Skip to main content
Aller à la page d’accueil de la Commission européenne (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)
français français
CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
CORDIS

Fostering Synthetic Biology standardisation through international collaboration

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Website and social media accounts (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Website and social media accounts The project website and the Social Media accounts will contain information on the aims partners work progress and current state of the project Month of Delivery M3 responsible partner DARWIN

Establishment of SB chassis of reference (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Establishment of a limited number of SB chassis of reference Identification of target sequences genomewide analysis of relevant genetic determinants of the above mentioned species for specific performance scenarios and definition of streamlined genomes optimally adapted to each setting Accreditation of a minimum of 46 chassis extensible to about one dozen as hosts of engineered pathways for bioproduction or bioremediation The deliverable will make explicit the lowhanging fruits that can be reached out during the Project lifetime in terms of standardized platforms that can be established and which will become a benchmark for future additions to the collection Month of delivery M12 Responsible partner CSIC

Standards and ownership report (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Standards and ownership report In this report we provide a detailed description of the activities carried out in WP5 and a discussion on responsibility in relation to knowledge infrastructures for synthetic biology Month of delivery M35 Responsible partner UiO

Review of standards in SB: detailing the gaps, challenges and opportunities (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Review of standards in synthetic biology detailing the gaps challenges and opportunities Month of delivery M20 Responsible partner IMPERIAL

Online repository of existing and novel biocontainment strategies. (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Online repository of existing and novel biocontainment strategies Month of Delivery M34 Responsible partner Biofaction

White paper of the BIOROBOOST project (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

White paper of the BIOROBOOST project The white paper will summarize all the advances conclusions and recommendations resulting from the project and will especially target the policy community Month of Delivery M34 responsible partner UVEG

White paper on exemplar metadata standards for use in biological metrology (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

D12 White paper on exemplar metadata standards and biological interdependencies for use in biological metrology Month of delivery M24 Responsible partner IMPERIAL EDIN ETH

Standardisation and multi-cellular systems report (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Standardisation and multicellular systems report Month of delivery M34 responsible partner UEDINThe deliverables of this WP will include an overview of the modelling performed as well as recommendations

Standardisation and mammalian systems report (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Standardisation and mammalian systems report Month of delivery M30 responsible partner UEDINThe deliverables of this WP will include an overview of the modelling performed as well as recommendations

Standardisation and yeast systems report (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Standardisation and yeast systems report Month of delivery M28 responsible partner UEDIN The deliverables of this WP3 will include an overview of the modelling performed as well as recommendations

Report about incorporation efforts of safety relevant data and information in SB standards (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Report about incorporation efforts of safety relevant data and information in SB standards Month of Delivery M24 Responsible partner Biofaction

A conceptual analysis of standards (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

A conceptual analysis of standards The first deliverable of WP4 is a description of an analytic framework for studying standards within the scope of the project The description will explain core theories how those together conceptualise standardisation and how the framework lends itself to the empirical research that will characterise WP4 and WP5 This document will serve all of those involved in these two work packages but it will also offer the rest of the project team a different perspective on the type of work that they are carrying out As such it plays both a functional role and a critical role Month of delivery M21 Responsible partner UEDIN

Workshop report about the initiation of the interface between science, industry and risk assessment authorities (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Workshop report about the initiation of the interface between science industry and risk assessment authorities Month of Delivery Month of the first workshop plus 3 Months Responsible partner EMBO

