Opis projektu
Dzięki nożycom i szczypcom być może niedługo powstaną zaawansowane metody sekwencjonowania DNA
DNA ulega licznym zmianom biochemicznym i biofizycznym w celu modulacji ekspresji genów. Te modyfikacje epigenetyczne nie zmieniają sekwencji DNA, ale wpływają na jej odczytywanie. Powszechnym przykładem jest metylacja (dodanie grupy -CH3), która hamuje transkrypcję i ekspresję danego genu. Chociaż techniki syntezy chemicznej i sekwencjonowania DNA znacznie się polepszyły, nie zachowują one kluczowych informacji epigenetycznych. Projekt EpiSeq, finansowany z funduszy UE wykorzystuje zaawansowane „nożyce molekularne” (metoda CRISPR/Cas9) do wycinania niewielkich, określonych sekwencji DNA oraz magnetycznych szczypców do manipulacji cząsteczki i określenia jej sekwencji. Dzięki informacjom dotyczącym zmian epigenetycznych naukowcy dowiedzą się, jak zmiany ekspresji genów wywołują niektóre choroby, co w efekcie przyczyni się do poprawy ich diagnostyki i leczenia.
Cel
Next-generation DNA sequencing technologies are at the core of modern molecular biology and are rapidly entering the technological arsenal for personalized medicine. The recent explosion of sequencing technologies has provided researchers with various solutions to fit their sequencing needs, with a large spectrum of costs and limitations. However, most sequencing methods use enzymatic duplication of DNA to generate a strong enough sequencing signal. Therefore, chemical modifications potentially present on native bases are lost, and with them, an entire level of epigenetic information about. Although some workarounds are emerging, they are indirect, costly, and not yet amenable for the targeted sequencing of a given native genomic locus or biophysical analysis of the modified DNA. Given the need to understand the epigenetic layer of genetic information, I propose to develop a reliable and cheap method to map, at the single-molecule resolution, the epigenetic status of a genomic DNA locus of interest. This will be achieved through biochemical capture of this locus using CRISPR/Cas9 technology, and its epigenetic sequencing via single-molecule manipulation by magnetic tweezers. In addition to identifying the nature and the position of the modified bases at a given genomic DNA locus, I will use this magnetic tweezer technology to address fundamental questions about the effect of epigenetic modifications on the biophysical properties of DNA (formation of DNA structures and protein interactions). Specifically, I will focus on 8-oxoguanine, for which there is increasing interest since it is a hallmark of degenerative pathologies like cancer or Alzheimer’s Disease, and since it has recently entered the known epigenetic arsenal. This project has great potential applications in medical diagnosis. It will give me a first-hand experience in developing a cutting-edge technology, which will be of great benefit to my future independent research career.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna neurologia demencja choroba Alzheimera
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna patologia
- medycyna i nauki o zdrowiu nauki o zdrowiu medycyna spersonalizowana
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biologia molekularna
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panel
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2018
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
75005 Paris
Francja
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.