Description du projet
Les ciseaux et les pinces pourraient bientôt diriger l’ensemble de méthodes avancées de séquençage de l’ADN
L’ADN fait l’objet de nombreux changements biophysiques et biochimiques, afin de moduler l’expression génétique. Ces modifications épigénétiques n’altèrent pas la séquence ADN, mais peuvent influencer sa «lecture». La méthylation (ajout de CH3) en est un exemple fréquent, car elle empêche la transcription et l’expression génétique. Même si la chimie de synthèse et les techniques de séquençage de l’ADN ont énormément évolué, elles ne parviennent pas à conserver des informations épigénétiques précieuses et essentielles. Le projet EpiSeq, financé par l’UE, utilise des «couteaux moléculaires» de haute technologie (technologie CRISPR/Cas9) pour découper la petite séquence d’intérêt de l’ADN et des pinces magnétiques pour manipuler la molécule et déterminer sa séquence épigénétique. Les connaissances sur ces changements épigénétiques serviront aux études sur la manière dont les modifications de l’expression génétique provoquent certaines maladies, ayant des implications pour l’amélioration du diagnostic et du traitement.
Objectif
Next-generation DNA sequencing technologies are at the core of modern molecular biology and are rapidly entering the technological arsenal for personalized medicine. The recent explosion of sequencing technologies has provided researchers with various solutions to fit their sequencing needs, with a large spectrum of costs and limitations. However, most sequencing methods use enzymatic duplication of DNA to generate a strong enough sequencing signal. Therefore, chemical modifications potentially present on native bases are lost, and with them, an entire level of epigenetic information about. Although some workarounds are emerging, they are indirect, costly, and not yet amenable for the targeted sequencing of a given native genomic locus or biophysical analysis of the modified DNA. Given the need to understand the epigenetic layer of genetic information, I propose to develop a reliable and cheap method to map, at the single-molecule resolution, the epigenetic status of a genomic DNA locus of interest. This will be achieved through biochemical capture of this locus using CRISPR/Cas9 technology, and its epigenetic sequencing via single-molecule manipulation by magnetic tweezers. In addition to identifying the nature and the position of the modified bases at a given genomic DNA locus, I will use this magnetic tweezer technology to address fundamental questions about the effect of epigenetic modifications on the biophysical properties of DNA (formation of DNA structures and protein interactions). Specifically, I will focus on 8-oxoguanine, for which there is increasing interest since it is a hallmark of degenerative pathologies like cancer or Alzheimer’s Disease, and since it has recently entered the known epigenetic arsenal. This project has great potential applications in medical diagnosis. It will give me a first-hand experience in developing a cutting-edge technology, which will be of great benefit to my future independent research career.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale neurologie démence alzheimer
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pathologie
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé médecine personnalisée
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Nous sommes désolés... Une erreur inattendue s’est produite.
Vous devez être authentifié. Votre session a peut-être expiré.
Merci pour votre retour d'information. Vous recevrez bientôt un courriel confirmant la soumission. Si vous avez choisi d'être informé de l'état de la déclaration, vous serez également contacté lorsque celui-ci évoluera.
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panel
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2018
Voir tous les projets financés au titre de cet appelCoordinateur
La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75005 Paris
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.