The missing link: how do membrane lipids interplay with ATG proteins to instruct plant autophagy

Informations projet

LIP-ATG

N° de convention de subvention: 852136

DOI

10.3030/852136

Projet clôturé

Date de signature de la CE 25 Octobre 2019

Date de début 1 Février 2020

Date de fin 31 Janvier 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 499 880,00

Contribution de l’UE

€ 1 499 880,00

Coordonné par

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

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Publications

Other (4)

Unveiling the molecular identity of plant autophagic compartments: A proteo-lipidomic study in <i>Arabidopsis thaliana</i>

Auteurs: Josselin Lupette, Clément Chambaud, Matthieu Buridan, Julie Castets, Valérie Wattelet-Boyer, Inés Toboso Moreno, Thibault Kosuth, Céline Yatim, Franziska Dittrich-Domergue, Valérie Gros, Juliette Jouhet, Stéphane Claverol, Charlotte Héricé, Su Melser, Manon Genva, Laetitia Fouillen, Jean-Jacques Bessoule, Frédéric Domergue, Amélie Bernard
Publié dans: bioxriv, 2026
Éditeur: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.08.25.671700

A dual component system instructs membrane hydrolysis during the final stages of plant autophagy

Auteurs: Julie Castets, Matthieu Buridan, Inés Toboso Moreno, Víctor Sánchez de Medina Hernández, Rodrigo Enrique Gomez, Franziska Dittrich-Domergue, Josselin Lupette, Clément Chambaud, Stephanie Pascal, Tarhan Ibrahim, Tolga O. Bozkurt, Yasin Dagdas, Frederic Domergue, Jérôme Joubès, Elena A. Minina, Amélie Bernard
Publié dans: BioxRiv, 2026
Éditeur: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.08.01.668046

AtVPS13M1 is involved in lipid remodeling in low phosphate and is located at the mitochondria surface in plants

Auteurs: Sébastien Leterme, Catherine Albrieux, Sabine Brugière, Yohann Couté, Julien Dellinger, Benjamin Gillet, Sandrine Hughes, Julie Castet, Amélie Bernard, David Scheuring, Marion Schilling, Juliette Jouhet, Morgane Michaud
Publié dans: 2026
Éditeur: openRxiv
DOI: 10.1101/2024.05.22.594332

Clathrin-coated vesicles are targeted for selective autophagy during osmotic stress

Auteurs: Jonathan Michael Dragwidge, Matthieu Buridan, Julia Kraus, Thibault Kosuth, Clément Chambaud, Lysiane Brocard, Klaas Yperman, Evelien Mylle, Michaël Vandorpe, Dominique Eeckhout, Geert De Jaeger, Roman Pleskot, Amelie Bernard, Daniël Van Damme
Publié dans: bioxriv, 2026
Éditeur: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.09.16.676479

Peer reviewed articles (5)

HOPping to the vacuole: Autophagosome and late endosomes combine to control plant autophagosome degradation

Auteurs: Jonathan Dragwidge, Amélie Bernard
Publié dans: Developmental Cell, Numéro 59, 2025, Page(s) 2273-2274, ISSN 1534-5807
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2024.08.005

Biomolecular condensation orchestrates clathrin-mediated endocytosis in plants

Auteurs: Jonathan Michael Dragwidge, Yanning Wang, Lysiane Brocard, Andreas De Meyer, Roman Hudeček, Dominique Eeckhout, Peter Grones, Matthieu Buridan, Clément Chambaud, Přemysl Pejchar, Martin Potocký, Joanna Winkler, Michaël Vandorpe, Nelson Serre, Matyáš Fendrych, Amelie Bernard, Geert De Jaeger, Roman Pleskot, Xiaofeng Fang, Daniël Van Damme
Publié dans: Nature Cell Biology, Numéro 26, 2024, Page(s) 438-449, ISSN 1465-7392
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-024-01354-6

Targeting Ultrastructural Events at the Graft Interface of Arabidopsis thaliana by A Correlative Light Electron Microscopy Approach

Auteurs: Clément Chambaud, Sarah J. Cookson, Nathalie Ollat, Amélie Bernard, Lysiane Brocard
Publié dans: bio-protocol, 2023, ISSN 2331-8325
Éditeur: Bio-protocol LLC
DOI: 10.21769/bioprotoc.4590

Phosphatidylinositol-4-phosphate controls autophagosome formation in Arabidopsis thaliana

Auteurs: Rodrigo Enrique Gomez, Clément Chambaud, Josselin Lupette, Julie Castets, Stéphanie Pascal, Lysiane Brocard, Lise Noack, Yvon Jaillais, Jérôme Joubès and Amélie Bernard
Publié dans: Nature communications, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-32109-2

How Lipids Contribute to Autophagosome Biogenesis, a Critical Process in Plant Responses to Stresses

Auteurs: Rodrigo Enrique Gomez, Josselin Lupette, Clément Chambaud, Julie Castets, Amélie Ducloy, Jean-Luc Cacas, Céline Masclaux-Daubresse, Amélie Bernard
Publié dans: Cells, Numéro 10/6, 2021, Page(s) 1272, ISSN 2073-4409
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/cells10061272

Non-peer reviewed articles (1)

Phosphatidylinositol-4-phosphate joins the dance of plant autophagosome formation

Auteurs: Rodrigo Enrique Gomez; Julie Castets; Josselin Lupette; Clément Chambaud; Jérôme Joubès; Amélie Bernard
Publié dans: Crossref, Numéro 1, 2022, ISSN 1554-8635
Éditeur: Taylor & Francis
DOI: 10.1080/15548627.2022.2132042