A community map (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

A community map WP4 will also deliver a detailed description of relevant parties involved in the ongoing design and use of the standard The communities listed and described will form a representative set of people objects institutions and practices The map will describe key relationships between the different communities The map will be constructed using methods commonly employed in the social sciences Specifically the projects participants will serve as the first actors identified and then by investigating their connections the map will be expanded in steps Short qualitative interviews may be used to acquire greater detail about relations when necessaryThe map will serve several ends First overviews of social groups and their relationships are crucial to social scientific research It will support the rest of work carried out in WP4 which focuses on the social infrastructure that supports standards including relationships between people and their institutions Second it will contribute to WP5 and help link both packages We place value in working together in order to sustain an extended social scientific perspective Third it will function as a basis against with which to track changes in the network something which has both social scientific benefits and can help scientific practitioners to comprehend how their community is developing and what vital parties may be missing This deliverable will be made possible by the empirical data gathered which will also be taken up and expanded in WP5 Month of delivery M24 Responsible partner UEDIN

Upgraded SEVA platform (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Upgraded SEVA platform with genetic tools for the set of chassis adopted in BIOROBOOST and made accessible to the community through an automated on line requestretrievaldelivery system operating on an Open Source basis Month of delivery M12 Responsible partner CSIC

Tools for modelling chassis-implant and chassis-niche interplay (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Tools for modelling chassisimplant and chassisniche interplay Implementation of complete genomic and metabolic models of each of the chassis and the interactions with implants and with selected environmental parameters specific of each application setting SBML will be used to record such parameter sets And also the extension of SBOL to include the description of chassis bacterial compartments that is not possible with current SBOL version Month of delivery M12 Responsible partner UNEW

Publications

Concomitant prediction of environmental fate and toxicity of chemical compounds (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Juan Antonio Garcia-Martin, Max Chavarría, Victor de Lorenzo, Florencio Pazos
Publié dans: Biology Methods and Protocols, Numéro 5/1, 2020, ISSN 2396-8923
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/biomethods/bpaa025

Targeted Depletion of Bacteria from Mixed Populations by Programmable Adhesion with Antagonistic Competitor Cells (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: See-Yeun Ting, Esteban Martínez-García, Shuo Huang, Savannah K. Bertolli, Katherine A. Kelly, Kevin J. Cutler, Elizabeth D. Su, Hui Zhi, Qing Tang, Matthew C. Radey, Manuela Raffatellu, S. Brook Peterson, Víctor de Lorenzo, Joseph D. Mougous
Publié dans: Cell Host & Microbe, Numéro 28/2, 2020, Page(s) 313-321.e6, ISSN 1931-3128
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2020.05.006

Out of the Abyss: Genome and Metagenome Mining Reveals Unexpected Environmental Distribution of Abyssomicins (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Alba Iglesias, Adriel Latorre-Pérez, James E. M. Stach, Manuel Porcar, Javier Pascual
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 11, 2020, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2020.00645

The long journey towards standards for engineering biosystems (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Jacob Beal, Angel Goñi‐Moreno, Chris Myers, Ariel Hecht, María del Carmen Vicente, Maria Parco, Markus Schmidt, Kenneth Timmis, Geoff Baldwin, Steffi Friedrichs, Paul Freemont, Daisuke Kiga, Elena Ordozgoiti, Maja Rennig, Leonardo Rios, Kristie Tanner, Víctor Lorenzo, Manuel Porcar
Publié dans: EMBO reports, Numéro 21/5, 2020, ISSN 1469-221X
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.202050521

Predictive design of sigma factor-specific promoters (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Maarten Van Brempt, Jim Clauwaert, Friederike Mey, Michiel Stock, Jo Maertens, Willem Waegeman, Marjan De Mey
Publié dans: Nature Communications, Numéro 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-19446-w

A Bifan Motif Shaped by ArsR1, ArsR2, and Their Cognate Promoters Frames Arsenic Tolerance of Pseudomonas putida (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Gonzalo Durante-Rodríguez, David Páez-Espino, Víctor de Lorenzo
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 12, 2021, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2021.641440

Exploiting geometric similarity for statistical quantification of fluorescence spatial patterns in bacterial colonies (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: David R. Espeso, Elena Algar, Esteban Martínez-García, Víctor de Lorenzo
Publié dans: BMC Bioinformatics, Numéro 21/1, 2020, ISSN 1471-2105
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12859-020-3490-1

