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Using population genomics and metabarcoding to pro-actively manage kelp bioresources

Description du projet

Explorer la génétique des forêts de kelp norvégiennes

Le kelp, un groupe d’algues brunes formant de grandes forêts sous‑marines le long des littoraux rocheux, est synonyme de grandes opportunités commerciales en Norvège. Le pays est doté d’un long littoral accompagné de conditions parfaites pour la culture du kelp, mais les forêts de kelp sont vulnérables au changement climatique, à la surpêche et à l’encrassement biologique causé par les épiphytes. Le projet NorKHelp, financé par l’UE, aidera à combler les lacunes en matière de recherche. Basé à l’Institut norvégien de la recherche marine, il quantifiera le flux génétique entre les populations des forêts de kelp des espèces Saccharina latissima. La structure de la communauté de l’algue et des bactéries épiphytes sera décrite afin de déterminer si le génotype hôte ou l’environnement détermine leur composition. Ce projet intègrera l’écologie de la communauté et la génomique des populations à une approche écosystémique pour enquêter sur la complexité des interactions.

Objectif

Kelp forests are known globally as hotspots for macroscopic biodiversity. Norway has Europe’s largest population of kelp having a long tradition of exploiting wild populations of this natural resource. There is currently a lot of interest in the species, Saccharina latissima, to develop Norway’s kelp industry through large scale cultivation at sea. Kelp forests are however vulnerable to climate change, overharvesting and biofouling by epiphytes. Due to the importance of kelp to Norway’s bioeconomy, it is vital to fill current research gaps in relation to kelp forest ecosystems in order to use the resource sustainably. Bacterial and epiphytic algal communities have been shown to be important for the fitness of kelp hosts, with certain epiphytes improving fitness and others leading to a complete loss of biomass within populations. This study, that I will implement at the Institute of Marine Research (NO), will quantify the gene flow between populations of kelp forests of S. latissima. The community structure of epiphytic algae and bacteria will be described to determine if the host genotype or the environment determines their composition. Finally, the key taxa associated with environmental change that could be used as bioindicators to proactively monitor kelp populations and cultivation sites will be established. This interdisciplinary project integrates community ecology and population genomics with an ecosystems approach to investigate the complexity of interactions occurring between the different organisms in the kelp forest habitat. The personal goal of this fellowship is to gain in-depth training in the techniques required to study population genomics linked to microbiomes, which are increasingly being shown to play pivotal roles in the shaping and functioning of populations. The host is a leading institution for marine research and provides a unique training environment where academia works directly with the concerned industries and policy makers.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Coordinateur

HAVFORSKNINGSINSTITUTTET
Contribution nette de l'UE
€ 202 158,72