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VIrTual BrAin PErfusion: Assessing cerebrovascular function by High Performance Computing from 3D brain vessel network data for vascular-targeted drug development in neurodegenerative diseases.

Description du projet

Modéliser le système vasculaire dans la maladie d’Alzheimer

La maladie d’Alzheimer est une forme de démence qui se caractérise par un dysfonctionnement documenté de plusieurs types de cellules neuronales et un déclin cognitif. De récentes données soulignent le rôle du système vasculaire dans la physiopathologie de la maladie avant que la neurodégénérescence ne puisse être observée. Le projet VITAE, financé par l’UE, entend modéliser le système vasculaire du cerveau et, en particulier, les processus biologiques de la circulation sanguine, le transport des nutriments et l’élimination des déchets métaboliques dans le contexte de la maladie d’Alzheimer. Le logiciel pourrait être proposé comme un service et devrait ouvrir la voie au développement de nouvelles interventions qui ciblent les voies vasculaires à des stades précoces de la maladie.

Objectif

With the recent discovery that brain blood flow decreases — in a statistical and epidemiologic sense — before accumulation of neurotoxic deposits (e.g. amyloid and tau) and before any measurable cognitive deficits, the brain vascular system is increasingly recognized as a key player in the development of Alzheimer’s Disease (AD). This opens the way for the development of new disease-modifying therapeutic strategies targeting vascular pathways at early stages of AD, i.e. long before the neurodegenerative process becomes established and symptomatic. The central idea of this POC proposal is that High Performance Computing (HPC) assessment of cerebrovascular function from quantitative vessel network data will tremendously accelerate vascular-targeted drug development for neurodegenerative brain diseases. One of the key outputs of the research conduced in the ERC Consolidator BrainMicroFlow is indeed a HPC platform for modeling blood flow, nutrient delivery and metabolic waste removal in large anatomical vessel networks of the brain. However, using this platform requires advanced and specific parallel programing skills, which are in general not available, neither in the research nor in the R&D industrial environments focused on Alzheimer Disease. Thus, our aims are 1/ to upgrade the technical specifications of this platform and to develop a user-friendly and versatile interface, documentation and support, to create a new software, called VITAE, meeting the industry standards, that users with minimal programming skills could use on their own or local computational resources; 2/ to optimize the HPC capacities of VITAE so that its performances can reach the scale of a whole mouse brain (VITAE4WholeBrain), that could be accessed as a service provided to end users by partnering computational centers; 3/ to assess the market and the competitors for both versions of VITAE; 4/ to determine IPR position and strategy, and 5/ to explore licensing and partnership possibilities.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Régime de financement

ERC-POC - Proof of Concept Grant

Institution d’accueil

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Contribution nette de l'UE
€ 137 238,00
Coût total
€ 149 738,00

Bénéficiaires (2)