The long and winding road: Accidents and tinkering in software standardization (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Sergi Valverde
Publié dans: Mètode Revista de difusió de la investigació, Numéro 11, 2020, ISSN 2174-9221
Éditeur: University of Valencia
DOI: 10.7203/metode.11.16112

ArsH protects Pseudomonas putida from oxidative damage caused by exposure to arsenic (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: A. David Páez‐Espino, Pablo I. Nikel, Max Chavarría, Víctor Lorenzo
Publié dans: Environmental Microbiology, Numéro 22/6, 2020, Page(s) 2230-2242, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.14991

Subcellular Architecture of the xyl Gene Expression Flow of the TOL Catabolic Plasmid of Pseudomonas putida mt-2 (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Juhyun Kim, Angel Goñi-Moreno, Víctor de Lorenzo
Publié dans: mBio, Numéro 12/1, 2021, ISSN 2150-7511
Éditeur: ASM Journals
DOI: 10.1128/mbio.03685-20

Biotransformation of d ‐xylose to d ‐xylonate coupled to medium‐chain‐length polyhydroxyalkanoate production in cellobiose‐grown Pseudomonas putida EM42 (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Pavel Dvořák, Jozef Kováč, Víctor Lorenzo
Publié dans: Microbial Biotechnology, Numéro 13/4, 2020, Page(s) 1273-1283, ISSN 1751-7915
Éditeur: Wiley_Society for applied microbiology
DOI: 10.1111/1751-7915.13574

The wasted chewing gum bacteriome (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Leila Satari, Alba Guillén, Àngela Vidal-Verdú, Manuel Porcar
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 10/1, 2020, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-020-73913-4

Linking Engineered Cells to Their Digital Twins: A Version Control System for Strain Engineering (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Jonathan Tellechea-Luzardo, Charles Winterhalter, Paweł Widera, Jerzy Kozyra, Víctor de Lorenzo, Natalio Krasnogor
Publié dans: ACS Synthetic Biology, Numéro 9/3, 2020, Page(s) 536-545, ISSN 2161-5063
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.9b00400

Engineering and standardization of posttranscriptional biocircuitry in Saccharomyces cerevisiae (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: John McCarthy
Publié dans: Integrative Biology, Numéro 13/8, 2021, Page(s) 210-220, ISSN 1757-9708
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/intbio/zyab013

High-Efficiency Multi-site Genomic Editing of Pseudomonas putida through Thermoinducible ssDNA Recombineering (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Tomas Aparicio, Akos Nyerges, Esteban Martínez-García, Víctor de Lorenzo
Publié dans: iScience, Numéro 23/3, 2020, Page(s) 100946, ISSN 2589-0042
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.isci.2020.100946

Chemically Stressed Bacterial Communities in Anaerobic Digesters Exhibit Resilience and Ecological Flexibility (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Benjamin Schwan, Christian Abendroth, Adriel Latorre-Pérez, Manuel Porcar, Cristina Vilanova, Christina Dornack
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 11, 2020, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2020.00867

An automated DIY framework for experimental evolution of Pseudomonas putida (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: David R. Espeso, Pavel Dvořák, Tomás Aparicio, Víctor Lorenzo
Publié dans: Microbial Biotechnology, 2020, ISSN 1751-7915
Éditeur: John Wiley & Sons
DOI: 10.1111/1751-7915.13678

The Wsp intermembrane complex mediates metabolic control of the swim‐attach decision of Pseudomonas putida (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Ángeles Hueso‐Gil, Belén Calles, Víctor Lorenzo
Publié dans: Environmental Microbiology, Numéro 22/8, 2020, Page(s) 3535-3547, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.15126

