M. Boneberg, Moritz M. Pfleiderer, Luca Riermeier, Alexander Leitner, Andrè Ferdigg, Fabian Ackle, Javier Martinez, Martin Jinek
Publié dans: Nature Structural & Molecular Biology, Numéro 32, 2025, Page(s) 1205-1212, ISSN 1545-9993
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-025-01516-6

Structural basis for the assembly of the type V CRISPR-associated transposon complex

Auteurs: Michael Schmitz, Irma Querques, Seraina Oberli, Christelle Chanez, Martin Jinek
Publié dans: Cell, Numéro 185, 2022, Page(s) 4999-5010, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2022.11.009

Mechanistic determinants and dynamics of cA6 synthesis in type III CRISPR-Cas effector complexes

Auteurs: Kenny Jungfer, Štefan Moravčík, Carmela Garcia-Doval, Anna Knörlein, Jonathan Hall, Martin Jinek
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 53, 2025, Page(s) gkae1277, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae1277

Activation and self-inactivation mechanisms of the cyclic oligoadenylate-dependent CRISPR ribonuclease Csm6

Auteurs: Carmela Garcia-Doval, Frank Schwede, Christian Berk, Jakob T. Rostøl, Ole Niewoehner, Oliver Tejero, Jonathan Hall, Luciano A. Marraffini, Martin Jinek
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-15334-5

Target site selection and remodelling by type V CRISPR-transposon systems

Auteurs: Irma Querques, Michael Schmitz, Seraina Oberli, Christelle Chanez, Martin Jinek
Publié dans: Nature, Numéro 599, 2021, Page(s) 497-502, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-021-04030-z

Structural basis of TnsC oligomerization and transposase recruitment in type I-B CRISPR-associated transposons

Auteurs: Giada Finocchio, Irma Querques, Christelle Chanez, Katarzyna J Speichert, Martin Jinek
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 53, 2025, Page(s) gkaf149, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaf149

Other (1)

Structural basis for RNA-mediated assembly of type V CRISPR-associated transposons

Auteurs: Michael Schmitz, Irma Querques, Seraina Oberli, Christelle Chanez, Martin Jinek
Publié dans: 2022
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2022.06.17.496590