Robust estimation of bacterial cell count from optical density (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Jacob Beal, Natalie G. Farny, Traci Haddock-Angelli, Vinoo Selvarajah, Geoff S. Baldwin, Russell Buckley-Taylor, Markus Gershater, Daisuke Kiga, John Marken, Vishal Sanchania, Abigail Sison, Christopher T. Workman
Publié dans: Communications Biology, Numéro 3/1, 2020, ISSN 2399-3642
Éditeur: Springer Nature Limited
DOI: 10.1038/s42003-020-01127-5

Environmental Performance of Pseudomonas putida with a Uracylated Genome (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Elena Algar, Yamal Al‐Ramahi, Víctor Lorenzo, Esteban Martínez‐García
Publié dans: ChemBioChem, Numéro 21/22, 2020, Page(s) 3255-3265, ISSN 1439-4227
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202000330

Y la biología se convirtió en ingeniería: La adopción de estándares para sistemas vivos (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Victor De Lorenzo
Publié dans: Mètode Revista de difusió de la investigació, Numéro 11, 2020, Page(s) 67-73, ISSN 2174-9221
Éditeur: University of Valencia
DOI: 10.7203/metode.11.15975

Draft Genome Sequence of a New Oscillospiraceae Bacterium Isolated from Anaerobic Digestion of Biomass (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Javier Pascual, Sarah Hahnke, Christian Abendroth, Thomas Langer, Patrice Ramm, Michael Klocke, Olaf Luschnig, Manuel Porcar
Publié dans: Microbiology Resource Announcements, Numéro 9/27, 2020, ISSN 2576-098X
Éditeur: AMS Journals
DOI: 10.1128/mra.00507-20

Towards the right standards: The intersection of open science, responsible research and innovation, and standards (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Michele S. Garfinkel
Publié dans: Mètode Revista de difusió de la investigació, Numéro 11, 2020, Page(s) 99-103, ISSN 2174-9221
Éditeur: University of Valencia
DOI: 10.7203/metode.11.16103

Can life be standardized? Current challenges in biological standardization (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Juli Peretó, Manuel Porcar
Publié dans: Mètode Revista de difusió de la investigació, Numéro 11, 2020, ISSN 2174-9221
Éditeur: University of Valencia
DOI: 10.7203/metode.11.15981

Low CyaA expression and anti‐cooperative binding of cAMP to CRP frames the scope of the cognate regulon of Pseudomonas putida (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Alejandro Arce‐Rodríguez, Pablo I. Nikel, Belén Calles, Max Chavarría, Raúl Platero, Tino Krell, Victor Lorenzo
Publié dans: Environmental Microbiology, Numéro 23/3, 2021, Page(s) 1732-1749, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.15422

For the sake of the Bioeconomy: define what a Synthetic Biology Chassis is! (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Víctor de Lorenzo, Natalio Krasnogor, Markus Schmidt
Publié dans: New Biotechnology, Numéro 60, 2021, Page(s) 44-51, ISSN 1871-6784
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nbt.2020.08.004

How To Quantify a Genetic Firewall? A Polarity‐Based Metric for Genetic Code Engineering (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Markus Schmidt, Vladimir Kubyshkin
Publié dans: ChemBioChem, 2020, ISSN 1439-4227
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202000758

Vida fabricada (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Manuel Porcar, Juli Peretó
Publié dans: Mètode Revista de difusió de la investigació, Numéro 10, 2019, ISSN 2174-9221
Éditeur: Mètode Sciences Journal- University of Valencia
DOI: 10.7203/metode.10.13229

Words, images and gender (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Manuel Porcar, Adriel Latorre‐Pérez, Esther Molina‐Menor, Martí Domínguez
Publié dans: EMBO reports, Numéro 20/7, 2019, ISSN 1469-221X
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.201948401

Microbial communities of the Mediterranean rocky shore: ecology and biotechnological potential of the sea‐land transition (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Esther Molina‐Menor, Kristie Tanner, Àngela Vidal‐Verdú, Juli Peretó, Manuel Porcar
Publié dans: Microbial Biotechnology, Numéro September 2019, 2019, ISSN 1751-7915
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1111/1751-7915.13475

Pathways to cellular supremacy in biocomputing (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Lewis Grozinger, Martyn Amos, Thomas E. Gorochowski, Pablo Carbonell, Diego A. Oyarzún, Ruud Stoof, Harold Fellermann, Paolo Zuliani, Huseyin Tas, Angel Goñi-Moreno
Publié dans: Nature Communications, Numéro 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-13232-z

The rose and the name: the unresolved debate on biotechnological terms (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Martí Domínguez, Juli Peretó, Manuel Porcar
Publié dans: Microbial Biotechnology, 2019, ISSN 1751-7915
Éditeur: society for applied microbiology
DOI: 10.1111/1751-7915.13522

Creating life and the media: translations and echoes (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Manuel Porcar, Juli Peretó
Publié dans: Life Sciences, Society and Policy, Numéro 14/1, 2018, ISSN 2195-7819
Éditeur: BMC - Springer Nature
DOI: 10.1186/s40504-018-0087-9

Complete Genome Sequence of a New Bacteroidaceae Bacterium Isolated from Anaerobic Biomass Digestion (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Sarah Hahnke, Christian Abendroth, Javier Pascual, Thomas Langer, Francisco M. Codoñer, Patrice Ramm, Michael Klocke, Olaf Luschnig, Manuel Porcar
Publié dans: Microbiology Resource Announcements, Numéro 8/46, 2019, ISSN 2576-098X
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mra.01203-19

Synthetic microbiology as a source of new enterprises and job creation: a Mediterranean perspective (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Cristina Vilanova, Manuel Porcar
Publié dans: Microbial Biotechnology, Numéro 12/1, 2019, Page(s) 8-10, ISSN 1751-7915
Éditeur: Society for Applied Microbiology
DOI: 10.1111/1751-7915.13326

The Hidden Charm of Life (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Manuel Porcar
Publié dans: Life, Numéro 9/1, 2019, Page(s) 5, ISSN 2075-1729
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/life9010005

ShortBOL: A Language for Scripting Designs for Engineered Biological Systems Using Synthetic Biology Open Language (SBOL) (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Matthew Crowther, Lewis Grozinger, Matthew Pocock, Christopher P. D. Taylor, James A. McLaughlin, Göksel Mısırlı, Bryan A. Bartley, Jacob Beal, Angel Goñi-Moreno, Anil Wipat
Publié dans: ACS Synthetic Biology, 2020, ISSN 2161-5063
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.9b00470

Modulating transcription through development of semi-synthetic yeast core promoters (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Thomas Decoene, Sofie L. De Maeseneire, Marjan De Mey
Publié dans: PLOS ONE, Numéro 14/11, 2019, Page(s) e0224476, ISSN 1932-6203
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0224476

A Model for the Spatiotemporal Design of Gene Regulatory Circuits (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Ruud Stoof, Alexander Wood, Ángel Goñi-Moreno
Publié dans: ACS Synthetic Biology, Numéro 8/9, 2019, Page(s) 2007-2016, ISSN 2161-5063
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.9b00022

Dynamical Task Switching in Cellular Computers (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Angel Goñi-Moreno, Fernando de la Cruz, Alfonso Rodríguez-Patón, Martyn Amos
Publié dans: Life, Numéro 9/1, 2019, Page(s) 14, ISSN 2075-1729
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/life9010014

SBOL-OWL: An Ontological Approach for Formal and Semantic Representation of Synthetic Biology Information (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Göksel Mısırlı, Renee Taylor, Angel Goñi-Moreno, James Alastair McLaughlin, Chris Myers, John H. Gennari, Phillip Lord, Anil Wipat
Publié dans: ACS Synthetic Biology, Numéro 8/7, 2019, Page(s) 1498-1514, ISSN 2161-5063
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.8b00532

Design and Control of Extrachromosomal Elements in Methylorubrum extorquens AM1 (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Martina Carrillo, Marcel Wagner, Florian Petit, Amelie Dransfeld, Anke Becker, Tobias J. Erb
Publié dans: ACS Synthetic Biology, Numéro 8/11, 2019, Page(s) 2451-2456, ISSN 2161-5063
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.9b00220

Sphingomonas solaris sp. nov., isolated from a solar panel in Boston, Massachusetts (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Kristie Tanner, Christopher P. Mancuso, Juli Peretó, Ahmad S. Khalil, Cristina Vilanova, Javier Pascual
Publié dans: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Numéro 70/3, 2020, Page(s) 1814-1821, ISSN 1466-5026
Éditeur: Society for General Microbiology
DOI: 10.1099/ijsem.0.003977

SEVA 3.0: an update of the Standard European Vector Architecture for enabling portability of genetic constructs among diverse bacterial hosts (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Esteban Martínez-García, Angel Goñi-Moreno, Bryan Bartley, James McLaughlin, Lucas Sánchez-Sampedro, Héctor Pascual del Pozo, Clara Prieto Hernández, Ada Serena Marletta, Davide De Lucrezia, Guzmán Sánchez-Fernández, Sofía Fraile, Víctor de Lorenzo
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 48/D1, 2019, Page(s) D1164-D1170, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkz1024

Multiple-site diversification of regulatory sequences enables inter-species operability of genetic devices (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Hueso-Gil, Ángeles, Nyerges, Ákos, Pál, Csaba, Calles, Belén, de Lorenzo, Víctor
Publié dans: ACS Synthetic Biology, Numéro December 3, 2019, 2019, Page(s) 104–114, ISSN 2161-5063
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.9b00375

Digitalizing heterologous gene expression in Gram‐negative bacteria with a portable ON/OFF module (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Belén Calles, Ángel Goñi‐Moreno, Víctor Lorenzo
Publié dans: Molecular Systems Biology, Numéro 15/12, 2019, ISSN 1744-4292
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/msb.20188777

Mismatch repair hierarchy of Pseudomonas putida revealed by mutagenic ssDNA recombineering of the pyrF gene (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Tomas Aparicio, Akos Nyerges, István Nagy, Csaba Pal, Esteban Martínez‐García, Víctor Lorenzo
Publié dans: Environmental Microbiology, Numéro 22/1, 2019, Page(s) 45-58, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.14814

Recombination independent genome editing through CRISPR/Cas9-enhanced targetron delivery (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Elena Velázquez, Víctor de Lorenzo,Yamal Al-Ramahi
Publié dans: ACS Synthetic Biology, Numéro August 16, 2019, 2019, Page(s) 2186–2193, ISSN 2161-5063
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.9b00293

Functional implementation of a linear glycolysis for sugar catabolism in Pseudomonas putida (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Alberto Sánchez-Pascuala, Lorena Fernández-Cabezón, Víctor de Lorenzo, Pablo I. Nikel
Publié dans: Metabolic Engineering, Numéro 54, 2019, Page(s) 200-211, ISSN 1096-7176
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ymben.2019.04.005

Pseudomonas putida in the quest of programmable chemistry (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Esteban Martínez-García, Víctor de Lorenzo
Publié dans: Current Opinion in Biotechnology, Numéro 59, 2019, Page(s) 111-121, ISSN 0958-1669
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.copbio.2019.03.012

Engineering Tropism of Pseudomonas putida toward Target Surfaces through Ectopic Display of Recombinant Nanobodies (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Sofía Fraile, María Briones, Mónica Revenga-Parra, Víctor de Lorenzo, Encarnación Lorenzo, Esteban Martínez-García
Publié dans: ACS Synthetic Biology, Numéro 10/8, 2021, Page(s) 2049-2059, ISSN 2161-5063
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acssynbio.1c00227

Standardisation and social ordering: A change of perspective (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Pablo Schyfter
Publié dans: Mètode Revista de difusió de la investigació, Numéro 11, 2020, ISSN 2174-9221
Éditeur: University of Valencia
DOI: 10.7203/metode.11.16013

Extremophilic microbial communities on photovoltaic panel surfaces: a two‐year study (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Kristie Tanner, Esther Molina‐Menor, Adriel Latorre‐Pérez, Àngela Vidal‐Verdú, Cristina Vilanova, Juli Peretó, Manuel Porcar
Publié dans: Microbial Biotechnology, Numéro 13/6, 2020, Page(s) 1819-1830, ISSN 1751-7915
Éditeur: John Wiley & Sons
DOI: 10.1111/1751-7915.13620

The faulty SOS response of Pseudomonas putida KT2440 stems from an inefficient RecA‐LexA interplay (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Özlem Akkaya, Tomás Aparicio, Danilo Pérez‐Pantoja, Víctor Lorenzo
Publié dans: Environmental Microbiology, Numéro 23/3, 2021, Page(s) 1608-1619, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.15384

Contextual dependencies expand the re-usability of genetic inverters (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Huseyin Tas, Lewis Grozinger, Ruud Stoof, Victor de Lorenzo, Ángel Goñi-Moreno
Publié dans: Nature Communications, Numéro 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-20656-5

DNA-BOT: a low-cost, automated DNA assembly platform for synthetic biology (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Marko Storch, Matthew C Haines, Geoff S Baldwin
Publié dans: Synthetic Biology, Numéro 5/1, 2020, ISSN 2397-7000
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/synbio/ysaa010

An updated structural model of the A domain of the Pseudomonas putida   XylR  regulator poses an atypical interplay with aromatic effectors (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Pavel Dvořák, Carlos Alvarez‐Carreño, Sergio Ciordia, Alberto Paradela, Víctor Lorenzo
Publié dans: Environmental Microbiology, Numéro 23/8, 2021, Page(s) 4418-4433, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.15628

A SsrA/NIa-based Strategy for Post-Translational Regulation of Protein Levels in Gram-negative Bacteria (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Gonzalo Durante-Rodríguez, Belén Calles, Víctor Lorenzo, Pablo Nikel
Publié dans: BIO-PROTOCOL, Numéro 10/14, 2020, ISSN 2331-8325
Éditeur: Bio-protocol
DOI: 10.21769/bioprotoc.3688

Reconfiguration of metabolic fluxes in Pseudomonas putida as a response to sub-lethal oxidative stress (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Pablo I. Nikel, Tobias Fuhrer, Max Chavarría, Alberto Sánchez-Pascuala, Uwe Sauer, Víctor de Lorenzo
Publié dans: The ISME Journal, Numéro 15/6, 2021, Page(s) 1751-1766, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-020-00884-9

Future‐proofing synthetic biology: educating the next generation (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Jennifer S. Hallinan, Anil Wipat, Richard Kitney, Simon Woods, Ken Taylor, Angel Goñi‐Moreno
Publié dans: Engineering Biology, Numéro 3/2, 2019, Page(s) 25-31, ISSN 2398-6182
Éditeur: John Wiley & Sons
DOI: 10.1049/enb.2019.0001

A Broad Host Range Plasmid-Based Roadmap for ssDNA-Based Recombineering in Gram-Negative Bacteria (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)

Auteurs: Tomás Aparicio, Víctor de Lorenzo, Esteban Martínez-García
Publié dans: Horizontal Gene Transfer - Methods and Protocols, Numéro 2075, 2020, Page(s) 383-398, ISBN 978-1-4939-9876-0
Éditeur: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-4939-9877-7_27

Recherche de données OpenAIRE...

Une erreur s’est produite lors de la recherche de données OpenAIRE

Aucun résultat disponible

Mon livret 0 0